Réticul Flashcards
Trois systèmes qui combattent prot mal repliés
- IRE1 activé par prot mal replié -> va épissé un mRNA Xbp-1u -> Xpb-1s -> transcription de la protéine de régulation 1 -> active gène pour augmenter repliage de prot du RE
- PERK activé par prot mal replié -> va inactive facteur initiation de la traduction -> va inhiber prod protein, mais active un ARNm -> va active une transcription de la protéine de régulation 2 -> active gène pour augmenter repliage de prot du RE
- ATF-6 quand lié va se détacher du RE -> il va avoir clivage de la partie cytosolique pour aller dans le complexe golgien -> transcription de la prot de régulation 3 -> active gène pour augmenter repliage de prot du RE
IRE1 plus poussé
- Prot mal replié se lie à IRE1 => l’active (signal manque de molécule chaperonne)
- IRE1 qui est une kinase va activer une activé endoribonucléase => 2 exon forment un ARNm
- ARNm fait un facteur de transcription => va activer un gène qui produit molécule chaperone
- Molécule chaperone va aller replier prot
Suite d’évent pour découverte RE
C. au MET (1945): On voit un réseau membranaire délimitant les cavités
Ultracentrifugation(fin années 40): On obtient un nouveau culot (microsome)
Palade et Siekevitz (1956): microsome sont artéfacts du RE observé au MET
Qu’est-ce que le microsome?
C’est un artefact du réticulum endoplasmique rugueux
Qu’est-ce que le réticulum endoplasmique?
Réseau de saccules et de tubules membranaires qui portent ou non des ribosomes sur la face cytosolique de leur membrane.
Le RE composes t’il une grosse partie de la surface membranaire d’une cellule?
Oui. 50%
Composition du RE?
Vésicule.
Citerne
Tubules
Saccules
Différences entres citernes et saccules?
Les citernes sont plus gorgées que les saccules
Topologie de la c. et RE
Lumière du noyau est en continuité avec le reste de la cellule.
La lumière du RE est en continuité avec les organelles et le milieu extérieur.
- Cette continuité est assurée par fissions et fusions de membrane permettant des échanges des échanges
entre les compartiments cellulaires.
Parle des 4 domaines de réticulum endoplasmique
- Réticulum granulaire (rugueux)
- Porte des ribosomes sur face cytosolique
- Abondant ds c. qui synthèsent des prot - Réticulum agranulaire (lisse)
- Pas de ribosome
- Synthèse des lipides
- Forme de tubule - Réticulum de transition
- Ribosomes d’un côté seulement
- En saccules
- Permet d’envoyer vésicule au golgi (bougeonnement de la membrane - Membrane nucléaire externe (domaine du RER)
- Ribosomes du côté faisant face au cytosol
Le RE d’une cellule exocrine pancréatique libère quoi?
Beaucoup d’enzymes digestives
Que sont les structures en rosettes du RE?
Des polysomes: ARNm où pls ribosomes s’y attache pour faire des prot
C’est quoi les granules sur REG?
Des ribosomes
Qu’est-ce qui fait le mécanisme de ségrégation des ribosomes entre le REL et REG?
Ce n’est pas les radeaux lipidiques (ribosomes fuking plus gros que la membrane)
- En s’associant les unes aux autres?
Structure des ribosomes procaryote et eucaryote
Procaryote:
- 30S: 16s
- 50s: 5S et 23S
Eucaryote:
- 40s: 18s
- 60s: 5s, 5;8s et 60S
Comment les prot membranaires synthétisé ds RER et MNE se diffusent?
Librement par la membrane en continue du RE dans la MNE et MNI
Quand prot ds MNE => translocation par complexe de pore nucléaire vers MNI
C’est quoi la rétention des prot?
Les prot se retiennent les unes les autres par un réseau.
Que fait le signal de localisation nucléaire (SLN)?
Permet un transport facilité des prot dans les CPN, en recrutant importine à la prot.
Prot va de MNE à MNI
Pas nécessaire pour le transport, mais le rend plus efficace
Comment les protéine sont incorporés?
Par les séquence signal!
Si la protéine ne possède aucune séquence signal est demeure dans le cytosol. Au contraire, si elle présente une séquence signal, elle sera incorporée, dans une
organelle, co-traductionnellement ou posttraductionnellement.
Incorporation co-traductionnelle?
