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Bio sur mon cell > yo the mytho bro > Flashcards

yo the mytho bro Flashcards

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Biology 101 flashcards
1
Q

Découverte de la mitochondries

A

– Les mitochondries furent observées et décrites par Altmann en 1890 mais nommées ainsi par Benda en
1898.
– Altmann les nommait bioblastes (bioplastes) car il croyait que c’était des particules autonomes et
vivantes à l’intérieur des cellules.

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Q

Localisation des mitochondries

A
  • Toutes les cellules eucaryotes aérobie stricte ou facultative
  • Sauf dans érythrocyte des mammifères
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3
Q

Mitochondries au microscope photonique

A
  • Formes interchangeable, extrêmement plastique (se fusionnent, se fractionnent, s’allongent, se raccourcissent
  • Peuvent se déplacer sur des microtubules
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4
Q

Structure générale des mitochondries observés au MET

A
  • Délimitées par 2 membranes du type mosaïque fluide.
    > membrane externe doublée d’une membrane interne qui forme des crêtes vers la matrice
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5
Q

Forme des crêtes mitochondriale chez eucaryote

A

Plus elles sont récentes dans l’Évolution, plus elles ont des crêtes lamellaires

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6
Q

Il y a 2 membrane donc 2 compartiement

A
  • Les ouvertures tubulaires assurent continuité entre espace intermembranaires et intracrêtes
  • A de l’ADN
    > Bicaténaire
    > Fermé sur lui-même
    > plusieurs copies attachées à la membrane intern
    >sans histones
    >pas un échantillon de l’ADN nucléaire
  • A de l’ARNm, ARNt, ARNr
  • A des granules de Ca++
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7
Q

Particules élémentaires?

A

Tapissent la membrane interne. On les voit dans la coloration négative
C’est les F0F1ATPase. C’est un complexe protéique formé de 9 types de polypeptides.
100000/mitochondries => donc il y a les crêtes pour avoir plus de surface membranaire

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8
Q

Activités biochimiques de la mitochondries

A
  • Transforment acétate (acétyl-CoA) en CO2 et H20
  • Phosphoryle ADP en ATP
  • Énergie de l’oxydation de l’acétyl CoA sort par le transport d’électron dans la chaine respiratoire=>synthèse ATP
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9
Q

Dissection biochimique de la mitochondrie

A

Problème : 2 membranes et 2 compartiments
Pour connaître le fonctionnement de la mitochondrie, il faut localiser ses diverses enzymes

1- Image c’est les ultrasons: expérience de Racker

2- Avec détergents:
>Mitochondrie traitée à la digitonine => Vésiculisation de la membrane externe
> Voie de la membrane interne +matrice (mitoplaste): on va appliquer lubrol, ce qui va détacher membrane interne du contenu de la matrice
> Diapo 20

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10
Q

Composition de la membrane externe

A
  • Protéine (bcp)
  • Lipides 40%
  • Très riche en AG insaturés
  • Peu de cholestérol
  • Porines: protéines de transport formant des canaux aqueux très larges à travers la membrane.
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11
Q

Particuliarité du compartiment intermembranaire

A

Présence de l’adénylate kinase (adénylkinase)
Catalyse la réaction suivante: AMP + ATP→ 2 ADP.
AMP ne peut traverser la membrane interne d’où la nécessité de le phosphoryler en ADP. Celui-ci peut traverser la membrane interne

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12
Q

Composition et fonction des parties de la membrane interne

A

Lipides:

  • Pas de cholestérol
  • 20% des phospholipides sont des cardiolipides à 4 chaines AG
  • Très imperméable aux ions

Protéine: Membrane riche en prot asymétrique. (3 types de prot:

  • Chaîne respiratoire (transport d’électrons)
  • ATP synthétase (phosphorylationoxydative)
  • Transporteurs spécifiques
    1. Co transporteur antiport d’ADP-ATP translocase. Entrée d’ADP et sortie ATP
    2. Transporteur actif d’AG, d’AA et d’acide pyruviques
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13
Q

Composition de la matrice mitochondriale

A
  • Enzymes du cycle de Krebs
  • Enzymes de la ß-oxydation des acides gras
  • Enzymes nécessaires à la réplication, la transcription et la traduction de l’ADN mitochondrial
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14
Q

Qu’est-ce que le couplage oxydation-phosphorylation?

