voie métabolique Flashcards
Que sont les deux type de contrôle des voies métaboliques
Le contrôle intrinsèque et le contrôle extrinsèque
Qu’est ce que le contrôle intrinsèque implique
La régulation de l’activité enzymatique par des concentrations des métabolites
C’est quoi la forme de contrôle la plus présente chez les procaryote
Le contrôle intrinsèque
Pourquoi est ce qu’on a besoin du contrôle extrinsèque
Car dans les organismes multicellulaires, le métabolisme doit répondre à des besoins de l’organisme entier
Qu’est ce que le contrôle extrinsèque implique
Les hormones et stimulation nerveuse
Comment agissent les signaux du contrôle extrinsèque
Par des second messagers pour cibler les activités des enzymes
Qu’est ce qui constatée sur la vitesse de synthèse et de dégradation des intermédiaire
Que chaque intermédiaire à une concentration constante et que le flux de intermédiaire est constant
Qu’est ce que le flux constant représente dans un système ouvert selon Prigogine
l’efficacité thermodynamique maximale
C’est quoi l’équation du Flux
J = vf - vr
C’est la différence entre la vitesse de réaction en avant: vf et celle du retour: vr
C’est quoi le flux à l’équilibre
Il y en a pas même si vf et vr sont différents
Le flux dépend de quoi quand loin de l’équilibre
Il dépend de vf
Le flux égale quoi à l’état stationnaire
est constante et dépend de l’étape la plus lente
Le contrôle de flux dans une voie métabolique exige quoi
Que l’étape contrôlant le flux répond au besoin métabolique de l’organisme et que le changement en flux répondant au besoin de l’organisme est communiqués à travers la voie
C’est quoi le schéma d’une réaction qui répond au flux
S -(J)> A <-> B -(J)> P
Qu’est ce qui arrive si le flux de l’étape limitante égale deltaJ
Le changement est communiqué et vf est changée afin de rétablir l’état stationnaire donc delta J = delta vf
Qu’est ce qui arrive dans les conditions physiologiques
[A] < Km, donc l’équation de menten devient deltavf/vf=delta[A]/[A]
C<est quoi la quantité
C’est vf/(vf - vr) qui représente la sensibilité du changement fractionnel en flux par rapport au changement fractionnel en concentration de substrat
Qu’est ce qui arrive dans une réaction irréversible
vr= 0 et vf/(vf - vr) = 1
Que sont les mécanismes qui peut affecter le flux à travers une étape limitante
le contrôle allostérique, la modification covalente, les cycles de substrat et le contrôle génétique
Que sont les méthodes de détection des mécanismes contrôlants
Identification de l’étape limitante d’une voie par la comparaison des deltaG. Détermination in vitro des effecteurs allostériques. Validation in vivo de la concentration des régulateurs pour déterminer les changements de concentration sont cohérents avec le mécanisme de contrôle
Que sont les deux mécanisme d’amplification du signal
Cycles de substrats et cycle interconvertible
Qu’est ce qui catalyse les réactions du cycle futile entre le fructose-6-P et le fructose 1,6-P
La réaction 1 est catalysé par 6-phosphofructokinase (PFK-1) et la réaction 2 par fructose-biphosphate (FBPase-1)
Qu’est ce qui arrive quand les deux enzymes sont actif en même temps lors du cycle futile entre D-fructose-6-P et D-fructose 1,6-P
Il y a une hydrolyse de l’ATP
Qu’est qui est important du cycle futile entre D-fructose-6-P et D-fructose 1,6-P
C’est que les deux réactions peuvent etre contrôlées séparément et donc, le flux égale J= vnet= Vréa1 - Vréa2
Qu’est ce que le cycle futile entre D-fructose-6-P et D-fructose 1,6-P peut faire
Il peut amplifier l’effet de [AMP] sur la vitesse nette de la phosphorylation de F6P
Qu’est ce qui arrive si le cycle de substrat possède une fonction régulatrice
Elle a comme but de minimiser le flux et non l’augmenter
C’est quoi le cycle de substrat
C’est le prix que les cellules doivent payer pour changer de façon rapide: passer de l’état de repos à un état d’activité
Que fait le cycle de substrat dans le diabète
Il augmente la production nette de glucose
Que fait le cycle interconvertible
Il contrôle l’activité par modification covalente qui est réversible, où il peut donner une grande amplification du signal initial
Qu’est ce qui arrive au glycogène synthase et phosphorylase lors de l’amplification d’un signal métabolique
Ils sont interconverties de façon enzymatique sous formes cinétiques et allostérique par les cascades cycliques
Que sont les avantages que les enzymes responsables des modifications sont elle-même modifiées
peut répondre à un grand nombre de stimuli allostérique différents, plus de souplesse en ce qui concerne le contrôle et potentiel énorme en amplification dans leurs réponse à la variation de la [effecteur]
C’est quoi l’équation de michaelis-menten d’un cascade monocyclique
v0/[E]T = k2[S]/(Km+[S])
L’amplification de l’effet allostérique d’un effecteur e1 correspond à quoi
À une situation où un petit effet sur l’enzyme F provoque un plus grand effet sur l’enzyme E
Que ferait une cascade bicyclique
L’amplification sera plus important et les activités du glycogène synthase et phosphorylase sont toutes les deux contrôlées par des cascades bicycliques
Que sont les critères de contrôle des voies métaboliques
L’activité de l’enzyme en question dans un lysat appropriées, mesurassions des concentrations intracellulaires des metabolites et les comparers à la constante d’équilibre, détermination des points de contrôle par perturbation de la voie métabolique, et par modelage mathématique pour reproduire une valeur expérimentale
C’est quoi le principe de l’activité de l’enzyme
Contrôle de l’enzyme présent en faible activité, mais l’enzyme présent en haute activité est moins contrôlant
C’est quoi le problème de l’approche par mesure de la concentration des critères de contrôle des voies métaboliques
La mesure précise des concentrations
Comment fonctionne le critère de contrôle des voies métaboliques par perturbations de la voie métabolique
Le système biologique est perturbé et les changements de concentration sont mesurés
Comment fonctionne le critère de contrôle des voies métaboliques par modelage mathématique
Il faut déterminer tous les paramètres cinétiques pour les substrats, les produits et les inhibiteurs, ensuite les équations qui décrit les variation de concentration sont résolues afin de calculer les concentrations des métabolites en fonction du temps
C’est quoi l’hypothèse 1 de la régulation de la glycolyse
Que l’[ATP] contrôle l’activité de 6-ĥosphofructokinase et par conséquent le flux dans la voie glycolytique
C’est quoi l’hypothèse 2 de la régulation de la glycolyse
Les effets de l’ATP puissent être contrecarrés par les métabolites ADP et AMP
C’est quoi l’hypothèse 3 de la régulation de la glycolyse
Lorsque le muscle est en repos la [AMP] est faible, et la vitesse de transformation de F6P er FBP catalysée par PFK est basse et opposé à la conversion de FBP en F6P catalysée par fructose-biphosphate
C’est quoi le fructose-2,6-biphosphate (F26P)
Le régulateur de l’activité de PFK-1 surtout dans le foie
La synthèse et dégradation de PFK-1 est catalysées par quoi
Par l’activité kinase et l’activité phosphatase dans la même enzyme appelée PFK-2/FBPase-2
Qu’est ce que la présence de F26P indique
Que le niveau de glucose est haut et que la
gluconéogenèse est arrêtée
Qu’est ce que la présence de glucagon provoque
une chute de [F26P] et par conséquent
favorise la gluconéogenèse
