Tema 1. Organización Genoma Humano. Flashcards
Tipo DNA
- Función: codificante, no codificante.
- Repetición: secuencia única 45% (familia de genes, pseudogenes y fragmentos o exones), DNA repetitivo 55% (tándem, SINE, LINE, retrovirus y transposones).
DNA codificante
Corresponde al DNA que codifica para proteínas, corresponde al 1,1%.
DNA no codificante
RNA no codificantes, como lncRNA, miRNA, etc.
Familias Génicas
Grupos de genes que comparten características funcionales. Se generan por duplicaciones y favorecen la divergencia evolutiva. Los genes de una misma familia pueden encontrarse en el mismo cromosoma o dispersos.
Las familias génicas clásicas presentan una elevada homología, mientras que las superfamilias presentan niveles limitados, pero con funcionalidad similar.
Secuencias de Secuencia Única / LCR
Corresponden al 45% de la secuencia. Se forman por duplicaciones segmentarias, repeticiones de fragmentos que pueden encontrarse en tándem o no y son secuencias casi idénticas que, si incluyen genes formarán familias génicas.
Pseudogenes
Se produce una copia no funcional de un gen, la mayoría de este o de su secuencia codificante. Podemos hablar de pseudogenes no procesados, donde el gen sufre una duplicación (y mutaciones en la región codificante) dando como resultado una copia no funcional del gen, o procesados, donde un RNA se retrotranscribe a DNAc (con cola poliT) que se inserta en regiones ricas en Adeninas (si al insertarse adquiere una función se habla de retrogen.
Copias de fragmentos o exones.
Copias no funcionales de algún fragmento del gen.
Los procesos de formación de familias génicas pueden resultar en la formación de:
Pseudogenes o copias de fragmentos o exones.
DNA repetitivo disperso
SINE, LINE, Retrovirus y transposones.
SINE
Repeticiones cortas. No tienen salto autónomo, dependen de las proteínas que codifican los LINE para ello. El más frecuente es Alu, que aumenta sus copias, una copia más cada 100-200 nacimientos. Bandas G claras. Retrotransposón. Activos.
LINE
Repeticiones largas. Con salto autónomo, presencia de retrotranscripatasa y endonucleasa. Bandas G oscuras. Retrotransposón. Activos.
Retrovirus
Repeticiones dispersas. Retrotransposón. No activo. Depende de la presencia de integrasa para que su salto sea autónomo.
Transposones
A diferencia de los retrotransposones, actúan como una translocación, se mueve el fragmento a otra zona sin realizarse una copia. No activos. Su salto depende de la transposasa.
DNA repetitivo en tándem
- Satélites. Presente en centrómero.
- Minisatélite. Presente en telómero.
- Microsatélite o STR. Esparcido por el genoma.
Origen Regiones Reptitivas.
- Unequal crossing over. NAHR entre cromosomas homólogos o cromátidas hermanas.
- Replication Slipagge. Se produce un bucle, si ocurre en la de nuevo síntesis se produce inserción (aparecen microsatélites), si ocurre en la molde se produce una deleción.
- Retrotranscriptasa. Inserción de secuencias.