Compaction de l'ADN Flashcards
Sous quelle forme se fait la compaction de l’ADN ?
2m ADN doivent rentré dans un noyau de 5 à 8 μm de diamètre
sous forme de chromatine : existe sous 2 formes
quelles sont les 2 forme de la chromatine ?
- euchromatine
- hétérochromatine
c’est quoi l’euchromatine ?
- part active du génome
- potentiellement transcriptible et organisée en nucléosomes
c’est quoi l’hétérochromatine ?
- partie du génome très condensé
- hyperméthylée , contient bcp de GC méthylés sur C
- peut y avoir des gène mais ne s’expriment pas
Grâce à qui peut on avoir une compaction de l’ADN ?
2 systèmes :
* nucléosomes
* hisones
compaction qui varie selon les cell
Pq on peut dire que la compaction des ≠ gèens varie selon les cell ?
gène A nécessite d’être exprimé ds cell X et non ds cell Y : il sera moins condensé dans X et plus dans Y
comment traduit le gène si il est condensé ?
+ un gène est condensé moins il s’exprime+ est traduit
comment vont se former les nucléosomes ?
double hélice s’enroule autour d’histones =>formation des nucléosomes =>compaction continue =>chrom
que vont faire les repliements de ctne parties de ADN ?
de base très éloignés ds la séqunece de ADN et se retrouvent très proches sur le plan de la structure
après condensation
c’est quoi le nucléosome ?
octamère de prot = histones
quel forme prend le nucléosome ?
disque
de 10 nm de diamètre et 6 nm d’épaisseur
combien de pb d’ADN s’enroule autour d’un nucléosome ?
150 à 200 pb et entre 2 nucléosome 20 à 60 pb
que permet la compaction de ADN en nucléosomes ?
compaction d’un facteur 6
le nucléosome est-il une structure figée ?
non il peut glisser pour libérer de l’ADN
c’est quoi les histones ?
prot riches en AA basiques =>chargées +
Pourquoi les histones s’enroulent ?
car chargés + et que ADN par présence de phosphate chargé - ADN s’enrouel autour de histone
Par quelles types de liaisons vont interagir m’histones et l’ADN ?
liaisons fiables électrostatiques
À quoi correspond un octamère d’histones ?
à 2 Histone H2A + 2 H2B + 2H3 + 2H4
le nucléosome est-il une structure stable ?
oui
À quoi est accessible la partie N-terminale de l’histone ?
accessibles à des modif enzymatiques post-traductionnelles
quelles sont les modif post-traductionnelle que peut subir l’histone ?
- acétylation
- phosphorylation
- méthylation
C’est quoi l’acétylation ?
perte d’une chagre + par des acétyltransférases ↘︎cohésiondavec ADN
c’est quoi la phosphorylation ?
- ce fait par des kinases
- apporte charges négatives qui ↘︎cohésion avec ADNet facilitent la transcription
c’est quoi al méthylation ?
- ce fait par des méthylases
- apporte des charges positives qui ↗︎ la cohésion avec ADN
Que permet l’histone H1 ?
compaction suplémentaire par 40
comment se fait la compaction supplémentatires avec histone ?
filaments de 30 nm forment des boucles qui s’enrouelent en hélice pour former les 2 chromatides du chrom =>compation par 10000
c’est quoi comme facturs les facturs d’assemblages ?
facteurs protéiques nucléaires nécessaire à assemblage des histones
que régulent les facterus d’assemblage ?
condensation de la chromatine
via quoi les enzymes responsbales des modif post-traductionnelles permettent remodelage de la chromatine ?
- glissement d’octamères
- ouverture de la chromatine
que permet le glissement d’octamères ?
pour rendre accessibles des séquences d’ADN
comment se fait l’ouverture de la chromatine ?
par décompaction =>acétylation des histones nutralise charges + des hisonte et ↘︎ interaction avec ADN
comment est la chromatine si elle est fermé ?
- transcriptionnellement inactive
- condensée : 30 nm
comment est la partie N-termianle des histone qd chromatine est fermée ?
- méthylée
- déacétylée
- déphosphorylée
comment est la chromatine qd elle est ouverte ?
- transcriptionnellement active
- décondensée
comment est la partie N-terminale des histone qd chromatine est ouverte ?
- déméthylsée
- acétylée
- phosphorylée