transcription des ARN messages Flashcards
comment peuvent être synthétisées les prot ?
à partir d’un même ARN =>épissage alternatif
que permet l’ARN polymérase ?
de recopier une partie de l’ADN du génome en ARNm en fonction de la prot synthétiser
quand démarre l’ARN polymérase ?
- au site de démarrage de la transcription noté +1
- en 5’ =>partie promotrice du gène
que permet la partie promotrice du gène ?
de moduler la transcriptoin : elle sait où et qd la transcription doit avoir lieu
comment l’ARN polymérase progresse ?
le long du gène en transcrivant l’un des 2 brins jusqu’au site de terminaison
arn polymérase
À quoi correspon la maturation ?
à excision des introns et à épissage des exons
comment fonctionne l’ARN pm ?
pm=polymérase
- ARN pm se positionne sur le gène grâce à des bases qui lui permettent de trouver site de démarrage de la trascription +1
- progresse le long du gène et le transcrit => transcrit primaire
- ARN pm mature via enzyme nucléaire
- transcrit mature : ARNm
- pore nucléiare pour sortir noyau
- ARN peuvent être traduit en prot
c’est quoi le transcrit primaire ?
=ARN pré-messager
sur quoi repose la maturatoin de l’ARNpm ?
- La formation d’une coiffe
- L’ajout d’une queue poly A sur le site de
polyadénylation (correspondant au site de
terminaison) - L’excision (= la suppression) des introns et l’**épissage **(= le raboutage) des exons.
que peuvent subri ctne des prot ?
modifications post-traductionnelles =>ex :phosphorylation
que permettent les modifications post traductionnelle des prot ?
être ou non fonctionnelles
que font les prot une fois qu’elles ont eu leur modification post-traductionnelles ?
puis transportées vers le site ou elles excercent leur action biologique :ciblage
c’est quoi la réaction élémentaire ?
=polymérisation :
* ARNn + NTP → ARNn+1 +PPI
Nucléotide TriPhosphate ;PyroPhosphate Inorganique
quand est-ce que la réaction élémentarie est rendue irréversible ?
par utilisation d’un NTP et d’une pyrophosphatase dégradant immédiatement le PPi
sur quoi repose la polymérisatoin ?
sur attaque nucléophile de l’OH en 3’ du GU sur le phosphate 𝛼 du GTP =>création d’une liaison phosphodiester
que nécessite l’ARN polymérase ?
une matrice d’ADN mais pas d’amorce
inverse de l’ADN polymérase
comment l’ARN polymérase synthétise l’ARN ?
de 5’ en 3’, c’est-à-dire qu’elle recopie le brin matrice en
se déplaçant sur celui-ci de 3’ en 5’
c’est quoi le brin matrice ?
l’ADN copié complémentaire de l’ARN m
c’est quoi le brin codant =ARN pm ?
l’autre brin de celui du brin matrice
* identique en séquence à ARN m avec T↔︎U
quels sont les ≠ ARN polymérases ?
- ARN pol I
- ARN pol II
- ARN pol III
que fait l’ARN pol I?
transcrit les gènes de classe I ARN r sauf 5s
que fait l’ARN pol II ?
transcrit les gènes de classe II : ARNm,sn,mi
* inhibé par l’𝛼-amanitite
que fait l’ARN pol II ?
transcrit les gènes de classe III :ARNt et ARN 5S
de quoi est formée la machinerie transcriptionnelle ?
de pls prot qui se lient à des séquences consensus en amont du site de démarrage de la transcription =>promoteur proximal
que ce passe-t-il qd les facteurs de transcription de ARN polymérase sont fixés sur ADN ?
double hélice est déroulée sur 17 pb = bulle de transcription et synthèse démarre
c’est quoi comme étape la machinerie transcriptionnelle ?
étape limitante de la transcription car séquences consensus de l’ADN recrutent des prot
que définit le nbre de polymérase ?
définit efficacité de transcription du gène
quels sont les promoteurs qui existes ?
- promoteur proximal
- promoteur distal
Où est situé le promoteur proximal ?
