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génome humain > transcription des ARN messages > Flashcards

transcription des ARN messages Flashcards

1
Q

comment peuvent être synthétisées les prot ?

A

à partir d’un même ARN =>épissage alternatif

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Q

que permet l’ARN polymérase ?

A

de recopier une partie de l’ADN du génome en ARNm en fonction de la prot synthétiser

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Q

quand démarre l’ARN polymérase ?

A
  • au site de démarrage de la transcription noté +1
  • en 5’ =>partie promotrice du gène
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4
Q

que permet la partie promotrice du gène ?

A

de moduler la transcriptoin : elle sait où et qd la transcription doit avoir lieu

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5
Q

comment l’ARN polymérase progresse ?

A

le long du gène en transcrivant l’un des 2 brins jusqu’au site de terminaison

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6
Q

arn polymérase

À quoi correspon la maturation ?

A

à excision des introns et à épissage des exons

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7
Q

comment fonctionne l’ARN pm ?

pm=polymérase

A
  1. ARN pm se positionne sur le gène grâce à des bases qui lui permettent de trouver site de démarrage de la trascription +1
  2. progresse le long du gène et le transcrit => transcrit primaire
  3. ARN pm mature via enzyme nucléaire
  4. transcrit mature : ARNm
  5. pore nucléiare pour sortir noyau
  6. ARN peuvent être traduit en prot
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8
Q

c’est quoi le transcrit primaire ?

A

=ARN pré-messager

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9
Q

sur quoi repose la maturatoin de l’ARNpm ?

A
  • La formation d’une coiffe
  • L’ajout d’une queue poly A sur le site de
    polyadénylation (correspondant au site de
    terminaison)
  • L’excision (= la suppression) des introns et l’**épissage **(= le raboutage) des exons.
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10
Q

que peuvent subri ctne des prot ?

A

modifications post-traductionnelles =>ex :phosphorylation

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11
Q

que permettent les modifications post traductionnelle des prot ?

A

être ou non fonctionnelles

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12
Q

que font les prot une fois qu’elles ont eu leur modification post-traductionnelles ?

A

puis transportées vers le site ou elles excercent leur action biologique :ciblage

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13
Q

c’est quoi la réaction élémentaire ?

A

=polymérisation :
* ARNn + NTP → ARNn+1 +PPI

Nucléotide TriPhosphate ;PyroPhosphate Inorganique

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14
Q

quand est-ce que la réaction élémentarie est rendue irréversible ?

A

par utilisation d’un NTP et d’une pyrophosphatase dégradant immédiatement le PPi

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15
Q

sur quoi repose la polymérisatoin ?

A

sur attaque nucléophile de l’OH en 3’ du GU sur le phosphate 𝛼 du GTP =>création d’une liaison phosphodiester

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16
Q

que nécessite l’ARN polymérase ?

A

une matrice d’ADN mais pas d’amorce

inverse de l’ADN polymérase

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17
Q

comment l’ARN polymérase synthétise l’ARN ?

A

de 5’ en 3’, c’est-à-dire qu’elle recopie le brin matrice en
se déplaçant sur celui-ci de 3’ en 5’

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18
Q

c’est quoi le brin matrice ?

A

l’ADN copié complémentaire de l’ARN m

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19
Q

c’est quoi le brin codant =ARN pm ?

A

l’autre brin de celui du brin matrice
* identique en séquence à ARN m avec T↔︎U

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20
Q

quels sont les ≠ ARN polymérases ?

A
  • ARN pol I
  • ARN pol II
  • ARN pol III
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21
Q

que fait l’ARN pol I?

A

transcrit les gènes de classe I ARN r sauf 5s

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22
Q

que fait l’ARN pol II ?

A

transcrit les gènes de classe II : ARNm,sn,mi
* inhibé par l’𝛼-amanitite

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23
Q

que fait l’ARN pol II ?

A

transcrit les gènes de classe III :ARNt et ARN 5S

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24
Q

de quoi est formée la machinerie transcriptionnelle ?

A

de pls prot qui se lient à des séquences consensus en amont du site de démarrage de la transcription =>promoteur proximal

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25
Q

que ce passe-t-il qd les facteurs de transcription de ARN polymérase sont fixés sur ADN ?

A

double hélice est déroulée sur 17 pb = bulle de transcription et synthèse démarre

26
Q

c’est quoi comme étape la machinerie transcriptionnelle ?

A

étape limitante de la transcription car séquences consensus de l’ADN recrutent des prot

27
Q

que définit le nbre de polymérase ?

A

définit efficacité de transcription du gène

28
Q

quels sont les promoteurs qui existes ?

A
  • promoteur proximal
  • promoteur distal
29
Q

Où est situé le promoteur proximal ?

