v.1 Gener Flashcards

1
Q

Vad består en nukleotid av?

A

Socker, fosfat och en bas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vilken diameter har en DNA-sträng?

A

2 nanometer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad heter de fyra baserna i DNA och vilka av dessa basparar med varandra?

A

Adenin och TyminGuanin och Cytosin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hur mycket motsvarar ett varv i DNA-strängen?

A

10,4 nukleotider eller 3,4 nm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är psuedogener?

A

Det är icke funktionella gener som liknar fungerande gener, men som inte ger upphov till protein.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Beskriv histonens uppbyggnad och dess funktion.

A

En histon är 11 nm i diameter och är uppdelad i 8 histondelar: H2A, H2B, H3 och H4. Histoner lindar DNA runt sig och reglerar DNA:ts struktur. En histon har ca 147 nukleotider lindade runt sig.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hur många gener har en människa? Hur många nukleotidpar motsvarar en gen i snitt?

A

En människa har ca 25 000 gener, där snittstorleken är 27 000 nukleotidpar per gen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad ingår i kromatin?

A

DNA, histoner och associerade proteiner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hur många kromosomer har människan?

A

46 st totalt.44 st autosomala och 2 st könskromosomer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad är heterokromatin?

A

Tätt packat kromatin med mindre tillgänglig(a) gen(er).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är konstitutivt heterokromatin?

A

Tätt packat kromatin som är genfattigt och mindre tillgängligt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är eukromatin?

A

Öppet kromatin med mer tillgänglig(a) gen(er).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är en gen?

A

En DNA-sekvens som utgör en information som översätts till RNA (och ev. vidare till protein).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad är fakultativt heterokromatin?

A

Tätt packat kromatin som är geninnehållande och mindre tillgängligt. Kan övergå till eukromatin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad omvandlas till vad vid transkription?

A

DNA → pre-mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad omvandlas till vad vid RNA-processing?

A

pre-mRNA → mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad omvandlas till vad vid translation?

A

mRNA → polypeptid från ribosom → protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vad är en promotor?

A

En regulatorisk region framför engensom styr uttrycket av genen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vilka delar består en gen av?

A

● 5’ untranslated region (inledande, icke-kodande del av exon)● Exon (proteinkodande del)● Intron (icke-proteinkodande del)● 3’ untranslated region (avslutande, icke-kodande del av exon)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad är epigenetik?

A

Cellulär information som påverkar genuttryck, utöver själva DNA-sekvensen, och som ärvs från modercell till dottercell vid celldelning.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad är metylering? Hur går det till?

A

Metylering = avstängdhetMetylering förändrar tillgängligheten för DNA-strängen och hur andra proteiner kan binda till den genom att en metylgrupp sätts fast på t.ex. histoner eller cytosin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad är CpG islands? Var brukar de vara lokaliserade?

A

De är CG-rika områden i genomet. 70-80% av dessa är metylerade. De finns ofta vid geners start (d.v.s. i 5’-änden).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vad är acetylering? Hur går det till?

A

Acetylering = gen påslagenAcetylering förändrar tillgängligheten för DNA-strängen och hur andra proteiner kan binda till den genom att en acetylgrupp sätts fast på t.ex. histoner eller cytosin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad sköter acetyleringen?

A

Histon acetyl transferaser (HAT).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vad sköter metyleringen?

A

DNA metyl transferaser:DNMT1 upprätthåller metyleringar (genom att metylera halvmetylerat DNA).DNMT3A och DNMT3B metylerar ometylerat DNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Vad innebär deacetylering?Vad är det som sköter deacetyleringen?

A

Deacetylering av historier, vilket leder till avstängning av gener.Histon deacetylaser (HDACs) sköter detta.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Vad utgör en nukleosom?

A

En histon med runtlindat DNA samt efterhängande linker-DNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Vart på kromosomen finns heterokromatin resp. eukromatin?

