tecnologias de secuencias de ADN Flashcards

1
Q

metodo utilizado para secuenciar el genoma humano

A

Sanger

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2
Q

usos de la secuencia Sanger

A
  • precisa para secuencias largas
  • no sirve para secuenciar genomas completos

plasmidos

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3
Q

funcion de ILumina

A
  • detecta incorporacion de nucleotidos , que se marca con florescencia
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4
Q

funcion de Pac Bio

A
  • muy preciso
  • se usa para secuenciar secuencias largas (2 a 50 kb)
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5
Q

ventajas de la secuenciacion por nanoporos

A
  • lecturas largas para ensamblaje de genomas
  • estudia variantes estructurales
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6
Q

que es un deoxinucleotido

A

es lo que permite que no se una otro nucleotido

ya no hay afinidad por no tener O2 del OH

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7
Q

que metodo usa la secuenciacion en sanger

A
  • utiliza electroforesis capilar
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8
Q

que bacteria fue usada en los modelos de ilumina

A

e coli

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9
Q

beneficios de usar Pac Bio

A

Tienes menos probabilidad de tener errores, eso nos da mayor precision porque en la misma copia ya voy analizando la secuencia

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10
Q

mientras mas grendes las piezas

A
  • mas faciles de leer y armar
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11
Q

a que nos ayuda la electroforesis

A

a ver el tamaño del DNA

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12
Q

secuenciacion en sanger usa:

A

electroforesis capilar

1500pb

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13
Q

que es el electrofonograma

A
  • representacion grafrica de la electroforesis capilar

se ven los colores distintos con las tintas de cada base

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14
Q

que lee ion torrent

A

las modificaciones de PH, a partir de alli obtiene los resultados

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15
Q

generacion de PAC BIO

A

3era generacion

2000 a 50kb
usa secuenciacion en tiempo real

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16
Q

que mide oxford nanopore

A

cambios en el voltaje dando como resultado la lectura

17
Q

que errores detecta Oxford Nanopore

A
  • traslocaciones
  • inserciones
  • inversiones
18
Q

mientras mas grandes las piezas

A

mas faciles de leer y armar

19
Q

para que sirven las bibliotecas genomicas

ilumnina

A

representacion de todo el ADN genomico de un organismo incluyendo las regiones codificantes y no codificantes

codigo de barras

20
Q

workflow de ilumin

A
  • preparacion de biblioteca
  • generacion de clusters
  • secuenciascion
  • analisis de datos
21
Q

proceso en donde se corta el DNA , para poseer la misma cantidad en los diferentes pocillos

A

fragmentacion