Incorporation et synthèse se fait simultanément.
Se fait sur le RE, mais secrétés direct après
Différence dans la traduction des prot résidantes et des protéine libre
Pour les prot résidantes, une molécule signal va aller sur ribosome pour identifier que prot est destiné à une membrane ou wtv.
Suite des étapes pour lier ribosome qui traduit la prot destiné à une membrane par la particule reconnaissance de signal
- Liaison de PRS sur ribosome=>pause de la traduction
- Ribosome liée à PRS s’attache au récepteur de PRS sur membrane
- Traduction se poursuit et translocation commence=> hydrolyse de GTP sur PRS=> PSIT s’attache au complexe de translocation (le signal et le récepteur sont déplacés et recyclé)
- Protéine en traduction expulse le bouchon dans le pore qui était là pour empêcher sortie de Ca++
Qu’est-ce que le PSIT?
Peptide signal d’initiation du transfert
(15 à 60 a.a. dont 8+ a.a. non polaire en
son centre)
C’est le signal sur la protéine traduite. Les prot destinée à des membranes ont toute ça
Constituant de PRS
un ARN et de 6 protéines.
Poche hydrophobe
Méthionine abondante
Les 2 raisons pour que le translocateur peut s’ouvrir
Et en bonus, qu’est-ce qui arrive avec le bouchon?
- pour laisser entrer une protéine du cytosol vers la lumière du RE (bouchon qui obstrue normalement).
- pour libérer le peptide signal dans la bicouche de phospholipides.
Le bouchon est juste déplacé on va le réutiliser.
Rôle du la peptidase du signal et de la peptidase du peptide du signal
Peptidase du signal: coupe la peptidase de la prot
Peptidase du peptide signal : dégrade le peptide signal relâché du complexe de translocation.
Les 4 types de prot synthétisé dans REG
• Protéine destinée à la lumière du REG
• Protéine enchâssée dans la membrane du REG (une seule hélice alpha)
– PSIT à l’extrémité NH2 de la protéine avec séquence d’arrêt de transfert (SAT) interne
> Extrémité NH2 dans la lumière du REG
– PSIT interne (dans la chaîne d’acides aminés)
> Extrémité NH2 dans la lumière du REG
> Extrémité COOH dans la lumière du REG
• Protéine enchâssée dans la membrane du REG (plusieurs hélices alpha)
• Protéine ancrée à la membrane du REG
– Feuillet luminal (ancre de GPI)
– Feuillet cytosolique
Particularité des Protéine enchâssée dans la membrane du REG avec PSIT à l’extrémité NH2
Les 2 cas particuliers de la protéine enchâssée dans la membrane du REG avec un PSIT interne non reconnu par la peptidase du signal
- Si plus d’acides aminés chargés positivement suivent immédiatement le PSIT (sont situés entre le PSIT et le bout COOH) => Cas avec NH 2 dans la lumière du REG
- Si plus d’acides aminés chargés positivement précèdent immédiatement le PSIT (sont situés entre le bout NH 2 et le PSIT) => cas avec COOH dans la lumière du REG
Cas d’incorporation post-traductionnelle des protéines à ancrage par la queue
Sont fait post traductionnellement car le segment transmembranaire est au niveau de l’extrémité C-terminale (dernière traduite)
Ne se fait par SRP et son récepteir
SE fait par Get3 ATPase et Get1-Get2
Cas d’incorporation quand c’est une prot à plus hélice alpha transmembranaire
Il va avoir plusieurs séquence de début du transfert suivi de séquence d’arrêt du transfert
Protéines accessoires nécessaires à l’incorporation post-traductionnelle ont besoin de quoi?
ATP
Comment on ancre les protéines ancrée à la membrane du REG?
- On clive leur domaine transmembranaire
- ils sont attachées par une ancre GPI au feuillet luminal du REG
Qu’est-ce que l’ancre GPI?
C’est un glycolipide: glycosyl-phosphatyl-inositol
A une partie ancrée dans la membrane et une partie dans la lumière qui se lie à la prot
Les 2 types de glycolysation
Liaisons N -glycosidiques
• Oligosaccharides liés à l’asparagine
• Effectuées dans le RE
• Ce sont les glycosylation les plus fréquentes (90%)
Liaisons O -glycosidiques
• Oligosaccharides liés à la sérine, la thréonine ou à l’hydroxylysine.