A

à proximité de + 1

30
Q

que ce passe-t-il si on coupe le promoteur proximal ?

A

on peut quand même avoir de la transcription mais ce ne sera pas régulé

31
Q

que représente le promoteur distal ?

A

toute les séquences qui permettent de dire que tel gène ne s’exprime que dans telle cell à tel stade

32
Q

que peremt le promoteurs proximal ?

A

à la machinerie de se positionner en + 1 grâce à boite TATA

33
Q

Où se situe la boîte CG ?

A

en amont de la boite TATA et souvent encore apère on a la boîte CAAT

34
Q

de quoi est formé la machinerie transcriptionnelle ?

A
  • de la polymérase
  • ≠ facteurs généraux de transcription
  • autre complexe protétique = médiateur
35
Q

c’esst quoi la polymérase ?

A

très gros complexe incapable de reconnaître des séquences promotrices spécifiques. ou d’initier la transcription

36
Q

De quoi a besoin la polymérase pour se positionner ?

A

nécessairement des prot

37
Q

quels sont les ≠ facteurs généraux de transcription ?

A
  • TFIIA
  • TFIIB
  • TFIID
  • TFIIE
  • TFIIF
  • TFIIH
38
Q

que font les facteurs généraux de transcription ?

A

positionnent la machinerie au bon endroit et initient la transcription

39
Q

A-t-on les mêmes facteurs généraux de transcription pour toutes les cell ?

A

oui

40
Q

que permet le médiateur ?

A

de coordonner les étpes de la mise en place de la machinerie transcriptionnelle

41
Q

que permet le TFIID ?

A

permet à la machineroe transcriptionnelle de se fixe ?

42
Q

c’est quoi le TFIID ?

A

un polypeptides : la TATA binding protein (TBP) se lie à la TATA box

43
Q

que va-t-il s’ajouter à TFIID ?

A

+ de 14 polypeptides additionnels les TPB Associated factor ou TAF

44
Q

que permettent les TAf ?

A

la liaison des GTF =>machinerie transcriptionnel sur le promoteur

45
Q

par quoi passe la reconnaissance des séquences du promoteur proximal pour l’ARN polymerase procaryote?

A

passe par le facteur σ =>interaction spécifique

46
Q

que fait le facteur σ ARNpm procaryote ?

A

se fixe sur ADN puis désenrouelemnt de ADN pour permettre la lecture
* il peremt à la polymérase de se positionner

47
Q

quand est-ce que le facteur σ par ?

A

quand la transcription commence

48
Q

de où à où se déplace la machinerie transcriptionnelle ?

A

vers extrémité 3’ du brin codant

49
Q

qui va couper l’ADN ?

A

les topoisomérases

50
Q

Pourquoi les topoisomérases coupent l’ADN ?

A

pour évité torsions trop importantes dues à son enrouelemnt

51
Q

comment on va relier les coupure d’ADN entre elles ?

A

via une ligase elle réhybride les 2 brins d’ADN après sont passage

52
Q

combien de paires de base va mesuere l’hybride ADN/ARN ?

A

ne dépasse pas 9 à 9 pb => au délà machinerie se détache de ADN

53
Q

que ce passe-t-il plus il y a de polymérases ?

A

plus le gène est transcrit : c’est les initiation de transcrition qui ↗︎ pas la vse de transcription

54
Q

quand est-ce que le facteur σ va partir ?=> ARN procaryote

A

après ajout de 8 à 10 ribonucléotides

55
Q

Que ce passe-t-il après après ajout de 8 à 10 ribonucléotides ?=>ARN procaryote

A

polymérase s’éloigne du promoteur pour continuer la synthèse de ARN

56
Q

que va faire la polymérase

A

des erreurs

57
Q

que peuvent induire les erreurs crées par la polymérases ?

A

des prot avec une mauvaise séquence primaire

58
Q

comment on peut minimiser les erreurs lors de le trasncription ?

A
  • machinerie transcriptionnelle clive le dernier nucléotide s’il est incorrect (liaison
    phosphodiester), puis elle relie les 3 ou 4 derniers nucléotides
  • Elle digère l’ARN incorrect
    avant de recommencer sa synthèse
59
Q

quand se termine la transcriptions ?

A

lorsque machinerie transcriptionnelle arrive à une séquence en GC suivie d’une région riche en U

59
Q
A
60
Q
A
61
Q

comment est l’ARN une fois transcription terminée ?

A
  • forme une épingle à cheveux assez stable (liaisons H) quise dissocie de l’ADN
  • L’ARN polymérase est déstabilisée: se décroche de l’ADN quelques bases plus loin

génome humain (18 decks)

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