VL 11 Flashcards

1
Q

Was ist genomische Selektion?

A

Voraussage von Zuchtwerten basierend auf “whole genome marker scores” und phänotypischer Charakterisierung

Voraussagemodelle basierend auf allen verfügbaren Informationen

Hohe Korrelationen zwischen realisiertem Zuchtwert und genomischer Schätzung

Phänotypisierung nur noch zur Erstellung / Validierung von Modellen

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2
Q

Was ist das Ziel von Genomischer Selektion?

A

Voraussage des Phänotyps basierend auf genomweiter Markerinformation

Spezialform von MAS

Sehr hohe Markerdichte über Genom nötig (jeder QTL muss in Linkage Disequilibrium mit mind. einem Marker sein)

SChätzen des kombinierten Effekts von allen QTL auf das Merkmal -> genomic estimated breeding value

Für komplexe, polygen vererbte Merkmale

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3
Q

Wie ist der Workflow bei GS?

A

Bestimmen der Marker-Trait-Assoziation in der Trainingspopulation
- Genomic selection Modell basierend auf phänotypishcen und genotypischen Daten der Trainingspopulation

Selektion basierend auf GS Modell im Zuchtmaterial

S. 6 + 7

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4
Q

GS in Pflanzen- und Tierzucht

A

S. 8 - 14

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5
Q

Was ist Gentechnik?

A

Anwendung von molekularbiologischen Methoden zur Analyse und Veränderung des Genoms
- Analyse des erbgutes mittels molekularen Markern und Genomsequenzierung -> Marker unterstützte Züchtung, keine gentechnische Veränderung

  • dauerhafte Veränderung des Erbgutes durch experimentelle Übertragung von Genen -> Gentechnik im engeren Sinn
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6
Q

Was sind Anwendungsbereiche der Gentechnik in der Landwirtschaft?

A

Pflanzenzüchtung: als diagnostisches Werkzeug (z.B. Marker-gestützte Selektion), für Herstellung transgener Pflanzen

Tierzucht

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7
Q

Genetische Transformation

A

Genetisch stabile Veränderung durch experimentelle Übertragung von Genen (Einbringen fremder DNA in das Erbgut eines Organismus)

Transformierte Pflanzen = transgene Pflanzen
- GVO (gentechnisch veränderter Organismus)
- GMO (genetically modified organism)
Transformierte DNA = Transgen

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8
Q

Transgen - Cisgen

A

Transgen: Übertragung von genen einer anderen Art

Cisgen: Übertragung von Genen derselben Art

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9
Q

Was sind Ziele von GVO in der Züchtung?

A

Gezieltes Einbringen von Genen (erzielen neuer Eigenschaften, Zeitgewinn)

Überwinden der Artgrenzen

Unterbindung von unerwünschten Eigenschaften (toxische oder allergene Substanzen)

Gezielte Herstellung von Metaboliten

Züchtungsforschung

Reduzierter Pesitzideinsatz (Resistenzen)

Steigerung der Stresstoleranz

Verbeserung der Nährstoffaufnahme (biologische Stickstofffixierung)

Verbesserung der Produktequalität

Produktion spezifischer Inhaltsstoffe

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10
Q

Wie ist der Ablauf von genetischer Transformation?

A

Isolierung des gewünschten Zielgens (Anfertigung des Genkonstruktes)

Übertrag des gewünschten Gens (indirekter oder direkter Gentransfer)

Regeneration einer fertilen Pflanze (Selektion auf erfolgreiche Transformation)

Expression des übertragenen Gens (Aktivität oft ungenügend, Spontanes gene-silencing)

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11
Q

Zielgen

A

Einbringen eines neuen Gens
Transgen: Artfremdes Gen
Cisgen: Gen derselbe oder nahverwandten Art

Hemmung eines Zielgens: EInbau der Sequenz in umgekehrter Reihenfolge

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12
Q

Genkonstrukt

A

Transkription eines Transgens erfordert einen geeigneten Promoter, konstitutiv (kontinuierliche Expression) oder spezifisch (in bestimmten Geweben und induzierbar)

Selektion erfolgreicher Transformation wird durch Marker Gen erleichtert

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13
Q

S. 31

A

S. 31

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14
Q

Indirekter, vektorbasierter Gentransfer

A

Agrobacterium tumefaciens
Übertragungsvektor (TI-Plasmid)
Sehr häufig angewendet
Effizienteste Methode für viele Dykotyledonen
Bei Monokotyledonen nicht problemlos (nicht ursprüngliche WIrte von A. tumefaciens)

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15
Q

Direkter, vektorloser Gentransfer

A

Mikroprojektilbeschuss, v.a. Monokotyledonen
Mikroinjektion

Plastidentransformation
- inkubation in DNA Lösung (Polythylenglykol, Elektroporation)

