week 2 HC's pt. 3

Question 1

Wat initieert de replicatie van DNA?

Answer 1

Een geactiveerd origin of replication complex (ORC, herkenningseiwit) dat het replication initiation point (RIP, startpunt) bindt

Question 2

Wat is een primer en door welk enzym wordt het gemaakt?

Answer 2

• een stukje RNA, complementair aan het ontwonden DNA.
• DNA polymerase alfa primase

Question 3

Welke strand loopt complementair aan de replication fork?

Answer 3

lagging

Question 4

Welke strand bouwt op dmv okazaki fragmenten?

Answer 4

lagging

Question 5

Wat is de respectievelijk de functie van de sliding clamp en de loading clamp?

Answer 5

• sliding: positioneert loading clamp, houdt nieuw gesynthetiseerd DNA bijeen achter DNA-polymerase.
• loading: houdt DNA polymerase op enkelstrengs DNA

Question 6

Wat is het grootste verschil tussen het 3’ uiteinde en het 5’ uiteinde op micro niveau?

Answer 6

3’ heeft een OH-groep en 5’ een trifosfaatgroep

Question 7

Wat is een replication fork?

Answer 7

Het DNA deel dat nog door helicase ontwonden moet worden

Question 8

Waarom wordt DNA altijd opgebouwd van 5’ naar 3’ richting?

Answer 8

Er wordt altijd OH (3’) aan de trifosfaatgroep (5’) gebonden omdat deze dan twee fosfaatmoleculen kan afstaan en zo energie kan genereren voor deze binding.

Question 9

Welke 3 enzymen zorgen dat DNA ontwonden is en blijft?

Answer 9

• topoisomerase
• DNA helicase
• ssb

Question 10

Wat is de functie van DNA-ligase en wat is het belang hiervan?

Answer 10

• het verbinden van de losse okazaki-fragmenten
• de gaps tussen de fragmenten zijn erg gevoelig voor schade

Question 11

Welke 3 mechanismen beheren de nauwkeurigheid van de replicatie?

Answer 11

• base selectie
• proofreading
• mismatch reparatie

Question 12

Waardoor ontstaat een tautomeer en wat is het gevolg hiervan tijdens de replicatie?

Answer 12

• een protonverschuiving
• er wordt een incorrecte base ingebouwd (mismatch)

Question 13

Hoe wordt een incorrecte basenparing gecorrigeerd en hoe heet dit proces?

Answer 13

• proofreading
• DNApolymerase stopt de replicatie, de foutieve base wordt verwijderd door exonuclease activiteit.

Question 14

Benoem in 3 stappen hoe mismatch reparatie plaatsvindt

Answer 14

1. Eiwitten binden aan mismatch en trekken exonuclease enzymen aan
2. de enzymen verwijderen deel van DNA en mismatch
3. DNA polymerase vult weer op

Question 15

Welk soort DNA-polymerase repliceert de lagging strand?

Answer 15

epsilon

Question 16

Welk soort DNA-polymerase repliceert de leading strand?

Answer 16

delta

Question 17

Benoem een voordeel en een nadeel van TLS.

Answer 17

voordeel: Na ernstige DNA schade kan de replicatie alsnog doorgaan
nadeel: het polymerase is erg onnauwkeurig waardoor er een hoog risico op mutaties is.

Question 18

Wat zijn de 4 functies van het cytoskelet?

Answer 18

• beweging
• communicatie
• structuur (verankering)
• regulatie

Question 19

Wat is een filopodium en wat is de functie hiervan?

Answer 19

een cel uitsteeksel die oiv. het cytoskelet zijn omgeving kan aftasten.

Question 20

Uit welke 3 onderdelen bestaat het cytoskelet voornamelijk?

Answer 20

• actine filamenten
• intermediair filamenten
• mircotubuli

Question 21

Op welke 2 manieren kan een actinefilament een cel laten bewegen?

Answer 21

• door vlak onder het membraanoppervlak klein/groter te worden
• door binding en beweging met myosine (spiercontractie)

Question 22

Wat zijn de functies van actinefilamenten?

Answer 22

vorm en beweging

Question 23

Wat is het grootste verschil op moleculair niveau tussen een actine en intermediair filament?

Answer 23

actine bestaat uit gespiraliseerde polymeren en intermediair filamenten uit gespiraliseerde monomeren.

Question 24

Hoe beïnvloedt de conformatie van intermediair filament de treksterkte van een cel?

Answer 24

de monomeren van een intermediair filament kunnen polymeriseren en zo een netwerk vormen die de cel sterker en steviger maakt.

Question 25

Wat zijn de functies van intermediair filamenten?

Answer 25

vorm, stevigheid en treksterkte

Question 26

Wat zijn de functies van microtubuli?

Answer 26

intracellulair transport

Question 27

Wat is het verschil tussen dyneine en kinesine?

Answer 27

dyneine is een motoreiwit dat over de microtubuli richting de kern loopt, en kinesine richting de periferie van de cel.

Question 28

waaruit zijn cilia opgebouwd en wat is de functie?

Answer 28

• micortubuli
• vloeistoftransport (trilhaar)

Question 29

waaruit zijn flagella opgebouwd en wat is de functie?

Answer 29

• microtubuli
• voortbeweging cel (zweepstaartje)

Question 30

Wat is het verschil tussen de apicale kant en de basale kant van een cel?

Answer 30

Apicale kant is aan de buitenkant, basale kant aan de binnenkant op de ECM

Question 31

Welke 4 soorten cel-cel verbindingen zijn er?

Answer 31

1. desmosomen
2. adherens junctions
3. gap junctions
4. tight junctions

Question 32

Wat is de voornaamste functie van een desmosoom?

Answer 32

verbinding van epitheliale cellen

Question 33

Wat zijn cadherines?

Answer 33

transmembraan eiwitten die aan beide kanten uitsteken en zo samen een complex kan vormen dat cellen met elkaar verbindt (desmosoom)

Question 34

Hoe worden cadherines (en dus cellen) verbonden?

Answer 34

attachement eiwitten verbinden de cadherines en intermediair filamenten verankeren deze verbindingen.

Question 35

Waar bevindt een adherens junction zich?

Answer 35

Aan de cytoplasmatische kant aan het actine skelet

Question 36

Wat is de voornaamste functie van een tight junction?

Answer 36

het vormen van een barrière

Question 37

Wat is een adhesiering en wat is zijn functie?

Answer 37

• Een ringstructuur van tight junctions en cadherines
• Polarisatie van de cellen

Question 38

Wat zijn de functies van een gap junction?

Answer 38

communicatie van signalen en prikkels doorgeven

Question 39

Wat is de functie van een hemidesmosoom?

Answer 39

Verankering van cellen op het basaal membraan (cel-ECM verbinding)

Question 40

Hoe heet het transmembraan eiwit waaruit een hemidesmosoom bestaat?

Answer 40

integrine