Week 5 (Explorer les gènes et les génomes)

Question 1

Comment crée-t-on la structure de filet de pêche dans l’agarose ?

Answer 1

On chauffe la mixture puis on baisse et la temperature et laisse refroidir

Question 2

Dans quelle direction va l’ADN migrer dans l’Électrophorèse sur gel ?

Answer 2

Vers le pôle positif car l’ADN est chargé négativement a cause des liens phosphodiester

Question 3

Quel marker utilise-t-on pour marquer l’ADN dans l’électrophoèse ?

Answer 3

l’éthidium bromide

Question 4

Qu’est une enzyme de restriction ?

Answer 4

Elle se lie à la double hélice en reconnaissant un site puis coupent les deux brins a ce site

Question 5

Quelle réaction est utilisé par les enzymes de réstrictions pour couper les brins ?

Answer 5

Une réaction d’hydrolyse

Question 6

Quelle est la caractéristique des sites où agissent les enzymes de restriction ? Pourquoi que là ?

Answer 6

Ils agissent sur les séquences palindromiques. Car les ER sont homo-dimères.

Question 7

Pourquoi est-ce que les bactéries produisent des enzymes de restriction ?

Answer 7

Pour se protèger des virus bactériophages.

Question 8

Comment est-ce que les bactéries font pour protèger leur ADN de leurs enzymes de restrictions ?

Answer 8

1. Ils methylent leur ADN pour que l’enzyme puisse pas reconnaître le site de restriction cf. résumé
2. En n’ayant pas le site que reconnaît l’enzyme dans son ADN

Question 9

Qui à découvert les enzymes de restriction ?

Answer 9

• Werner Arber
• Hamilton O. Smith

Question 10

Qui est la première personne à avoir utilisé les enzymes de restriction

Answer 10

Daniel Nathans

Question 11

Quand on transfère un gène spécifique est ce qu’est un seul brins ou les deux ?

Answer 11

Les deux

Question 12

Comment fonctionne généralement la technologie recombinant ?

Answer 12

On transfère un gène spécifique d’un organisme dans un autre. Ce deuxième organisme expresse ensuite la protéine spécifique du gène transferé.

Question 13

Quels genres d’ADN est-ce que un vecteur (bactérie) possède ?

Answer 13

1. l’ADN génomique (4.6 millards de nucléotides)
2. le Plasmids (4000 nucléotides)

Question 14

Dans quel ADN est insére notre gene d’intérêt lors de technologie recombinant et pourquoi?

Answer 14

Plasmides. Car c’est moins complexe que l’ADN génomique et plusieurs copies du même plasmide(donc gène) peut être contenu dans une même cellule

Question 15

Qui a développer une méthode pour séquencer l’ADN ?

Answer 15

Frederick Sanger

Question 16

Comment fonctionne le séquençage de l’ADN ?

Answer 16

Comme pour la synthèse d’ADN.
Se qui change est l’introduction de la di-deoxy-adenosine-triphosphate qui est très similaire à la dATP qui se lie au brin mais aucune nucléotisine peut ensuite se lier. La synthèse s’arrête. On sait ou c’est arrêter la synthèse et on connaît le nucléotide complémentaire. On fait la même chose avec des analogues dideoxy des autres nucléotides.

Question 17

Qu’est ce qui est différent entre un déoxyribose et un dideoxyribose ?

Answer 17

Le dideoxyribose n’a pas le groupe hydroxyle sur la 3 carbone de la chaîne de carbone du sucre

Question 18

Pourquoi est-ce qu’on utilise de nos jours des di-deoxy-nucléotides fluorescents ?

Answer 18

Car à la place de faire quatre réactions en parrallèle pour chaque analogue di-deoxy on peut juste faire une réaction et triée les fragments par électrophorèse et par diffraction (laser colour thing)

Question 19

Qui été les deux principales personnes dans le séquençage du génome humain ?

Answer 19

• Francis S. Collins
• J. Craig Venter

Question 20

Combien de nucléotides à le génome humain entier ?

Answer 20

Environ 3’000’000’000 nucléotides

Question 21

Comment on-t-il séquencé le génome humain en utilisant la méthode de Sanger ?

Answer 21

Le génome est brisé en plusieurs fragments et brisé jusqu’a qu’ils soient une petite taille pour être séquencé. Ils sont ensuite séquencé plusieurs fois et où il y a des chevauchement la vraie séquence est établie