A

Eukromatinfinns i regel någonstans på de fyra armarna.Heterokromatinfinns i regel i mitten av kromosomen, nära centromeren.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Hur lyder molekylärbiologins centrala dogm?

A

DNA kan replikeras för att återbilda DNA.DNA kan transkriberas för att bilda RNA.RNA kan translateras och verka som en förelaga till protein.

30
Q

Varför är RNA oftast instabilare än DNA?

A

Därför att det oftast är enkelsträngat, medan DNA är dubbelsträngat.

31
Q

Vad kallas bindningarna som binder ihop DNA (och även RNA)?

A

Fosfodiesterbindningar.

32
Q

Vad heter strukturen som utför transkriptionen av RNA?

A

RNA-polymeraser.

33
Q

Vad gör RNA-polymeras I?

A

Syntetiserar ribosomalt RNA (rRNA), som bygger upp ribosomerna.

34
Q

Vad gör RNA-polymeras II?

A

Syntetiserar proteinkodande RNA (mRNA)och en del små RNA, t.ex. snRNA och snoRNA.

35
Q

Hur jobbar RNA-polymeras (i korta drag)?

A

Öppnar först upp DNA:t, läser sedan av det, stänger det och spottar ut ett nysyntetiserat RNA.

36
Q

I vilken riktning läser RNA-polymeras av DNA-strängen? Vad bildas?

A

RNA-polymeraset läser av ena DNA-strängen i 3’ till 5’-riktning och bildar en kopia av den andra DNA-strängen.Om den t.ex. läser ATTG så bildas en kopia i form av TAAC.

37
Q

Vad är det som driver RNA-polymeraset framåt?

A

Energin i trifosfaterna.

38
Q

Vad kallas den DNA-sträng som läses av RNA-polymeraset?

A

Template eller Anti-sense.

39
Q

Vad kallas den DNA-sträng som inte läses av RNA-polymeraset?

A

Non-template eller Sense.

40
Q

Vilka baser finns i RNA?

A

● Adenin (A)● Uracil (U)● Cytosin (C)● Guanin (G)

41
Q

Var börjar transkriptionen på en gen?

A

På första exonet, som har en 5’-UTR. Den kodande frekvensen kan dock börja senare.

42
Q

Vad är 5’-caping?

A

Ett sätt att skydda mRNA från nedbrytning genom en 7-metylguanosinände i 5’-änden.

43
Q

Vad är splicing? Hur går det till?

A

En process där introner klipps bort från preRNA och exonerna fogas samman till mRNA.I processen binds 5’-änden av intronen med en branch point på intronen. Det som uppstår då är en lariatmolekyl som klyvs bort. Kvar blir exonerna.

44
Q

Vad utför splicingen? Vad består den av?

A

Spliceosom.Den består av snRNPs (small nuclear ribonuclear protein particles) som är uppbyggda av proteinkomplex som innehåller RNA: U1, U2, U4, U5, U6

45
Q

Vad är alternativ splicing?

A

När en viss kombination av exoner bildar ett eget mRNA genom uteslutning.

46
Q

Vad styr splicingen?

A

Splicing-inhibitors och splicing-enhancers. De är DNA-sekvenser som styr splicingen.

47
Q

Vad gör RNA-polymeras III?

A

Syntetiserar transfer RNA (tRNA), som är viktig för translationen, samt några små RNA.

48
Q

Vad innebär polyadenylering och poly-A-svans?

A

En modifiering av RNA:t där en 60 till 200 baspar lång sekvens av adeninrester (poly-A-svansen) appliceras i slutet av mRNA-transkriptet.

49
Q

Vad initierar polyadenylering?

A

Poly(A)signal, som består av sekvensen AAUAAA.

50
Q

Vilka faktorer rekryteras under polyadenyleringen?

A

CPSF, CStF, CFI, CFII och PAP.

51
Q

Vad betyder CPSF och vad gör den?

A

Cleavage and polyadenylation specificity factor.Binder till AAUAAA.

52
Q

Vad betyder CStF och vad gör den?

