Tema 3. Variantes Genéticas en Individuos. Flashcards
Mutaciones de Splicing
Exon Skipping, Intron Retention, critic splicing site activation.
DONADOR (Región splicing)
En la región 3’ del exón y 5’ del intrón: GT
ACEPTOR (Región Splicing)
En la región 5’ del exón y 3’ del intrón: AG
Exon Skipping
Mutación en el aceptor. Una mutación en el aceptor hace que este no sea reconocido y se salte un exón, hasta la próxima señal de aceptor.
Intron retention
Mutación en el aceptor. Una mutación hace que desaparezca una región de donador, por lo que esta es considerada parte del exón y se añade intrón en la secuencia.
Mutación de cambio de secuencia
- En el exón un cambio en la secuencia puede dar como resultado un lugar críptico, se produce la activación de un donador. En este caso se pierde parte del exón.
- En el intrón aparece un lugar críptico de aceptor, parte del intrón se añade en el exón.
Mutaciones Dinámicas
Repeticiones de trinucleótidos. , con más frecuencia en intrones. Se da la expansión de trinucleótidos y más anticipaciones (se ve antes el efecto). Generalmente son polimórficas.
Enfermedad de Huntington
Las repeticiones de trinucleótidos hace que se formen agregados de Huntingtina, que provoca una desregulación en la expresión, impide el correcto transporte axonal y disfunción en mitocondrias.
Síndrome X frágil
Cromatina más compacta, se produce metilación de CpG, desacetilación de histonas y RNAi para silenciar FMR1. Todo como resultado de >200 repeticiones del trinucleótido CGG.
Efectos Fenotípicos Mutaciones
- Ganancia de función. Mutación dominante.
- Pérdida de función. Mutación recesiva.
Tasa de Mutación (Sexo)
Los puntos de control de la espermatogénesis son más efectivos que los de la ovogénesis. En cambio, la gametogénesis masculina tiene más fallos en la replicación.
Tasa de Mutación (Mitocondrias)
Tasa de mutación mayor con respecto a la del genoma. Esto se debe a: mecanismos de reparación no tan efectivos, no hay histonas, presencia de ROS, etc.
Las mutaciones en mitocondrias pueden producirse de novo o heredadas. Las heredades puede ser de origne materno o heterosplasmia (coexistencia de diferentes poblaciones de mitocondrias). En heteroplasmia puede que sea necesario un mínimo de porcentaje de mitocondrias afectadas para que se exprese la enfermedad. Las mitocondrias pueden esparcirse por diferentes tejidos, teniendo diferentes afectaciones en función del tejido.
Tipos de Polimorfismos
- Estructurales: CNV e inversiones.
- Secuencia: SNP e indels.