1.4-bio-ingénerie des protéines Flashcards

1
Q

c’est quoi le but de production de protéines recombinantes

A

produire des grandes qtés de protéines recombinantes à partir d’un gène cloné chez un organisme hôte

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2
Q

4 facteurs qui peuvent affecter la production de protéines recombinantes

A

1) transcription
2) traduction
3) stabilité de la protéine
4) sécrétion (de la protéine)

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3
Q

pourquoi une protéine humaine ne sera pas fonctionnelle chez le système bactérien d’E.coli

A

car elle ne peut pas subir des modifications post-traductionnelles pour la rendre fonctionnelle (seulement chez les eucaryotes)

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4
Q

que peut se passer avec le plasmide si on utilise un promoteur trop fort?

A

l’organisme va avoir besoin d’utiliser plus d’énergie pour produire la protéine donc diminution du taux de croissance ou même perte du plasmide pour compenser pour les dépenses d’énergie

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5
Q

quel type de promoteur est à favoriser et pourquoi

A

promoteur fort INDUCTIBLE (croissance d’E coli en premier et ensuite induction de la transcription chez l’E.coli qui a déjà poussé)

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6
Q

c’est quoi les 2 types de contrôles pour la régulation de la transcription

A

contrôle négatif et positif

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7
Q

c’est quoi le contrôle négatif pour la régulation de la transcription

A

la transcription se produit toujours sauf quand il y a la présence d’un répresseur

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8
Q

c’est quoi le contrôle positif pour la régulation de la transcription

A

la transcription peut seulement avoir lieu si une molécule activatrice est présente pour stimuler la transcription de l’ARNm

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9
Q

Donne un exemple d’un système de contrôle positif pour la transcription et comment il fonctionne

A

système avec l’opéron Lac parce qu’en présence de lactose/IPTG/x-gal, la transcription est activée. le lactose (ou analogue) va lier la molécule represseure et ainsi activer la transcription

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10
Q

3 façons d’augmenter l’efficacité de la traduction de la protéine recombinante

A

1) avoir un séquence de liaison au ribosome
2) optimiser les codons utilisés (modifier codon)
3) utiliser un plasmide d’ARNt rares

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11
Q

Comment les plasmides d’ARNt peuvent augmenter l’efficacité de la traduction d’une protéine recombinante (3)

A

1) ils optimisent la fréquence d’utilisation du codon rare (plasmide d’ARNt rare augmente la disponibilité de l’ARNt spécifique)
2) améliorent la vitesse de la traduction en fournissant des acides aminés nécessaires pour les codons rares
3) réduit les erreurs de traduction car on fournit l’ARNt rare nécessaire (améliore qualité de protéine)

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12
Q

2 façons d’améliorer la stabilité protéique

A

1) faciliter le repliement protéique
2) diminuer la dégradation protéique

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13
Q

2 manières de faciliter le repliement protéique

A

1) utiliser les basses températures
2) additionner les gènes qui codent pour les chaperons

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14
Q

2 manières de diminuer la dégradation protéique

A

1) ajouter les AA spécifiques à l’extrémité N-terminale pour diminuer la dégradation
2) exprimer une protéine de fusion

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15
Q

comment augmenter la sécrétion protéique de la protéine dans le périplasme

A

en ajoutant un peptide signal bactérien à l’extrémité N-terminale

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16
Q

2 avantages pour l’augmentation de la sécrétion protéique

A

1) purification facilitée pour la protéine
2) Réduction de la dégradation protéique

17
Q

Comment faciliter la purification de la protéine

A

en ajoutant un tag (étiquette) d’affinité

18
Q

comment enlever le tag d’affinité après la purification protéique

A

en ajoutant un site de clivage protéolytique par clonage

19
Q

donne 4 exemples de modifications post-traductionnels

A

1) méthylation
2) phosphorylation
3) acétylation
4) glycosylation

20
Q

7 composantes d’un vecteur d’expression eucaryotique et leurs rôles

A

p=promoteur eucaryote
MCS=site de clonage multiple
t=séquence de terminaison pour la transcription eucaryotique
ESM=marqueuer de sélection eucaryotique
Ori euk= origine de réplication eucaryote
Ori E= origine de réplication dans E.coli
Ampr=marqueur de sélection chez l’E.coli

21
Q

Comment la protéine est sécrétée chez les eucaryotes

A

la séquence de signal de l’ARNm dans le ribosome est reconnue par un SRP (signal recognition particle) et va rentrer dans la celulle pour être traduite.
Elle forme un vesicule pour pouvoir sortir de la cellule

22
Q

où se passe le repliement protéique et par quels 2 molécules

A

dans RE et grace aux PDI (isomérase disulfide des protéines) et BiP (chaperones moléculaires)

23
Q

c’est quoi le baculovirus

A

virus d’ADN db qui infecte les arthopodes

24
Q

quelles sont les 2 formes du baculovirus

A

1) forme budded
2)forme occluded