A

Cleavage stimulation factor.Binder till G/U-rik frekvens.

53
Q

Vad betyder CFI och CFII och vad gör de?

A

Cleavage factor I och II.De klyver RNA-transkriptet och finns mellan AAUAAA och G/U-rika frekvensen.

54
Q

Vad betyder PAP och vad gör den?

A

Poly(A) polymeras.Ett enzym som sätter på en lång svans av 200-250 Adenosinfosfater (AAAA… ). Efter dessa slutar översättningen till RNA.

55
Q

Vad händer med rRNA när det har syntetiserats?

A

Det modifieras med metylering och acetylering. Sedan klyvs det till ribosomkomponenter:● 18S rRNA, bygger ribosomens lilla subenhet.● 5,8S rRNA och 28 S rRNA, bygger ribosomens stora subenhet.

56
Q

Vilka två delar består ribosomen av? Vad är deras funktioner?

A

● Lilla subenheten: binder mRNA● Stora subenheten: binder tRNA på tre platser (E, P, A) och förflyttar sig i 5’ → 3’ riktning allt eftersom tRNA kommer med aminosyror som binds till polypeptidkedjorna som Ribosomen spottar ut.

57
Q

Vad är en promotorsekvens och vad innehåller den?

A

Den innehåller flera reglerande sekvenselement som bestämmer när och var en gen ska uttryckas:● TATAA-box● Core promotor● Generella transkriptionsfaktorer

58
Q

Vad är en TATA-box?

A

En promotor-region som finns 25 nukleotider före transkriptionsstart och rekryterar transkriptionsfaktorer.Den utgör startpunkt för RNA-polymeras II.

59
Q

Vad är en core promotor?

A

Ett reglerande sekvenselement som finns 60 nukleotider från transkriptionsstarten och rekryterar generella transkriptionsfaktorer.

60
Q

Vad krävs för initiering av transkriptionen?

A

Generella transkriptionsfaktorer.

61
Q

Vad är TBP? Vad gör den?

A

TATAA-binding protein. Den binder till TATAA-boxen och initierar transkriptionsprocessen. Då rekryteras ytterligare transkriptionsfaktorer (TFIIB, TFIIF, THIIH).

62
Q

Vad är CTD-svansen?

A

En C-terminal domän som sticker ut från RNA-polymeraset och innehåller faktorer som utför t.ex. caping och polyadenylering.

63
Q

Vad är ett preinitieringskomplex vid transkription?

A

Ett samlingsnamn för TPB, RNA-polymeraset och de generella transkriptionsfaktorerna.

64
Q

Vad fosforylerar CTD-svansen vid transkription? Vad händer därefter?

A

TFIIH. Efter detta släpper RNA-polymeraset alla andra faktorer som binder in och transkriptionen börjar.

65
Q

Vad har alternativa promotorer för funktion vid transkription?

A

De gör att transkriptionen kan starta på olika exoner, genom att binda in specifika transkriptionsfaktorer för genen.

66
Q

Hur många transkriptionsfaktorgener har människan?

A

Över 2000 st.

67
Q

Vad har enhancers för funktion?

A

De finns i DNA:et och fungerar som förstärkare för transkriptionen.

68
Q

Hur fungerar aktivatorprotein och vad är deras funktion?

A

De kan bindas till enhancers och öppna upp kromatinet och rekrytera de generella transkriptionsfaktorerna till TATAA-boxen.

69
Q

Vad har silencers för funktion?

A

De packar ihop kromatinet så de generella transkriptionsfaktorerna ej kan binda till TATAA-boxen.

70
Q

Vad är och gör en insulator?

A

Det är ett element i den genetiska koden. Den verkar blockerande och inhiberande för transkriptionen och stänger ner områden som då blir icke-transkriptionellt aktiva.

71
Q

Vad gör ett barriärprotein?

A

Den kan avgränsa eukromatin och heterokromatin ifrån varandra.

72
Q

Vilka strukturer döljer sig bakom de markerade områdena i bilden?

A

?