24

Question 1

primární struktura

Answer 1

lineární sekvence amk, konfigurace peptidové vazby (cis, trans)

Question 2

sekundární str.

Answer 2

beta skl list, alfa helix, vodíkové můstky

Question 3

terciární str

Answer 3

prostorové usp. celého polypeptidového řetězce
vodíkové mustky a jine interakce
globularni, filbrilární

Question 4

kvartérní str.

Answer 4

vzájemné prostorové uspořádání více řetězců (dimery, homodimery)

Question 5

denaturace

Answer 5

ztráta charakteristické nativní struktury, random coil

Question 6

jaké 4 kroky má proteosyntéza?

Answer 6

tvorba aminoacyl tRNA
iniciace
elongace
terminace

Question 7

tvorba aminoacyl tRNA

Answer 7

aminoacyl tRNA syntethasa, spotřeba ATP

nejdřív aminoacyl AMP, potom reakce s tRNA

Question 8

iniciace - co je zapotřebí, posloupnost reakcí, regulace

Answer 8

substráty: malá ribosomální podjednotka, iniciační tRNA nesoucí methionin a mRNA

1) na podjednotku se naváže tRNA a INICIAČNÍ FAKTOR (elF4E) - vznik preiniciačního komplexu
2) na iniciační faktor se naváže 5´čepička mRNA (rate limiting step) - vznikne iniciační komplex
3) spojení tRNA s iniciačním kodonem AUG, hydrolýza GTP, velká podjednotka, elongace

Question 9

elongace

Answer 9

v ribosomu sedí první tRNA na P místě

1) vznik elongačního komplexu: aminoacyl tRNA s elongačním faktorem 1 (štěpení GTP)
2) tRNA do A místa
3) PEPTIDYLTRANSFERÁZOVÁ reakce - amk z P místa se naváže na amk v A místě
4) EF 2 vykobne použitou tRNA z P místa, posune tam tu novější z A místa (štěpení GTP)

Question 10

terminace

Answer 10

po přečtení stopkodonu musí následovat správná sekvence
releasing factor 1 nasedne do A místa - hydrolytické oštěpení polypeptidu
ribosom se rozdpadá

Question 11

jak b. pozá že je protein pro export?

Answer 11

protein má na sobě signální sekvenci (targeting sequence).
tu rozpozná SRP, naváže se, putuje na GER
SRP se naváže na receptor SRP, odštěpí se GTP a protein jde dovnitř ER přes translokon.
signální peptidáza odštěpí zbyteček proteinu a translace dále probíhá v GER

Question 12

jaké znáš posttranslační modifikace?

Answer 12

vznik sekundární a terciární struktury (chaperony)
proteolytické modifikace (třeba štěpení insulinu)
chemické modifikace (glykosylace, hydroxylace, fosforylace…)

Question 13

jaké znáš typy glykosylace?

Answer 13

N-glykosylace: dolichol váže N-acetylglukosamin přes asparagin
O-glykosylace: sacharidy vázány přes OH skupinu amk

Question 14

jaké znáš proteázy?

Answer 14

seriové - trypsin
aspartátové - pepsin
metaloproteázy-kaboxypeptidázy
cysteinové- kaspázy

Question 15

jak se aktivují proteázy? jak se inhibují?

Answer 15

vyrobeny jako preproteiny, během aktivace je odštěpena inhibiční část (disociace inhibičního proteinu)
inhibice: např. antitrypsin - inhibice elastázy v plicích

Question 16

co je ubikvitin-proteazomový systém?

Answer 16

proces specifické degradace proteinů v buňce s využitím proteasomu

Question 17

jak se dělí glykoproteiny?

Answer 17

N glykoproteiny - glykosylace en block, nejdřív syntéza na dolicholu, vazba přes asparagin N-glykosidickou vazbou
O glykoproteiny - syntéza postupně, vazba na OH sk. threoninu nebo serinu, GA

Question 18

proces N-glykosylace?

Answer 18

syntéza sacharidu, aktivace nukleotidem UDP/GDP
translokace do lumen ER, tam vazba na dolichol a vznik korového polysacharidu
přenos na protein, další úpravy
terminální glykosylace určuje osud

Question 19

co patří pod O-glykoproteiny?

Answer 19

kolagen, muciny, proteoglykany

Question 20

muciny

Answer 20

velké množství sacharidů, základem je (N-ACETYLGALAKTOSAMIN) produkt sliznic

Question 21

funkce a struktura proteoglykanů

Answer 21

proteoglykanový agregáty spojený kys. hyaluronovou
agregát má osový protein a GAG
fce: odolnost proti tlaku, lubrikace kloubů a chrupavek, integrita tkáně, vážou vodu

Question 22

z čeho je GAG

Answer 22

glukosamin/galaktosamin a uronová kyselina

Question 23

funkce oligosacharidových řetězců v glykoproteinech

Answer 23

stabilizace a folding
značení proteinů pro specifické oblasti buňky
zvyšuje rozpustnost a stabilitu
určování antigenity buněk (aglutinogeny krevních skupin)

Question 24

co se děje při glykaci

Answer 24

navázání volných aldehydových skupin glukózy na volné aminoskupiny bílkovin
rychlost závisí na koncentraci glukozy
kondenzační reakce - Schiffova baze (vratné)
dlouho - přesmyk na amadoriho produkt, nevratné

Question 25

jak vznikne patologické konformace proteinu?

Answer 25

mutace
random chyba v procesu skládání
konformační změna

Question 26

jak se nazývá patologický agrégát proteinu se špatnou konformací?

Answer 26

amyloid

Question 27

co jsou priony?

Answer 27

proteiny s patologickou konformací, schopny dále propagovat konformační změny nativních proteinů na abnormální struktury, neurodegenerativní choroby