v.12 (10/11) Genomevolution, genfamiljer, transposition Flashcards
Sangermetoden för DNA-sekvensering kom detta år.
år 1977
Det första fullständiga humana genomet blir sekvenserat detta år.
år 2000
Den biologiska variationen på jorden beskrivs via tre huvudgrupper/riken/domäner, vilka?
- Bakterier (Eubakterier)
- Arkéer (Arkebakterier)
- Eukaryoter
Vad är Common encestor cell?
Man menar att allt liv har samma ursprung, och att det sedan grenat ut från denna cell.
Hur har man tagit reda på hur de tre organismerna är besläktade med varandra?
För att förstå hur de tre organismerna är besläktade har man tittat på DNA i olika organismerna. I början tittade man bara på antalet baser/nukleotider i varje organism.
Hur många diploida resp. haploida kromosomer har människan?
Människan har 23 diploida kromosomer eller 46 haploida kromosomer (där 44 st är autosomala och 2 könskromosomer)
Vad är den genetiska koden för nåt?
Den information som varje triplett av nukleotider ger för aminosyra.
Vad är det som tyder på att mitokondrien har ett eget ursprung?
Baserna i det mitokondriella genomet kodar enligt en annan genetisk kod än genomet i våra cellkärnor.
Vad hos mitokondrien talar för att den ursprungligen har varit en bakterie?
Mitokondrien är cirkelformad och har cirkulära kromosomer. Det talar därför att den är från bakterier, eftersom bakterier har cirkulära kromosomer.
Vad är likheterna och skillnaderna mellan genomet i cellkärnan och mitokondriegenomet sett till kodning?
Mitokondriegenomet kodar för eget tRNA (som den behöver för att translatera de proteiner som den behöver) och eget rRNA (för att kunna sköta translation).
I övrigt kodar det mitokondriella genomet för samma saker som det mänskliga genomet.
Hur många baser och gener består mitokondriegenomet av?
Mitokondriegenomet består av 16 600 baser och 37 gener.
Var kommer mitokondrierna ifrån vid befruktning? Vad händer med alla andra mitokondrier?
Mitokondrierna kommer från kvinnorna vid befruktningen.
Mannens mitokondrier plockas selektivt bort och etableras inte i zygoten.
Vad innebär en somatisk cell?
Alla kroppens celler utom könscellerna.
Hur skiljer sig mitokondriegenomet mot mänskliga genomet sett till antalet
→ baser → kromosomer → gener → procent kodande sekvens → introner → antal kopior per cell
Mänskliga genomet: • 3 000 000 000 baser • 23 haploida kromosomer • 22 000 gener • 1,5 % av DNA:t består av kodande sekvenser • Har introner i många gener • 2 kopior av generna per somatisk cell
Mitokondriella genomet: • 16 600 baser • 1 haploid molekyl • 37 gener • 100 % kodande sekvenser • Har inga introner alls • 1000-tals kopior i varje somatisk cell
Vad betyder haploid?
Enkel kromosomuppsättning (n)
Vad betyder diploid?
Dubbel kromosomuppsättning (2n)
Vad betyder tetraploid?
Fyra uppsättningar kromosomer (4n)
Varför tror man att vi har diploida celler i kroppen?
Troligen eftersom att rekombination ska kunna ske och ge snabbt nya egenskaper och driva på evolutionen.
Vad krävs för att homologa gener ska komma till?
Att de kommer från en och samma ursprungsgen.
Hur kommer Paraloga gener till?
När en ursprungsgen dupliceras i samma organism.
Hur kommer Ortologa gener till?
Dessa gener har uppkommit när en ursprungsgen har delat sig.
För att titta på funktioner för DNA:t ska man titta på … ?
Proteinerna
Vad är en proteindomän?
En del av gen som kodar för en specifik del i protein.
Vad är en genfamilj?
En grupp gener som kodar för proteiner med olika funktion, där funktionerna hänger ihop med varandra (t.ex. verkar i immunförsvaret). Delar av dessa proteiner liknar varandra och återkommer i gener.
