Virus Flashcards
Quelle est la définition d’un virus?
Virus : parasite obligatoire qui dépend d’une cellule hôte (aussi appelée ‘cellule cible’) pour se répliquer.
Virus: agent infectieux constitué d’un seul acide nucléique = génome, entouré d’un coque protéique = capside, l’ensemble pouvant être (ou non) entouré d’une membrane lipidique = enveloppe.
Quelle est la définition d’un virion?
particule virale complète et capable d’infecter une cellule susceptible.
Qu’est-ce qu’un nucléocapside?
Acide nucléique + capside
Structure générale des virus.
La présence d’une enveloppe est caractéristique de certaines familles virales
Quelles sont les caractéristiques des bactéries (différences avec les virus)
Sont des cellules avec organelles fonctionnelles
Génome = ADN
possèdent leur propre appareillage pour synthétiser leur macromolécules nécessaires à leur reproduction
Se répliquent par fission binaire
Sont sensibles aux antibiotiques.
Quelles sont les caractéristiques des virus (différences avec bactéries)
Ne sont pas considérés “cellules” (ne possèdent pas d’organelles)
Matériel génétique = ADN ou ARN
dépendent obligatoirement de la «cellule hôte» pour se reproduire.
L’acide nucléique viral peut être infectieux
Ne sont pas affectés par les antibiotiques.
La plupart sont «filtrables», voulant dire qu’ils passent à travers les filtres bactériologiques.
Est-il possible d’observer des virus avec des microscopes optiques? Quelle est l’exception?
Non, il faut des microscopes électroniques.
Les virus géants: Les plus gros virus sont à la limite de résolution du microscope ordinaire.
Quelles sont les caractéristiques des virus géants?
- Nouvel ordre pour ces virus: «Mégavirales»
- Mimivirus, Mamavirus, Pandoravirus, Pithovirus.
- Les plus grand des virus géants ont un diamètre > 1 um et un génome >500 kpb
- Génome composé d’ADN
- Se répliquent dans le cytoplasme des amibes
–> Ils s’approchent au diamètre des bactéries, ainsi ces virus ne sont pas filtrables.
Combien de face ont les forme icosaédrique?
20 faces triangulaires.
Quelles sont les caractéristiques du génome des virus?
- ADN ou ARN
- Bicaténaire (ds = double-stranded) ou monocaténaire (ss- single stranded)
- Segmenté ou non segmenté
- Linéaire ou circulaire
- Poids moléculaire très variable (1.5 x 10^6 à 160 x 10^6 daltons)
Quels sont les types de génomes viraux?
Que veut dire le suffixe viridae?
- ADN bicaténaire
- ADN monocaténaire
- ARN Monocaténaire
- ARN Bicaténaire.
D’origine viraux. Quand ça fini par viridae = orignie virale Exemple: Picornaviridae (Pico = petit, RNA = ARN, viridae = d’origine virale)
Qu’est ce que le cycle de réplication virale?
L’ensemble des étapes permettant au virus de se répliquer à l’intérieur d’une cellule hôte.
Requiert une cellule susceptible et permissive à l’infection:
- la cellule susceptible est munie de récepteurs cellulaires spécifiques
- la cellule permissive est dotée des conditions permettant la production de nouveaux virions
Qu’est-ce que la cellule hôte fourni au virus?
Les virus se répliquent uniquement dans les cellules vivantes. La cellule cible devient l’usine pour la replication du virus.
La cellule fournit: l’énergie (ATP), la machinerie cellulaire (enzymes, ribosomes, ARN de transfert), et des petites molecules (acides amines, nucleotides, sels minéraux) qui servant à la replication virale.
Quelles sont les étapes de la réplication virale?
- Attachement – à l’aide d’une protéine à la surface du virus qui reconnaît un récepteur spécifique sur la cellule cible
- Entrée et pénétration (même chose)
- Décapsidation (‘uncoating’)
- Transcription (précoce)
- Traduction (précoce)
- Synthèse des enzymes de réplication
- Réplication de l’acide nucléique
- Transcription (tardive)
- Traduction (tardive)
- Synthèse des protéines structurales
- Assemblage des nucléocapsides
- Libération
Quels sont les deux types de cycle viral?
Réplications dans le cytoplasme
réplication dans le noyaux.
Expliquer le cycle viral dans le cytoplasme.
Génome ARN +: Entre dans la cellule par pinocytose*** (invagination) et relâche son génome de brin positif. Première étape de traduction avec les protéines qui sont formés qui donne lieu aux protéine. Protéines non structurales formées permettent la réplication du génome. Une fois que le génome est répliquée, il y a d’autre protéines produites pour former la capside. Assemblage et relâche virale
Expliquer le cycle viral de la réplication dans le noyau?
Entrée par fusion.
Transcription dans le noyau.
traduction dans le cytoplasme car les ribosomes sont dans le cytoplasme.
3 phases de transcription et traduction:
1- Précoce immédiat
2- Précoce
3- Tardive
Quelle est la classification: les règles de nomenclature?
Ordre (…virales) Ex: Herpesvirales
Familles (…viridae) Ex: Herpèsviridae
- DNA ou RNA
- ds ou ss
- forme de la capside
- enveloppés ou non
Sous-familles (…virinae) Ex: Alphaherpèsvirinae
- poids moléculaire de l’acide nucléique
- diamètre des particules virales
- nombre de capsomères (= unités de capside)
- hôtes infectés, etc
Genres (…virus) Ex: Simplexvirus
Espèces (lettre ou chiffre qualifiant le genre) Ex: Herpesvirus humain 1
Quelles sont les méthodes de diagnostic viral?