• Effectuées dans le complexe golgien
• Ce sont les glycosylation les plus rares (10%)
Les étapes de glycolysation de l’asparagine
- Synthèse de l’oligosaccharide sur le dolichol
- Transfert de l’oligosaccharide par l’oligosaccharyl transférase, du dolichol à l’asparagine.
• 1 oligosaccharyl transférase par complexe de translocation
Cible requis pour la glycolysation
Il faut que l’asparagine soit suivi de:
• 1er acide aminé voisin vers le bout COOH : tout a.a. sauf la proline
• 2e voisin vers le bout COOH : sérine ou thréonine
Asp - X - (Ser ou Thr)
Structure de l’oligosaccharides
2 n-acétylglycosamine
9 mannose
3 glucose
2 des glucose sont coupé par glucosidase 1
Fonctions détoxication du RE
- Par cytochrome P450 (dans la membrane du REL)
- Métabolisent la plupart des xénobiotiques
- Participent dans la clairance métabolique de la plupart des drogues
Fonction synthèse du cholestérol du RE
- Débutent dans le cytosol où plusieurs enzymes hydrophiles font des rx
- Terminent dans la membrane du REL, car Cholestérol est de plus en plus hydrophobe et se solubilise dans la membrane
Fonction synthèse de phospholide du RE
Yeah elle fait ça. Genre les phosphatidylcholine, sphingolipides.
Se fait dans la membrane du RE, du côté du cytosol
Que fait la scramblase?
Catalyse le transfert de phospholipide entre feuillet de membrane
Elle est dans la membrane du RE
Que fait la translocase de phospholipase
C’est un transport actif ATP dépendant.
Va faire flipper les phospholipides, car la membrane plasmique requiert une composition de phospholipide très stricte.
Comment différencier les prot résidantes du RE?
Membranaires: séquence KKXX cytosolique
Solubles: Séquence KDEL (Lys-Asp- Glu- Leu) à COOH
Pourquoi les protéines ancrées par une GPI sont -elles toujours du côté extracellulaire ?
Parce que la lumière du RE est en continuité avec le milieu extracellulaire
Formation de vésicule de transition à partir de la membrane du RE
Au niveau du RE:
• Protéine G (protéine liant les nucléotides guanyliques) nommée SAR1 qui lie COPII. Le GTP est lié à une prot hydrophobe.
Au niveau du Golgi:
• Protéine G nommée ARF qui lie COP I
- Va enrobé visucle de coatomère
COP est un coatomère
Localisation des vésicules à COP et à Clathrine
Clathrine:
- Des endosomes précoces vers la membrane plasmique et vers les endosomes tardifs.
- De la membrane plasmique vers les endosomes précoces.
- Du RTG vers les endosomes précoces ou tardifs.
- Du RTG vers la membrane plasmique (sécrétion contrôlée)
COP I :
- Du Compartiment Intermédiaire Rét. End. Golgi (CIREG) et du réseau cis-golgi vers le réticulum de transition.
- Entre les saccules golgiens
- Du réseau trans golgien (RTG) vers la membrane plasmique (sécrétion constitutive)
COP II:
- Du réticulum de transition vers le cis-golgi
RE et Ca++
• Site de stockage des ions Ca++ par la Ca++ - ATPase
- Conc. en Ca++ est plus haute ds cytosol et RE que dans la cellule
Hsp 70 et 60
Hsp70
- Se lient sur plaque hydrophobe de prot mal replié en cours de synthèse=> leur donne la bonne structure 3D
- Ds le cytosol, RE, Mitochondries et chloroplaste
Hsp60
Ce sont des tonneaux protéiques qui reçoivent les protéines mal repliées après leur synthèse. Dans le cytosol, RE, mitochondries, chloroplastes.
Que fait le protéasome
s Tonneaux protéiques qui dégradent les protéines mal repliées polyubiquitiné en acides aminés
Fonctionnement de la calnexine
- GLucosidase 1 coupe 2 glucose de l’oligosaccharide sur la prot
- le 3e glucose permet à la port de se loger ds calnexine (lectine) pour lui donner le temps de se replier correctemetn
- Glucosidase 2 coupe le dernier glucose
- Peut soit sortir du RE si correctement replié ou se refaire ajuster un glucose pour repasser par la calnexine
