Virologi Flashcards
Hva kjennetegner et virus?
Fellestrekk for alle virus:
- Styrer ikke sin egen proteinsfunksjon
Hva er definisjonen av et virus?
To definisjoner
Genpakke; En “pakke” med gener i seg
Er virus levende?
Hvordan er livssyklusen til virus?
Standard livssyklus for alle virus (bare detaljene er forskjellige):
Virus med kapselkledd membran binder seg til celleoverflaten , kommer inn i cytoplasma og frisetter genene.
Starter prosessene med replikasjon og proteinproduksjon.
- Foregår parallelt.
- Replikasjonsresultatet går sammen med proteinene som er dannet, og danner en ny kapsel som går ut av cellen igjen.
Hvor finner man virus?
Noen virus gir sykdom, mens andre bosetter seg i verten uten å gi sykdom.
Det meste av viruset i vårt genom er inaktivt, men noe er og aktivt.
Hvor infisert er vi av virus?
Mennesker
Hva mener man med “virusets dynamiske verden”?
RNA-virus:
Endrer seg hyppig og raskt.
Corona-viruset er blant de stabile RNA-virusene.
Eks. på virus som har forsvunnet:
Virus som gav “Svettesyken” i England på 1500-tallet finner man ikke spor igjen av.
Man tror at virus er mer vanlig i dag enn før.
Hva er et eks. på koevolusjon mellom virus og pattedyr?
Tror man
Retrovirus (i slekt med HIV-viruset):
Har gener i vårt genom som har blitt en fungerende struktur i vår kropp; syncytiotrofoblast.
- Grunn til at pattedyr ble placentale dyr(?)
Hva er et virion?
Tubulær = helikal; helixformet.
Yttermembran:
- "Stjålet" fra vertscellen.
Hva gjør klassifikasjonen av virus vanskelig?
Hva er Baltimores metode?
Virusklassifikasjon
Hvilke syv grupper gir Baltimores klassifikasjon oss?
Nevn et eks. for hver enkel gruppe?
Det som kjennetegner et retrovirus (f.eks. HIV) er at denne gruppen virus gjennomgår revers transkripsjon (danner DNA fra RNA):
- I hele biosfæren er det kun hos retrovirus (og hepadnavirus) at vi kjenner til dette fenomenet = Hep. B
Hva kjennetegner HS1-virus?
Herpesvirus kan gi:
- Munnsår
- Encefalitt → høy dødelighet.
Koder for 80 proteiner:
- Mye for et virus.
Generelt for dobbeltrådet virus:
- Komplekse
- Koder for en del proteiner.
- Store viruspartikler.
Hva kjennetegner Adenovirus?
Lange spikes er karakteristisk for Adenovirus.
Generelt for dobbeltrådet virus:
- Komplekse
- Koder for en del proteiner.
- Store viruspartikler.
Hva kjennetegner Parvovirus?
Parovirus B19:
- Erythema infectiosum = 5. barnesykdom.
Humant bocavirus:
- Luftveisinfeksjoner.
Hva kjennetegner Polioviruset?
Stoppet av effektiv vaksinasjon.
Muterer hyppig.
ssRNA(+)-gruppen inneholder og Coronaviruset.
Hva kjennetegner influensaviruset?
Hva kjennetegner HIV-1?
Reverstranskriberende virus:
RNA-genom, men blir omdannet til DNA i vertscellen.
- Kan gå inn vertscellens kjernemembran og bli en del av cellens DNA for resten av cellens liv.
- Unngår på denne måten en immunrespons.
Dannelsen av provirus er et sentralt trinn i HIV-replikasjonen.
Den korrekte beskrivelsen av dette fenomenet er at:
Det er et dobbelttrådet viralt DNA som er integrert i vertscellens DNA.
HIV-RNA reverstranskriberes til en DNA-kopi, og integreres som et dobbelttrådet viralt DNA i cellekjernes humane DNA.
Her kan det ligge laten uten aktiv replikasjon for senere å tjene som templat for aktiv virusreplikasjon med dannelse av mRNA.
Hva kjennetegner Hep.B virus?
Genomet er delvis enkelttrådet og delvis dobbeltrådet.
- Går via DNA, blir til RNA før den så blir til DNA før den går ut av cellen.
10 til 20% får kronisk hepatitt som gir leverkreft.
Hva kjennetegner virale genomer?
Polycistronisk mRNA;
- mRNA, når det er dannet, kan kode flere ulike proteiner.
Bakterier har lite introner.
Hva er bakteriofager?
Kan dette gi sykdom hos mennesker?