Microscopie électronique (technique fastidieuse)
Culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique
PCR
Sérologie (recherche des anticorps dans le sérum par IF ou ELISA)
Comment diagnostique-t-on nous le virus de l’hépatite A? Pourquoi?
Sérologie, parce que il y a des trousses d’élisa qui se vendent et dès qu’il y a un jaunisse –> médicament.
Qu’est-ce que ELISA? Comment ça fonctionne?
Enzyme-linked immunosorbent assay. Lecteur de plaque ou spectrophotométrie.
1- Antigène fixé sur un support solide
2- Fixation de l’anticorps à titrer sur l’antigène
3- Fixation d’un deuxième anticorps marqué qui reconnaît l’anticorps
4- Révélation de l’activité enzymatique; Lecture d’absorbance.
Comment fonctionne la polymérisation en chaine (PCR)
ADN–> Dénaturation–> Hybridaiton des amorces –> Extension –> Duplication –> Dénaturation.
Comment fonctionne la polymérisation en chaine (PCR)
ADN–> Dénaturation–> Hybridaiton des amorces –> Extension –> Duplication –> Dénaturation.
Quelles sont les 4 voies de transmissions virales?
1- Voie respiratoire (Haut et bas)
2- Voie d’entrée gastro-intestinale
3- Voie d’entrée parentérale
4- Voie d’entrée génitale.
Quelles sont les causes de la gastroentérite virale?
Virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
Norovirus
Virus de l’hépatite E
Rotavirus
Entérovirus
Adénovirus (types 40 et 41)
Astrovirus, Sapovirus, Adénovirus, Parvovirus, Coronavirus, Aichavirus
Quelles sont les caractéristiques des virus causant la gastroentérite?
Non-enveloppés
Résistants au chlore, solvants organiques et pH acide*
Résistants à la congélation
Sensibles à l’ébullition
Quelles sont les modes de transmission des gastroentérites virales?
Voie fécale-orale.
Aliments contaminés par l’eau des égouts: mollusques, fruits et légumes.
Selles et vomissures de personnes infectées (>1 million particules virales / g de selles). Une charge virale de 10 virions est suffisante pour causer la gastro.
Transmission peut se faire par contact direct avec la personne infectée ou par contact indirect (si on touche des surfaces contaminées par le virus, ex: poignées de portes, aliments et boissons contaminés).
Transmission facile dans les milieux où les gens sont en contact étroit: écoles, garderies, établissements de soins de longue durée et de soins de santé, navires de croisière.
Résistants à des taux relativement élevés de chlore et à des températures diverses. Beaucoup de ces virus survivent jusqu’à 12 heures sur des surfaces dures et jusqu’à 12 jours sur de la moquette contaminée.
Comment prévenir les gastroentérites virales?
Se laver les mains fréquemment au savon et à l’eau tiède (pendant au moins 20 secondes), notamment après avoir utilisé les toilettes, après avoir changé des couches, et avant de manger et de préparer les aliments. Une telle pratique s’impose davantage si vous avez été malade récemment ou été en contact avec une personne malade.
Manger des aliments cuits à point (minimum 2 minutes à 70°C, idéalement 1½ minutes à 85°C), et encore chauds.
Bien laver fruits et légumes avant de les manger.
Quelles sont les vaccins contre la gastroentérites virales?
Le vaccin Twinrix protège contre l’hépatite A et l’hépatite B. La protection dure ˃ 20 ans et prend effet 2-4 semaines post-vaccination.
Rotarix = vaccin atténué contre le Rotavirus. Pour les nourrissons seulement. Vaccin donné en 2 doses: 1e dose à 6 mois et 2e dose avant 24 mois. Peut causer l’intussusception.
Quelles sont les vaccins contre la gastroentérites virales?
Le vaccin Twinrix protège contre l’hépatite A et l’hépatite B. La protection dure ˃ 20 ans et prend effet 2-4 semaines post-vaccination.
Rotarix = vaccin atténué contre le Rotavirus. Pour les nourrissons seulement. Vaccin donné en 2 doses: 1e dose à 6 mois et 2e dose avant 24 mois. Peut causer l’intussusception.
Quelle est la gestion des manipulateurs d’aliments?
Tout employé souffrant de vomissement et diarrhée doit être libéré immédiatement, et ne doit pas retourner au travail avant une période asymptomatique d’au moins 48 heures.
Pour le virus de l’hépatite A, la période d’exclusion recommandée est de 1 semaine suite à l’apparition de jaunisse*.
L’honnêteté est essentielle: faut encourager les employés à déclarer leurs symptômes dès que possible.
Quelles sont les caractéristiques du modèle Picornaviridae?
Caractéristiques du modèle
virus non enveloppés, résistants dans l’environnement
transmission fécale-orale
Exemple: poliovirus – cause la poliomyélite*
▪ petits virus à RNA+
▪ stables à pH acide (pH 3 à 5)
▪ multiplication dans le tube digestif
▪ très large prédominance des infections inapparentes
▪ diversité clinique des infections apparentes
Quelle est l’étiologie des picrnaviridae?
Etiologie
Le poliovirus fait partie de la famille des Picornaviridae («pico» = petit, RNA…viridae). Le genre Entérovirus est inclus dans cette famille virale. Ce genre est divisé en deux groupes d’espèces susceptibles d’infecter les humains:
Entérovirus (~ 75 sérotypes)
Rhinovirus (~ 99 sérotypes)
Quelle sont les caractéristiques du modèle Coronaviridae?
Virus enveloppés
Génome ARN+
Causent des infections respiratoires, dont certaines sont des zoonoses très pathologiques pour l’humain (SRAS-2003, COVID-19)
Transmission: contact, gouttelettes, aérosol, fécale-orale(?)
