Cytochrome P450 Flashcards
Le CYP450 est composé de quoi
14 hélices-a antiparallèles, 5 feuillets-B et leur hème est dans l’environnement hydrophobe
Qu’est ce qui arrive durant les étapes 1 à 3 de la liaison au substrat
Le substrat se lie au site actif de l’enzyme, ensuite il induit un changement de conformations du site actif et le déplacement d’une molécule d’eau et change l’état du fer hème. Ensuite il reçoit des partenaires redox pour réduire le fer à l’état ferreux
Qu’est ce qui arrive durant les étapes 3 à 4 de la liaison au substrat
Le substrat ce lie à l’oxygène qui conduit un réarrangement du complexe pour former le complexe oxy-P450
Qu’est ce qui arrive durant les étapes 4 à 5 de la liaison au substrat
L’étape limitant qui est la scission d’oxygène, puis un second électron est fourni ce qui forme le complex peroxo-P450-ferrique
Qu’est ce qui arrive durant les étapes 6 à 7 de la liaison au substrat
Le groupement peroxo est protoné formant l’intermédiaire hydroperoxo-ferrique. Ensuite un 2e proton est transféré qui provoque l’hétérolyse de la liaison O-O ce qui forme Fe4+-oxo
Qu’est ce qui arrive durant les étapes 7 à 8 de la liaison au substrat
L’enzyme active le substrat par l’abstraction ce qui crée un radical libre, le groupement hydroxyle et le radicale forment de l’alcool. Ensuit le produit est libérer et regagne son état initiale
Que sont des voies non productives de la liaison au substrat
Le composé 4 décompose à l’état ferrique, le composé 6 se décompose avec la production de peroxyde et le composé 7 s’effondre vers l’état ferrique
C’est quoi la caractéristiques du site actif de CYP450
La structure est renfermée et dépend de la dynamique conformationnelle afin de donner un accès au site actif chez la plupart des P450
Que font les CYP 2D6 et 2C9
Ils sont impliquées dans le métabolisme oxydatif des médicaments commercialisés
La position des canaux dépend de quoi
il dépend de la conformation du CYP
Que fait l’ibuprofène
Il s’accumule dans la membrane où il est aspiré par un canal d’accès et après la réaction enzymatique le 3-hydroxy-ibuprofène est libéré et conduit au cytosol
Les positions d’ouvertures de canal correspondent à quoi
À des minimas d’énergie libre du substrat de la CYP2C9, de l’ibuprofène et son métabolite dans la membrane
C’est quoi le régimes CPR/cyb5/P450
C’est un système utilisé par des eucaryotes CYP microsomaux qui impliquent la réduction du P450 réductase par NADPH, cyb5 pour le transfert du 2e électron
C’est quoi le régimes FR/Fd/P450
C’est un système utilisés par des CYP chez les mitochondries et bactéries
C’est quoi le régimes CYB5R/cyb5/P450
C’est un système dans lequel les deux électrons provient du cytochrome b5
C’est quoi le régimes FMN/Fd/P450
C’est un système trouvés en rhodococcus sp et dans lequel il a une réductase contenant FMN
C’est quoi l’oxydoréductase P450 (CPR)
C’est un monomère qui possède FAD et FMN qui transfère les électrons du NADPH vers P450
La forme compacte de CPR est utile pour quoi
Pour le transfert inter-flavine d’électrons
La forme étendue de CPR est utile pour quoi
Pour le transfert d’électrons au P450
Qu’est ce que le complexe de rencontre implique
Des orientations multiples menant à l’orientation unique formant ainsi le complexe spécifique
Que fait le domaine acide du CPR contenant FMN
Il s’associe à un site de liaison basique par des interactions électrostatiques
L’oxydoréductase et le P450 sont liés à quoi
AU réticulum endoplasmique, mais la plus grande surface de la protéine est exposée dans le cytoplasme
C’est quoi la différence entre la mécanique quantique et classique
C’est que selon la mécanique classique les particules qui n’ont pas assez d’énergie pour surmonter une barrière ne seront pas en mesure d’atteindre l’autre côté, mais selon quantique les particules peuvent passer à travers avec une probabilité faible
C’est quoi la raison entre la différence entre quantique et classique
C’est la dualité des particules quand quantique ils ont des propriété d’ondes et de particules
C’est quoi l’effet tunnel quantique
C’est un phénomène dans lequel une particule peut passer à travers une barrière, même si elle n’a pas assez d’énergie pour le faire selon les lois classiques de la physique.
Pourquoi l’effet tunnel est possible
Car les particules ont un comportement ondulatoire et si l’onde traverse la barrière il y a une probabilité que la particule soit de l’autre côté
Pourquoi les électrons peuvent subir l’effet tunnel quantique
car il sont vraiment petit
La théorie relie sur quoi
le facteur e^-BR qui relie l’effet de résistance du milieu au transfert d’électrons (B) et la distance (R)
La valeur de B se situe où
Entre celle déterminée pour des transferts d’électrons intramoléculaires 0,9 A et celle de transfert d’électron in vacuo estimée entre 2,8 et 3,5 A
Les vitesses de transfert d’électrons égale quoi
ils sont égales ou supérieurs à la valeur de kcat
C’est quoi la distance limite de transfert d’électrons pour l’effet tunnel
Jusqu’à 14 A