Noen bakteriofager inneholder kun RNA:
- De fleste bakteriofager inneholder DNA.
Bakterien får med seg et ekstra toksin som gir systemisk utslett (sirkulerer med blod).
Hvordan er den generelle livsyklusen til virus?
Repetisjon
Illustrasjonen øverst: Generelt bilde av livssyklusen til et virus:
1 Kapsel entreer cellen via kappeproteiner:
- Endocytose
2 Virusgenom slippes løs i cellen.
3 Splitting av proteinproduksjon og nukleinsyresyntese:
- Avhengig av genomet kan proteinsyntesen skje før syntese.
4 Dannelse av ny viruspartikkel.
5 Utskillelse av virus.
Prosessen kan skje uten å skade celle:
- Kan skje ved at cellen utmattes og dør.
- Enkelte virus kan “sprenge” cellen.
Modning:
- Proteinene kan endre konformasjon, noe som skjer hos enkelte virus.
Hvordan bindes virus til humane celler ved infeksjon?
Koppevirus:
- Viruset satt seg bare på menneskeceller.
Nevn noen virus som er avhengig av koreseptorer for å invadere en human celle
Koreseptoren (for HIV) er nødvendig for å få på plass alle konformasjonsendringene for å få kunne entre en celle.
Hvordan kan virus invadere vertsceller?
Fornuftig for ett virus å ha en membran:
- Membranen kan henge igjen i vertscellens membran, mens viruspartiklene slippes inn i cellen.
- Kommer lettere inn i cellen, men er mer sårbart utenfor vertscellen.
Hvor og hvordan skjer syntesefasen av viruspartikler?
Proteinssyntesen og DNA/RNA syntesen skjer ofte parallelt.
Hvordan er syntesen til poliovirus?
Proteinssyntesen må skje først for å få dannet RNA polymerase.
Hvordan foregår syntesen av herpesviruset?
Mer finjustert mekanisme enn hos polioviruset.
Hvordan foregår syntesen av genomisk DNA/RNA?
Hva er spesielt med retrovirus?
Hvordan reguleres DNA/RNA-syntesen til virus?
**Sene proteiner; kapselproteinene.**
**Måten DNA-virus løser reguleringen på gir flere levedyktige virus.**
**Low-fidelity reproduksjon gir:**
Flere symptomer
Mer celledød
Færre virus som kan formere seg.
**Finnes vaksine mot Rotavirus**
Hvor skjer partikkeldannelsen av virus?
Hvordan dannes kapsidene til virus?
Hvordan frisettes virus fra vertscellen?
Eks. med herpes
Hvordan foregår fritsetting av virus som ikke har membran?
Hvordan virker Oseltamivir?
Virkning av medikament (Oseltamivir) hemmer neuraminidase:
- Enzym som sørger for at neuraminsyren blir kuttet opp, slik at bindingen mellom viruset og vertscellen brytes.
Hvilke inngangsporter har virus for å gi infeksjon?
Utvalg av virus; vanlige typer
På hvert av inngangsportene har man et immunsystem som forhindrer virusinfeksjoner.
Hvilken immunitet har man mot virus?
Slimhinner; er og en fysisk barriere.
Biologiske barrierer:
- Må være en reseptor som virus kan sette seg på, f.eks.: Corona → ACH-reseptor.
Hvilke oppgaver har det iboende immunsystemet?
Autofagi:
- Plukke opp proteiner/organeller som ikke fungerer og nedbryte disse.
- Kan og skje med viruspartikler.
Apoptose:
- System som trigges av direkte skade/metabolsk stress og fremmede proteiner → “programmert celledød”.
Hva er det “medfødte immunforsvaret”?
Intrikat system.
Mønstergjenkjenning:
- Virus inneholder partikler som ikke finnes naturlig i humane celler.
Finnes hukommelse i liten grad:
- Spesielt NK-celler/makrofager.
## Footnote
[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMra2206346](http://)
Hvordan gjenkjennes virus av kroppen?
Dobbelttrådet RNA
- Sterkeste triggeren for en immunreaksjon.
Proteiner:
- Mange repeterte områder som ikke er vanlig hos mennesket.
Hva slags type reaksjon fører til immunaktivering ved infeksjon?
Viral
Hvordan reagerer cellen?
NF𝛋B er viktig!
## Footnote
[https://www.nature.com/articles/nri2436](http://)
Hvilke effektormolekyler gjelder ved virale infeksjoner?
IFN alpha og beta:
- Antivirale.
IFN beta:
- Lokalt i vevet.
Hvordan brukes interferoner medikamentelt?