A

C’Est e le couplage entre les étapes d’oxydation et la synthèse d’ATP.

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15
Q

Qu’est-ce que le couplage chiosmotique?

A

C’est le mécanisme qui découle de l’oxydation pour former une liaison riche en ATP.

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16
Q

Forme des crêtes mitochondriale et leur rôle

A

Formes:

  • Lamellaires
  • Tubulaires (plus chez protozoaires)

Rôle:

  • Augmenter surface de membrane
  • Plus abondantes plus l’activité respiratoire du tissu est élevé
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17
Q

Provenance de l’acétyl CoA

A

1- De la ß-oxydation des acides gras (dans les mitochondries et/ou les peroxysomes)
2- De l’oxydation du pyruvate (acide pyruvique) (dans les mitochondries)

18
Q

Truc à savoir sur le couplage chiosmotique

A
  • C’est trouver par Peter Mitchell
  • 1 paire d’é. données par NADH chasse 10 protons ds espace membranaire (Donc 3 atp selon Mitchell)
  • 1 paire d’é. données par FADH2 chasse 6 protons ds espace membranaire (donc 2 ATP selon Mitchell)
  • 3 protons pour une molécule d’ATP
  • Aujourd’hui on sait que (c’est 2,5 ATP par NADH, 1,5 ATP par FADH2)
19
Q

Site de contact entre membrane externe et interne?

A

certains endroits permettant le passage direct des protéines du cytosol vers la matrice mitochondriale.

20
Q

Site de synthèse des prot destinés à mitochondrie c’est quoi ça?

A
  • Polysomes(plusieurs ribosomes) cytosoliques
  • Pénétration des protéines dans les mitochondries 1 à 2 minutes après leur traduction.
21
Q

Que sont les les séquences signals?

A

Des Hélice α-amphipathique à l’extrémité NH2 des prot

  • Résidus d’acides aminés chargés positivement d’un côté de l’hélice.
  • Résidus d’acides aminés hydrophobes de l’autre côté de l’hélice.
22
Q

Que fait Hsp70?

A

C’est une molécule chaperon qui se lient aux acides aminés hydrophobes normalement cachés à l’intérieur des protéines mitochondriales à importer afin d’empêcher les protéines de s’agglutiner entre elles ou de prendre une structure 3-D incorrecte.

Requiert de l’ATP pour s’attacher ou se détacher des prots.
Requiert la séquence signal

23
Q

Jase moi du complexes de translocation mitochondriaux

A

C’est multiples complexe qui permettent l’incorporation des prot dans la mitochondrie et ses membranes

24
Q

L’importation des prots ne requiert pas d’énergie (V/F)

A

Faux:
- l’‘insertion de la séquence signal (charge postive) et des acides aminés avoisinants dans le complexe TIM23 se fait grâce au gradient électrochimique. Les charges négatives attirent la séquence signal vers la matrice.

  • le reste de la protéine pénètre grâce à l’hydrolyse de l’ATP
25
Q

À Quelle temp l’importation des prot ne se fait plus?

A

à 5°C => on ne peut plus faire l’hydrolyse d’ATP

26
Q

Chemin des prot destinées à la matrice

A
  1. Elle est doté d’une séquence signal. Passe par TOM 40
  2. Puis passe par TIM23
  3. Hydrolyse de l’ATP par Hsp70 pour plier et changet confromation prot
  4. Hsp 60 continue le pliage puis hydrolyse d’ATP pour s’y dissocier
  5. Protéase coupe la séquence de signal
27
Q

Chemin (3) des prot destinées à la membrane interne

A
  1. Même chemin que prot pour matrice mitochodnriale.
  2. Après clivage, la prot va toute dans la matrice
  3. Un second séquence signal qui était juste après le premier guide prot
  4. Va dans la membrane interne par le comple OXA

OU

  1. La prot à déja 2 séquence signal.
  2. Rentre par TOM 40 puis dans Tim 23 RESTE ICI
  3. Première séquence clivé en étant encore sur TIM23.
  4. Prot reste dans l’espace intermembranaire et va s’insérer dans la membrane

OU

D’autres prot qui vont être synthétisé par la mitochondrie va directement avoir la séquence signal pour aller vers la membrane interne.