à proximité de + 1
que ce passe-t-il si on coupe le promoteur proximal ?
on peut quand même avoir de la transcription mais ce ne sera pas régulé
que représente le promoteur distal ?
toute les séquences qui permettent de dire que tel gène ne s’exprime que dans telle cell à tel stade
que peremt le promoteurs proximal ?
à la machinerie de se positionner en + 1 grâce à boite TATA
Où se situe la boîte CG ?
en amont de la boite TATA et souvent encore apère on a la boîte CAAT
de quoi est formé la machinerie transcriptionnelle ?
- de la polymérase
- ≠ facteurs généraux de transcription
- autre complexe protétique = médiateur
c’esst quoi la polymérase ?
très gros complexe incapable de reconnaître des séquences promotrices spécifiques. ou d’initier la transcription
De quoi a besoin la polymérase pour se positionner ?
nécessairement des prot
quels sont les ≠ facteurs généraux de transcription ?
- TFIIA
- TFIIB
- TFIID
- TFIIE
- TFIIF
- TFIIH
que font les facteurs généraux de transcription ?
positionnent la machinerie au bon endroit et initient la transcription
A-t-on les mêmes facteurs généraux de transcription pour toutes les cell ?
oui
que permet le médiateur ?
de coordonner les étpes de la mise en place de la machinerie transcriptionnelle
que permet le TFIID ?
permet à la machineroe transcriptionnelle de se fixe ?
c’est quoi le TFIID ?
un polypeptides : la TATA binding protein (TBP) se lie à la TATA box
que va-t-il s’ajouter à TFIID ?
+ de 14 polypeptides additionnels les TPB Associated factor ou TAF
que permettent les TAf ?
la liaison des GTF =>machinerie transcriptionnel sur le promoteur
par quoi passe la reconnaissance des séquences du promoteur proximal pour l’ARN polymerase procaryote?
passe par le facteur σ =>interaction spécifique
que fait le facteur σ ARNpm procaryote ?
se fixe sur ADN puis désenrouelemnt de ADN pour permettre la lecture
* il peremt à la polymérase de se positionner
quand est-ce que le facteur σ par ?
quand la transcription commence
de où à où se déplace la machinerie transcriptionnelle ?
vers extrémité 3’ du brin codant
qui va couper l’ADN ?
les topoisomérases
Pourquoi les topoisomérases coupent l’ADN ?
pour évité torsions trop importantes dues à son enrouelemnt
comment on va relier les coupure d’ADN entre elles ?
via une ligase elle réhybride les 2 brins d’ADN après sont passage
combien de paires de base va mesuere l’hybride ADN/ARN ?
ne dépasse pas 9 à 9 pb => au délà machinerie se détache de ADN
que ce passe-t-il plus il y a de polymérases ?
plus le gène est transcrit : c’est les initiation de transcrition qui ↗︎ pas la vse de transcription
quand est-ce que le facteur σ va partir ?=> ARN procaryote
après ajout de 8 à 10 ribonucléotides
Que ce passe-t-il après après ajout de 8 à 10 ribonucléotides ?=>ARN procaryote
polymérase s’éloigne du promoteur pour continuer la synthèse de ARN
que va faire la polymérase
des erreurs
que peuvent induire les erreurs crées par la polymérases ?
des prot avec une mauvaise séquence primaire
comment on peut minimiser les erreurs lors de le trasncription ?
- machinerie transcriptionnelle clive le dernier nucléotide s’il est incorrect (liaison
phosphodiester), puis elle relie les 3 ou 4 derniers nucléotides - Elle digère l’ARN incorrect
avant de recommencer sa synthèse
quand se termine la transcriptions ?
lorsque machinerie transcriptionnelle arrive à une séquence en GC suivie d’une région riche en U
comment est l’ARN une fois transcription terminée ?
- forme une épingle à cheveux assez stable (liaisons H) quise dissocie de l’ADN
- L’ARN polymérase est déstabilisée: se décroche de l’ADN quelques bases plus loin