Hvilke effekter har interferoner?
Hepatitt C behandling:
- Ofte opp mot ett år → vanskelig for pasienter.
Interferoner hemmer spesielt nukleinsyresyntesen hos virus:
- Generelt; hemming av virusets livssyklus.
Hva er inflammasom?
Hvilke rolle har det adaptive immunforsvaret mot virale infeksjoner?
Hvordan ser kurven ut for virusreplikasjon ved en akutt infeksjon?
Ulike hovedmønstre for infeksjoner:
Akutt infeksjon:
- Virusreplikasjon når et vist nivå som trigger immunsystemet.
- Om man får symptomer er avhengig om viruset blir bekjempet raskt eller ikke.
Hva mener man med:
- Produktiv infeksjon
- Abortiv infeksjon
- Akutt infeksjon
- Kronisk/persiterende infeksjon
- Latent infeksjon
- Virulens
Virologi
Abortiv infeksjon:
- Skyldes rask respons av det medfødte immunforsvaret som hindrer infeksjon.
- Opplever ingen symptomer.
Latente virus:
- Herpes-virus.
Virulens:
- Jo mer virulent et virus er, jo alvorlige sykdom gir det.
Hva er Kocks postulater?
Er de egnet i dag?
Postulater
Kocks; fant tuberculum-basillen.
- Forsket på anthrax/miltbrann.
Postulatene egner bedre for bakterier enn for virus:
- Vanskelig å dyrke frem virus.
Postulater i dag:
Vanskelig å konkludere med dyremodeller:
- Vanskelig å overføre kunnskap blant arter.
Serologi:
“Serologi er læren om blodserum, det vil si blodvæske uten blodceller og koagulasjonsfaktorer. I serologien undersøkes blodserumets immunologiske egenskaper gjennom påvisning av forskjellige antigener, enzymer og andre proteiner ved hjelp av sera som inneholder antistoffer”.
Hva er kasualitet?
Kausalitet:
“… betyr årsak eller grunn, og brukes om en årsakssammenheng, det vil si når det foreligger et påvirkningsforhold mellom to fenomener” (SNL)
Hva er det gir sykdom i forb. med virusinfeksjon?
Generelle infeksjoner
Interleukin-2; Cytokin som forårsaker feber ved å påvirke hypofysen.
Hva er det som gir symptomene ved hep.B infeksjon?
Hepatitt B smitter via:
- Blod
- Brukte sprøyter
- Seksuelt
Setter seg på hepatocytter som har en passende reseptor.
Nyfødte barn med hep. B er ofte asymptomatiske.
Hva er en infeksjon hvis virus-vert interaksjonen er i likevekt/ikke-likevekt?
Hva er asymptomatiske infeksjoner et uttrykk for?
Virologi
Hva slags infeksjonsmønster har:
- Rhinovirus
- Lymphocytic choriomeningitis virus
- Herpes simpleks
- HIV
Når et virus går i en fase der det ikke produseres partikler kalles dette for latens.
Hva kjennetegner akutte virale infeksjoner?
Alvorlige forløp:
Virus som kommer inn i vår populasjon:
- Mennesket er en ny vert.
Viruset har et annet dyr som reservoar, f.eks. Dengu-virus:
- Adaptasjonen skjer i mygg (som er virusets reservoar).
- Gir mer alvorlig sykdom hos mennesket.
“Zoonoser er infeksjonssykdommer som kan smitte fra dyr til mennesker”.
Hva kjenntegner kronisk persisterende og latente virusinfeksjoner?
Herpes kan i enkelte tilfeller gi alvorlig encefalitt.
Hvilke bidrag har verten og viruset ved tvekampen?
Latente og persisterende infeksjoner
På hvilken måte unnviker hep.c immunsystemet?
Produserer en rekke substanser som virker som mottiltak mot kaskadesystemene.
Hvordan klarer HIV-viruset å unnvike immunsystemet?
En metode; finnes flere
Hva er latens?
Nevn en gruppe virus som er latent?
Hva mener man med virulensfaktorer?
Virologi
“Virulens er en mikroorganismes evne til å fremkalle sykdom. Hvor virulent en mikroorganisme er, kan avgjøres ut fra hvor mange personer i en befolkning som blir syke hvis de utsettes for mikroorganismen. Et annet mål for virulens er hvor raskt mikroorganismen og dermed infeksjonen sprer seg gjennom kroppen, og hvor stor sykelighet og dødelighet infeksjonssykdommen har.”
Virulensfaktorer handler om proteiner eller molekyler som er involvert i virusets evne til å danne sykdom.
