cours 3 Flashcards
C’est quoi un effecteur
C’est toute molécule qui modifie la vitesse d’une réaction enzymatique
* effecteur qui augmente l’activité enzymatique = activateur
* effecteur qui diminue
l’activité enzymatique = inhibiteur
C’est quoi l’inhibition enzymatique
L’inhibition (et l’activation) de l’activité enzymatique est un mode de régulation primordial des voies
métaboliques dans la cellule, d’autant que les inhibiteurs naturels peuvent prendre de multiples
formes
Qu’est ce que l’étude de l’effet d’inhibiteurs permet
d’affiner le mécanisme catalytique d’une réaction enzymatique
de mieux connaître la spécificité d’une enzyme
de concevoir de nouveaux inhibiteurs plus sélectifs ou ayant une plus forte affinité.
Développement de médicaments, de tests
diagnostiques, de biosenseurs, etc.
Comment les inhibiteur réversibles interagissent avec les enzymes
De manière non covalente
Comment les inhibiteur irréversibles interagissent avec les enzymes
De manière covalente
Que fait un inhibiteur réversible en se liant à l’enzyme
1)empêcher la fixation de S au site actif en bloquant l’accès
2)provoquer un changement conformationnel au site actif (notamment à l’état de transition) :
l’enzyme sera moins active
Comment est traduite l’affinité d’I (inhibiteur) pour E
Constante d’inhibition: Ki
Ki = constante de dissociation de E*I en E+I
Qu’est ce qui arrive quand la concentration de l’inhibiteur égale à la constante d’inhibition
la moitié des sites actifs est occupée.
L’inhibiteur « idéal » offre quoi
*une forte affinité pour E : Ki est faible
*une forte sélectivité par rapport au S : KM/Ki est élevé.
Que font les inhibiteurs réversibles compétitifs
Les inhibiteurs compétitifs sont en compétition avec le substrat pour fixer le site actif de l’enzyme. Ils empêchent ainsi la liaison entre le substrat et l’enzyme.
Toutefois, si le substrat se fixe à une enzyme, la réaction se fait normalement, aussi vite qu’en absence d’inhibiteur.
C’est quoi l’effet des inhibiteurs réversibles compétitifs sur Km et Vmax
Le Km augmente
Vmax n’est pas modifié
Que font les inhibiteurs réversibles imcompétitifs
Ils se lient au complexe Enzyme-Substrat (ES), puis ils diminuent la vitesse de réaction, car ES est inhibé, mais ils augmente l’affinité du substrat pour l’enzyme
C’est quoi l’effet des inhibiteurs réversibles imcompétitifs sur Km et Vmax
Le Km diminue
Vmax diminue
Que font les inhibiteurs réversibles non-compétitifs simple
Ils se lient à l’enzyme libre ainsi qu’au complexe Enzyme-Substrat.
La fixation entre le substrat et l’enzyme n’est pas affectée par la présence de l’inhibiteur.
Toutefois, la vitesse de la réaction est diminuée.
C’est quoi l’effet des inhibiteurs réversibles nom-compétitifs simple sur Km et Vmax
Km n’est pas modifié
Vmax diminue
Dans une Inhibition réversible COMPÉTITIVE la fixation exclusive cause quoi
Une analogie de structure entre le substrat et l’inhibiteur
Pour une inhibition réversible compétitive qu’est ce qui arrive à cause que le Km augmente
l’addition d’une très forte concentration de substrat déplace l’équilibre E + S ↔ E・S en
faveur de E・S et donc déplace l’équilibre E・I ↔ E + I en faveur de E.
Que sont les deux classes structurales d’enzyme permettent
la catalyse de la même réaction chimique
Type 1: Catalyse par base générale et stabilisation de l’ET
kcat/Km 16.4 s-1µM-1
Fonctionne en monomère
157 résidus
Type 2: Catalyse par proximité
kcat/Km 0.073 s-1µM-1
Fonctionne en homotétramère
78 résidus/protomère
Quand est ce que de la coopérativité peut être observé
lors de l’inhibition d’une enzyme.
Qu’est ce qui quantifie cette coopérativité
Le coefficient de Hill
Est ce que l’affinité de la molécule A pour l’enzyme E peut être différente de l’affinité de la molécule A pour
le complexe EA pour former le complexe EAA.
Oui
C’est quoi IC50
la concentration d’inhibiteur totale nécessaire pour diminuer la vitesse réactionnelle d’une enzyme (ou autre fonction biologique) jusqu’à 50 % de sa valeur maximale non-inhibée, sous des conditions préalablement définies.
Est ce que IC50
varie selon les conditions
expérimentales
Oui
Comment est ce que IC50 est utilisé
IC50 est souvent utilisée comme mesure ‘simple’ de l’effet d’un inhibiteur sur un système
biologique d’intérêt.
est ce que il est nécessaire de respecter les conditions Michaelis-Menten lorsqu’on détermine
IC50
Non, donc on peut travailler avec un échantillon biologique où on ne connaît pas la [S], et y appliquer différents inhibiteurs potentiels pour comparer leur effet.
inhibiteurs réversibles imcompétitifs favorise quoi
la formation du complexe binaire E・S qui lui-même est consommé pour former le complexe ternaire E・S・I.
est ce que l’inhibition incompetitive et non competitive
peut être soulagée par un excès de substrat.
Non
Comment est ce q’un excès de substrat peut causer l’inhibition d’une enzyme
2 molécules de S
peuvent se lier à E. Ce processus naturel est un
mécanisme d’autorégulation de l’activité enzymatique.
La seconde molécule de S
empêcher la première de se positionner
correctement pour la catalyse, ou empêcher la sortie de P pour libérer le
site actif.
Est ce l’inhibition par un inhibiteur réversible non-compétitif simple peut être
soulagée par un excès de substrat.
cette inhibition ne peut PAS être
soulagée par un excès de substrat.
dans une inhibition par un inhibiteur réversible non-compétitif mixte quand est ce que le Km change
Pour le 𝐾 , si l’affinité de l’inhibiteur pour E et ES est différente (a ¹ a’), alors le 𝐾m est modifié par un facteur de (a/a’).
C’est quoi un inactivateur
un inhibiteur irréversible
C’est quoi un inhibiteur suicide
C’est lorsque le nucléophile de l’enzyme réagit avec l’inhibiteur pour former un lien covalent qui inactive l’enzyme irréversiblement
