week 2 HC's pt. 3 Flashcards
Wat initieert de replicatie van DNA?
Een geactiveerd origin of replication complex (ORC, herkenningseiwit) dat het replication initiation point (RIP, startpunt) bindt
Wat is een primer en door welk enzym wordt het gemaakt?
- een stukje RNA, complementair aan het ontwonden DNA.
- DNA polymerase alfa primase
Welke strand loopt complementair aan de replication fork?
lagging
Welke strand bouwt op dmv okazaki fragmenten?
lagging
Wat is de respectievelijk de functie van de sliding clamp en de loading clamp?
- sliding: positioneert loading clamp, houdt nieuw gesynthetiseerd DNA bijeen achter DNA-polymerase.
- loading: houdt DNA polymerase op enkelstrengs DNA
Wat is het grootste verschil tussen het 3’ uiteinde en het 5’ uiteinde op micro niveau?
3’ heeft een OH-groep en 5’ een trifosfaatgroep
Wat is een replication fork?
Het DNA deel dat nog door helicase ontwonden moet worden
Waarom wordt DNA altijd opgebouwd van 5’ naar 3’ richting?
Er wordt altijd OH (3’) aan de trifosfaatgroep (5’) gebonden omdat deze dan twee fosfaatmoleculen kan afstaan en zo energie kan genereren voor deze binding.
Welke 3 enzymen zorgen dat DNA ontwonden is en blijft?
- topoisomerase
- DNA helicase
- ssb
Wat is de functie van DNA-ligase en wat is het belang hiervan?
- het verbinden van de losse okazaki-fragmenten
- de gaps tussen de fragmenten zijn erg gevoelig voor schade
Welke 3 mechanismen beheren de nauwkeurigheid van de replicatie?
- base selectie
- proofreading
- mismatch reparatie
Waardoor ontstaat een tautomeer en wat is het gevolg hiervan tijdens de replicatie?
- een protonverschuiving
- er wordt een incorrecte base ingebouwd (mismatch)
Hoe wordt een incorrecte basenparing gecorrigeerd en hoe heet dit proces?
- proofreading
- DNApolymerase stopt de replicatie, de foutieve base wordt verwijderd door exonuclease activiteit.
Benoem in 3 stappen hoe mismatch reparatie plaatsvindt
- Eiwitten binden aan mismatch en trekken exonuclease enzymen aan
- de enzymen verwijderen deel van DNA en mismatch
- DNA polymerase vult weer op
Welk soort DNA-polymerase repliceert de lagging strand?
epsilon
Welk soort DNA-polymerase repliceert de leading strand?
delta
Benoem een voordeel en een nadeel van TLS.
voordeel: Na ernstige DNA schade kan de replicatie alsnog doorgaan
nadeel: het polymerase is erg onnauwkeurig waardoor er een hoog risico op mutaties is.
Wat zijn de 4 functies van het cytoskelet?
- beweging
- communicatie
- structuur (verankering)
- regulatie
Wat is een filopodium en wat is de functie hiervan?
een cel uitsteeksel die oiv. het cytoskelet zijn omgeving kan aftasten.
Uit welke 3 onderdelen bestaat het cytoskelet voornamelijk?
- actine filamenten
- intermediair filamenten
- mircotubuli
Op welke 2 manieren kan een actinefilament een cel laten bewegen?
- door vlak onder het membraanoppervlak klein/groter te worden
- door binding en beweging met myosine (spiercontractie)
Wat zijn de functies van actinefilamenten?
vorm en beweging
Wat is het grootste verschil op moleculair niveau tussen een actine en intermediair filament?
actine bestaat uit gespiraliseerde polymeren en intermediair filamenten uit gespiraliseerde monomeren.
Hoe beïnvloedt de conformatie van intermediair filament de treksterkte van een cel?
de monomeren van een intermediair filament kunnen polymeriseren en zo een netwerk vormen die de cel sterker en steviger maakt.