Hva er influensavirusets virulensfaktor?
Som eks.
Nevn et virus der virulensfaktoren er å fremme spredning?
Rabies; sprer seg retrograd til hjernen.
Hydrofobi:
- Viruset hemmer svelgrefleksen, og fører til en fobi mot vann.
Behandling:
- Setter vaksinen etter et bitt.
- Jo tidligere man setter vaksinen, jo bedre er prognosen.
Kan smitte alle rovdyr.
Hva er papillomavirusets virulesfaktor?
Hvilket virus har direkte celleskade som sin virulensfaktor?
NSP4:
- Endre saltbalansen, og fører til diare.
Hva er det som avgjør symptombildet ved virusinfeksjoner?
Hvilken forskjell har alder å si ved virusinfeksjoner?
Fugler har alpha 2,3 sialinsyre i sine luftveier.
- Er man eksponert for fugleinfluensa hos fugler, kan dette sette seg på våre cellereseptorer i nedre luftveier, og gi alvorlig og dødelig lungebetennelse.
Genetisk variasjon i de medfødte kaskadereaksjonene, kan ha betydning for virusinfeksjoner.
Varicella; gir mindre sykdom hos barn, men alvorlig sykdom hos eldre.
Hva er generaliserte symptomer ved virusinfeksjoner?
Hva slags type hudsymptom kan oppstå ved virusinfeksjoner?
Vesikler:
- Vannkopper og Hånd-fot-munnsykddom.
- Dannes intradermalt.
Hva avgjør symptombildet ved virale luftveisinfeksjoner?
Hva slags fysiologisk årsak gir symptomer?
Nysing/hosing:
- Gunstig for infisert individ da det blir kvitt virus, men bra for viruset som blir spredt i populasjonen.
Astma:
- Kompleks immunrespons på en viral legemet, som kan gi astma(?)
Hva slags symptomer får man ved gastroenteritt, og hva er årsaken til symptomene?
Hva kjennetegner symptombildet ved leverinfeksjoner?
Spesifikk lipoproteiner på viruset som setter seg på levercellens reseptorer.
Hva kjennetegner flåttbåren encefalitt?
Viremi er en medisinsk tilstand der virus entrer blodstrømmen, og på det måten får tilgang til resten av kroppens vev.
Smertene i skulderen:
- Radikulitt; infeksjon av nevroner i ryggmargen.
Vårt immunsystem kan gi symptomer og celleskader.
Hvilke metoder bruker man for å diagnostisere virusinfeksjoner?
Hva er IgG-aviditetstester?
Jo lengre tid det går, jo bedre vil IgG-antistoffene feste seg til antigener.
Hva er “Western blot”?
Western blot:
Brukes på HIV.
A; Western Blot:
Virusekstrakt separert med elektroforese.
- Kjører pasientens antistoff opp mot dette.
Hvilken genteknologisk metode er den desisert mest brukte metoden i dag?
Hvilken annen metode finnes?
Hva kjennetegner PCR?
Syndromic testing:
Gjøres ved encefalitter.
CT-verdi:
Punktet på grafen der man begynner å se at virus/bakteriepartikler begynner å dannes.
- Mye virus i prøven, mindre X-verdi.
- Kan benyttes til å danne en regresjonslinje.
Hva bruker man sekvensering til ved virusdiagnostikk?
Hvilke tre slekter består herpesvirus av?
Herpesvirus er delt inn i tre slekter.
HHV-6 og HHV-7:
- Forårsaker Exanthema subitum (den fjerde barnesykdom).
EBV:
- Kyssesyken, og en del komplikasjoner ved transplantasjon.
HHV-8:
- Forårsaker en spesiell hudtumor sykdom som rammer HIV og AIDS rammede pasienter.
- Kan og ramme andre immunsupprimerte pasienter.
Hva kjennetegner CMV?
Jo eldre man blir, jo vanligere er det med symptomer fra CMV-infeksjon.
Hvilke smittemåter har CMV?
Hvilke vertsceller har CMV?
Hvordan er det kliniske bildet ved CMV-infeksjon for immunkompentente?
Hempatomegali = forstørret lever.
Splenomegali = forstørret milt.
Hva kjennetegner medfødt CMV-infeksjon?
Ikke uvanlig med spontanabort.
Microcefali; “liten hjerne”
De som får lite symptomer, får gjerne hørselstap:
- Går uoppdaget gjennom småbarnsalderen.
Hva er risikoen hos individer med organtransplantasjon og CMV?
Hvilke virus er assosiert med LVI?
