VL 2-8 Nukleotide und Nukleinsaeuren

Question 1

Wohin wandert die RNA in der Gelelektrophorese und warum?

Answer 1

Zur Anode, weil Phosphatrückgrat negativ geladen ist.

Question 2

Wie ist der Schmelzpunkt der DNA

definiert?

Answer 2

die hälfte der DNA ist denaturiert und liegt einzelsträngig vor

Question 3

peptidbindung vs amidbindung

Answer 3

amide bond forms between a hydroxyl group and an amino group of two molecules

a peptide bond forms between two amino acid molecules during the formation of a peptide chain.

Question 4

In welcher Konfiguration liegt die D-Ribofuranose in RNA vor

Answer 4

beta-D-ribofuranose;

Question 5

In welcher Konfiguration liegt die D-Ribofuranose in DNA vor

Answer 5

beta-D-2-deoxyribofuranose

Question 6

Wohin wandern Proteine bei SDS-Page und warum spielt der PI keine Rolle

Answer 6

Durch die Beladung von Proteinen mit SDS sind sie mit mehreren negativen Ladungen behaftet, weshalb Proteine in der SDS-PAGE zum Plus-Pol wandern.

Question 7

Mit welchem Geraet / technik werden heutzutage Peptide synthetisiert?

Answer 7

1 Schritt:
am N-Terminus geschützte AS mit dem Rest R1 am C-Terminus an Oberfläche der festen Phase gebunden. Dabei wird Chlorid im Zuge einer nukleophilen Substitution abgespalten. Da die AS nun über eine Estergruppe fest an Substrat gebunden ist, wird gespült, um Reaktionsprodukte und überschüssige AS zu entfernen.

2 Schritt:
Schutzgruppe [in der Regel tert-Butyloxycarbonyl (BOC) oder Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc)] abgespalten. Die an polymere Substrat gebundene AS besitzt nun reaktiven (freien) N-Terminus. Es wird ein weiteres Mal gespült, um niedermolekulare Verunreinigungen zu entfernen.

Peptidpropagation
Nun setzt man wiederum eine am N-Terminus geschützte und am C-Terminus aktivierte AS mit dem Rest R2 hinzu. Diese mit Dicyclohexylcarbodiimid (DCC) aktivierte Aminosäure reagiert nun endergonisch mit der bereits gebundenen unter Ausbildung einer Peptidbindung und formaler Abspaltung von Wasser, das als Dicyclohexylharnstoff gebunden wird. Es folgt wiederum eine Spülung. Dann wird die Schutzgruppe der neu hinzugefügten AS entfernt.

Question 8

Ausbildung Disulfidbruecke - was fur eine Reaktion?

Wo?

Answer 8

Redoxreaktion

zwischen zwei Cysteine

Question 9

Alpha helix Sekundaerstruktur - wie definiert?

Answer 9

.

Question 10

Wann sind Alpha helix wahrscheinlicher als beta faltblatt

Answer 10

-

Question 11

Interkalator?

Answer 11

Ethidium Bromide (EtBr)