28
Q

Chemin des prot destinées à l’espace intermembranaire

A
  1. Idem pour prot destinée à membrane interne, mais on clive la partie transmembranaire
29
Q

Chemin des prot à plusiseurs domaines transmembranaires destinées à la membrane interne

A
  1. C’est des prot codés par le noyau qui vont passer par TOM 40. Elle a un séquence signal interne
  2. Des molécules chaperones vont plier la prot
  3. TIM22 va reconnaitre séquence interne et rentrer les domaines transmembranaires ds la membrane interne
30
Q

Chemin des prot en baril B (porines) ds la membrane externe

A
  1. Rentre dans lespace intermembranaire par le complexe TOM
  2. Des molécules chaperones plient la prot
  3. Le complexe SAM l’intègre ds la membrane externe
31
Q

The fuck: transport des glycérophospholipides du RE vers les mitochondries?

A

En gros LP, on a des prot échangeuse de phosphoglycérolipides qui vont échanger ces molécules entre les membranes du RE et de la mitochondrie

32
Q

Qu’est-ce que Altmann a fait?

A

Décrit les mitochondries comme des symbiotes bactériens des cellules eucaryotes (Bioplaste).

33
Q

Qu’est-ce que Margulis a dit?

A

YOOOO: Similitude entre les bactéries Gram (-) et les mitochondries:

-ADN circulaire, bicaténaire, sans histones
-Synthèse protéique:
> Inhibée par la tétracycline, l’érythromycine et le chloramphénicol
>inhibée dans le cytosol par la cycloheximide mais non dans les bactéries et les mitochondries
- Composition biochimique:
> Bactéries à son gradient électrochimique sur sa membrane interne. Elle n’a pas de mitochondrie
> les deux ont des porines

34
Q

Où sont les parois de peptidoglycane?

A

Pas chez les mitochondries: seulement chez les bactéries Gram (-)

35
Q

Conclusion

A

Au début, oxygène était un déchet métabolique.

  • Certains procaryote sont devenu aérobie (protéobactérie a)
  • D’autres se sont vu former un noyau
  • Après il y a soit eu un mixte, donc cellule avec noyau ont manger, mais pas digérer au complet les protéobactérie(mitochondries.
    D’autres n’ont pas pris de mitochondries et sont devenu c. eucaryote anaérobie

Cellule végétale dériverait de la cellule animale puisqu’elle possède les 2 organelles.

36
Q

Modes de division des mitochondries

A

Partition: croissance des invagination
Segmentation: dynamine étrange la mitochondries pour en former 2

37
Q

Qu’est-ce que le complexe TOM?

A

Translocase of the Outer membrane of Mitochondria
TOM 20: récepteur du signal d’importation

38
Q

Que sont les complexes TIM?

A

Translocase of the Inner membrane of Mitochondria

TIM 22: insertion dans la membrane interne de protéines à multiples domaines hydrophobes codées par l’ADN nucléaire

TIM 23: Pénétration des protéines vers la matrice ou insertion de protéines dans la membrane interne. Possède une queue hydrophobe insérée dans la membrane externe

39
Q

Que sont les complexes SAM?

A

Sorting and Assembly of outer-Membrane proteins

40
Q

Qu’est-ce que le complexe OXA?

A

insertion dans la membrane interne de protéines codées par l’ADN mitochondrial ou l’ADN nucléaire

Bio sur mon cell (14 decks)

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