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16
Q

S. 37 - 41

A

S. 37 - 41

17
Q

Genom- Editing

A

Einführen gezielter Mutationen in genomischer DNA
- Forschung
- Medizin
- Landwirtschaft

Universelles System
- spezifischer Zielort
- Spezifische Mutation
- Anwendbar in allen Organismen

18
Q

Crispr-Cas9: gezieltes Genom-Editing

A

Klassische Transformation: zufällig
Mit Crispr-Cas9 kann gezielt jeder Bereich des Genoms editiert werden

19
Q

Crispr-Cas9 Prinzip

A

S. 45
spezifische guide RNA
Cas9 Complex bindet und verursacht Doppelstrangbruch
Reparatur

Crispr-assoziierte Protein 9 Nuklease von Streptococcus pyogenes (Cas9) wird von RNA ans Ziel geführt
Detektiert und degradiert fremde DNA in Bakterien

20
Q

Doppelstrangbrüche NHEJ und HDR

A

NHEJ
- non-homologous-end-joining
- unspezifisch, häufig
- knockout, gene-silencing

HDR
- homology-directed-repair
- spezifisch, selten
- Einbau von Zielsequenzen möglich

21
Q

ANwendungsbereiche GVO

A

Input traits:
- Herbizidresistenz (Roundup, BASTA)
- Insektenresistenz (Bt)
- Virusresistenz
- Pilzresistenz
- Stresstoleranz
- Photosyntheseeffizienz

Output traits:
- Haltbarkeit (FlavrSavr, Tomate)
- Inhaltsstoffe: Fettsäuren, Stärke, Karotin
- Molecular Pharming (Impfstoffe, Proteine)

Breeding tools:
- Männliche Sterilität
- GURT (Terminator Technik)

22
Q

S. 54 - 57

A

54 - 57

23
Q

Input-traits

A

Primärer Nutzen fpr Produzenten

Resistenz gegen Insekten (Mais, Baumwolle, Tomate, Kartoffel)

Herbizid Resistenz / Toleranz (Mais, Soja, Baumwolle, Raps, Reis, Zuckerrübe)

Krankheitsresistenz (Papaya, Kartoffel, Zucchetti)

24
Q

Output-traits

A

Primärer Nutzen für die Konsumenten

Verbesserte Lagerfähigkeit (Tomate)

Verbesserte Inhaltsstoffe

Neue Inhaltsstoffe

Veränderte Zusammensetzung

25
Q

Non-traditional products

A

Pharmaceuticals
Oral vaccines
Phytoremediation
Phytosensors
Biofuels
Energy crops
Plastic

26
Q

Gentechnologie Nutzen

A

Erhöhte Produktivität
Verbesserter Pflanzenschutz
Bessere Lager- / Verarbeitungseigenschaften
Verbesserte Qualität / Verbesserter Nährwert
Gezielte Produktion gewünschter Inhaltsstoffe
Verringerter Pestizideinsatz

27
Q

Gentechnologie Risiken

A

Risiken für die Pflanzenproduktion

Gesundheitsrisiken

Ökologische Risiken

Soziologische Risiken

->Regulierung und Risikoforschung

28
Q

Risiken PFlanzenproduktion

A

Auskreuzung (“gene escape”):
Herbizidresistente Unkräuter
* Keine Superunkräuter (nur gegen jeweiliges Herbizid resistent)
* Resistenzbildung auch spontan
* Risiko des Wirkungsverlustes heutiger Herbizide

Resistenzbildung
* z.B. Bildung gegen Bt resistenter Insekten
* Resistenzmanagement nötig

29
Q

Risiken Gesundheit

A

Allergien durch veränderte Inhaltsstoffe
- Qualität von Proteinen wird z.T. verändert
- umfangreiche Allergietests nötig

Molecular pharming
- Vermischung von Medizinischen Wirkstoffen und Nahrungspflanzen
- Produktion in Pflanzen die nicht zur Nahrungsmittelproduktion verwendet werden

30
Q

Risiken Ökologie

A

Herbizid- / Insektizid Einsatz
- kein höherer Pestizideinsatz mit GVO
- Geringere Aufwandmengen, umweltverträglichere Herbizide

Auskreuzung
- Kreuzbare Arten notwendig
- Nicht nur bei GVO
- Wahrscheinlicher wenn Selektionsvorteil

31
Q

Risiken Gesellschaft

A

Schwierig zu beurteilen

Schlüsseltechnologien liegen in Händen weniger Firmen

Konzentration auf wenige Kulturen -> Verringerung der Agrobiodiversität

32
Q

Generell Folien anschauen

A

Folien anschauen