Opptrer virus alltid alene ved infeksjon?
Ikke uvanlig å finne ulike virus i prøver fra små barn:
- Tolkningsproblematikk.
Når bruker man passiv immunisering?
Brukes mye i medisinen.
Hvilke vaksineformer har man?
Finnes og mRNA-vaksiner.
Hva bør en god vaksine gi?
Respons
Hvordan fremstilles vaksiner?
Attenuere:
Mister sykdomsfremkallende evner.
- Risikabel vei å gå → kan bli aktivt igjen.
Fraksjonere:
Deler av viruset blir injisert i vert.
Adenovirus er blitt brukt som vektor.
Astra/Zeneca vaksinen bruker denne vektormetoden.
DNA-vaksiner:
Fører deler av et DNA-molekyl fra ett agens inn i våre celler, og får verten til å uttrykke proteinene på den måten.
Likt mRNA-vaksinen.
Bruker samme strategi, bare med mRNA og ikke DNA.
Hva kjennetegner inaktiverte vaksiner?
Antistoffmediert immunitet.
Hva kjennetegner attenuert vaksine?
Vokser godt i apeceller, men mister egenskaper som gjør det aktivt i mennesker.
Ved at viruset får hjelp til å infisere ulike celler (ved at det overføres ved bruk av pipetter i laboratoriet), mister det egenskaper som gjør at det kan overleve i dråper.
De fleste overflatemolekylene vil ikke ha endret seg → initierer immunitet hos mennesker.
“Kontraindikasjoner er forhold som i et spesielt tilfelle taler imot en viss handlemåte, f.eks. behandlingsmetode. Det motsatte er indikasjon”
Hva kjennetegner rekombinante vaksiner?
Beskytter vaksiner 100%?
Hvorfor har man ingen vaksiner mot HIV?
Hva er angrepspunktet for antivirale midler?
En mulighet er å hindre virusspesifikke enzymer, slik som hos RNA-virus
Hvilke generelle egenskaper har antivirale midler?
“Residiv er gjennoppblussing av en sykdom etter at den tilsynelatende er blitt helbredet … Ett residiv er det samme som et tilbakfall.”
Hvordan virker Aciklovir
Aciklovir reduserer dødeligheten ved en herpesencefalitt:
- Redusert fra 70% til 20%.
Hvilke andre antivirale midler brukes?
Mot virus i herpesfamilien
Hvilke midler brukes mot HIV?
Hvilke midler brukes mot influensa?
Vanskelig å behandle luftveisinfeksjoner, f.eks. influensa:
- Virusreplikasjonen skjer før man får symptomer.
Oseltamivir:
Virker på nevramidase.
- Kutter forankringen mellom molekylene som binder seg på reseptorene til vertscellen.
- Middelet er en nevraminidasehemmer.
- Nevraminidase er nødvendig for at viruset skal frisettes fra cellen etter knoppskyting (budding) fra cellemembranen.
Middelet sørger for at viruset blir hengende på cellen og hindrer dermed spredning til nye celler.
Hvilke midler brukes mot HCV/HBV?
Hvilke mobile genmateriale finnes?
Finnes mindre enheter enn virus som kan gi sykdom.
Transposonsvarianter = “hoppegener”.
DNA transposon; Gensegmenter som kan skifte domene i genomet.
Retrotransposoner; “copy and paste”
- Ligger i genomet, og minner om et retrovirus.
- mRNA dannes av genomet, og ved hjelp av en revers transkriptase, som kodes i det samme genområdet, danner et DNA-segment som kan plassere seg et annet sted i genomet.
- Kan påvirke cellesyklus, og gi tumordannelse.
Dette skjer kun i en celle → ikke smittsomme.
Nevn noen eks. på subvirale partikler?
Hva er prioner?
Prioner påvirker særlig overflateproteiner i hjernen.
Prionsykdommer kan ramme både mennesker og dyr (skrapesyke, kugalskap, skrantesyke etc.) og medfører vakuolisering i hjernen som fører til alvorlige nevrologiske symptomer og død. Det skyldes akkumulering av et spesielt protein kalt PrPscI. En egenskap som er forbundet med dette smittestoffet er at strukturen er flat (beta-sheet).
- PrPsc er ikke et enzym og produserer ikke toksiner. Det består av molekyler som er omdannet fra globulær (“normal”) til flat strukt og akkumuleres i hjernen som et meget robust og resistent protein.
Iatrogen:
- Overført veksthormon fra hypofysen fra en avdød pasient til et levende mennesket.
Hvilket evolusjonære opphav har virus?
