tecnologias de secuencias de ADN Flashcards
metodo utilizado para secuenciar el genoma humano
Sanger
usos de la secuencia Sanger
- precisa para secuencias largas
- no sirve para secuenciar genomas completos
plasmidos
funcion de ILumina
- detecta incorporacion de nucleotidos , que se marca con florescencia
funcion de Pac Bio
- muy preciso
- se usa para secuenciar secuencias largas (2 a 50 kb)
ventajas de la secuenciacion por nanoporos
- lecturas largas para ensamblaje de genomas
- estudia variantes estructurales
que es un deoxinucleotido
es lo que permite que no se una otro nucleotido
ya no hay afinidad por no tener O2 del OH
que metodo usa la secuenciacion en sanger
- utiliza electroforesis capilar
que bacteria fue usada en los modelos de ilumina
e coli
beneficios de usar Pac Bio
Tienes menos probabilidad de tener errores, eso nos da mayor precision porque en la misma copia ya voy analizando la secuencia
mientras mas grendes las piezas
- mas faciles de leer y armar
a que nos ayuda la electroforesis
a ver el tamaño del DNA
secuenciacion en sanger usa:
electroforesis capilar
1500pb
que es el electrofonograma
- representacion grafrica de la electroforesis capilar
se ven los colores distintos con las tintas de cada base
que lee ion torrent
las modificaciones de PH, a partir de alli obtiene los resultados
generacion de PAC BIO
3era generacion
2000 a 50kb
usa secuenciacion en tiempo real
que mide oxford nanopore
cambios en el voltaje dando como resultado la lectura
que errores detecta Oxford Nanopore
- traslocaciones
- inserciones
- inversiones
mientras mas grandes las piezas
mas faciles de leer y armar
para que sirven las bibliotecas genomicas
ilumnina
representacion de todo el ADN genomico de un organismo incluyendo las regiones codificantes y no codificantes
codigo de barras
workflow de ilumin
- preparacion de biblioteca
- generacion de clusters
- secuenciascion
- analisis de datos
proceso en donde se corta el DNA , para poseer la misma cantidad en los diferentes pocillos
fragmentacion
