2A1 Oncologie Flashcards
Wat is de functie van de niche (plek waar hematopoietische stamcellen liggen)?
- Regulatie van de stamceleigenschappen
- Bescherming tegen toxische invloeden
Wat zijn transitie en transversie?
Transitie:
purine naar purine of pyrimidine naar pyrimidine.
Transversie:
purine naar pyrimidine of andersom
Purine: A & G
Pyrimidine: T & C
Wat zijn kleine en wat zijn grote adducten?
Kleine adducten (verstoren dubbele helix niet): spontane hydrolyse, deaminatie, oxidatieve DNA-schade (ssDNA breuken)
Grote adducten: BPDE, CPD, 6-4 fotoproduct
BER vs. NER
BER: herstel van kleine adducten; enkel basenpaar
NER: herstel van grote adducten; stuk DNA
KR: Wanneer denken aan kanker?
- Ongewoon of langer beloop van ‘onschuldige’ aandoeningen
- Aanwezigheid van:
> (Ziektespecifieke) alarmsymptomen
> Risicofactoren
Wat doen PARP-remmers?
Remmen PARP en remmen zo BER.
PARP maakt reparatie van enkelstrengs breuken efficiënter.
DNA-reparatiemechanismen
Enkelstrengs breuk:
- BER
- NER
Dubbelstrengs breuk:
- NHEJ
- HR
(- TMEJ)
MMR: fouten bij DNA-replicatie
Wat doen BRCA1 en BRCA2 eiwitten?
Bij HR: zijn nodig om RAD51 naar dubbelstrengs breuk te brengen.
Bij een BRCA-mutatie is er dus een HR-defect.
Surveillance (screening) adviezen bij Lynch syndroom
Vanaf 25 jaar 1x per 2 jaar colonoscopie
Bij vrouwen van 40-60 ook gynaecologische controle (endometriumcarcinoom)
Met welke testen kun je onderzoeken of er sprake is van Lynch syndroom?
- Immunohistochemisch onderzoek naar MMR (mismatch repair)
- Moleculair MSI (microsattelite instability) onderzoek
Wat is het lifetime risk op CRC bij Lynch syndroom?
Tot 70% (55% endometriumcarcinoom)
3 mechanismen voor nauwkeurigheid van DNA-replicatie
1) Base selectie
2) Proofreading
3) Mismatch reparatie
Lynch syndroom
Mutatie in MLH1, PMS2, MSH2 of MSH6 –> defect MMR
Defect MMR leidt tot MSI.
BER stappen
- Schade-specifieke DNA glycosylase herkent en verwijdert de DNA-schade (de verkeerde base)
- Endonuclease verwijdert AP site (abasische plaats)
- DNA polymerase en ligase herstellen het stuk DNA
GG-NER stappen (tentamenvraag: volgorde)
- Herkenning DNA-beschadiging door XPC/RAD23B complex
- Ontwinden DNA door helicaseactiviteit XPD en XPB
- Aanbrengen enkelstrengs DNA-breuk door ERCC1/XPF complex
- Excisie enkelstrengs DNA-fragment met DNA-beschadiging door XPG
- DNA-synthese
- Ligatie
NHEJ vs. HR
NHEJ:
- Onnauwkeurig herstel
- Direct aan elkaar ligeren v/d 2 uiteinden v/e DNA-breuk
- Gebruikt geen template
- Kan altijd (in de celcyclus) plaatsvinden, want heeft geen zusterchromatide nodig
HR:
- Nauwkeurig herstel
- Uitwisseling van DNA-strengen tussen DNA-moleculen
- Gebruikt vnl. zusterchromatide als template
- Vindt alleen plaats in S- en G2-fase (tijdens/na replicatie)
Complementariteit
A <-> T: 2 H-bruggen (purines)
C <-> G: 3 H-bruggen (pyrimidines)
RNA: A –> U (U i.p.v. T)
VAF
Variant allel frequentie: aantal malen dat een variant op een specifieke positie gevonden is t.o.v. referentie (hoe vaak een andere nucleotide dan de normale is ingebouwd)
Afhankelijk van: gen & tumorcelpercentage
andere/(andere+normale)
Philadelphia chromsome
- Translocatie t(9;22)
- Veroorzaakt CML
- Fusiegen BCR-ABL: BCR ligt op chromosoom 22, ABL op 9
Imatinib/Glivec
Blokkeert functie van BCR-ABL eiwit
Behandeling CML
Tyrosine kinaseremmer (BCR-ABL eiwit is tyrosine kinase: fosforyleert target eiwit)
Past op plek waar ATP gaat zitten —> target eiwit kan niet meer gefosforyleerd worden —> signaal dat aanzet tot delen vindt niet meer plaats.
AML vs. CML
AML:
- Veel symptomen
- Onrijpe cellen (blasten)
CML:
- Weinig symptomen, algehele malaise, vergrote milt
- Te veel, maar functionele witte bloedcellen
- Philadelphia chromosome
Structurele en numerieke chromosomale afwijkingen
Structurele afwijkingen (ligt altijd dubbelstrengs DNA-breuk aan ten grondslag!):
- Deleties
- Translocaties
- Dicentrische chromosomen
Numerieke afwijkingen:
- Chromosoomverlies
- Chromosoomduplicatie
Aneuploidie
Aanwezigheid van abnormaal aantal (meer/minder) chromosomen in een cel
Defecten in het anafase checkpoint leiden tot aneuploidie.
Redioresistant DNA synthesis (RDS) fenotype
ATM kinase defect: celcyclus wordt bij DNA-schade niet gestopt