alineamiento de secuencias Flashcards
1
Q
que son los alineamientos de secuencias
A
- forma de organizar el ADN, RNA y las proteinas, con el fin de identificar regiones similares entre ellos, debidos a relaciones evolutivas y funcionales
2
Q
utilidad del alineamiento de secuen
A
- cuando dos secuecnias tienen un ancestro en comun, los desajustas se interpretan como mcutaciones puntuales y brechas
infieren relaciones evolutivas
3
Q
que son las mutaciones puntuales
A
cambio de pocos nucleotidos
4
Q
que son las bechas o gaps
INDELS
A
- matciones de insercion o eliminacion de nucleotidos
5
Q
herramientas necesarias para analizar secuencias en detalle
A
- diagrama de puntos para analisis graficos
- alineaciones locales o globales para analisis de residuos
6
Q
tipos de procedimiento de alineacion de secuencias
A
- alinemaineto locales
- alineamiento globales
-DOT PLOT
7
Q
los alineamientos de pares de secuencias se dividen a su vez en:
A
- alineamientos globales
- alineamientos locales
BLAST, LAIGN, EMBOS NEEDLE, EMBOSS WATER
8
Q
funcion del DOT PLOt
exploracion general de la secuencia
A
Buscar similitudes en secuencias, metodo mas usado
9
Q
caracteristicas alineamientos locales
A
- comparan secuencias con homologia parcial
- alienamiento de alta calidad
- analiza residuo por residuo
10
Q
caracteristicas de los alineamientos globales
A
- compara secuencias sobre su longitus total
- identifica mutaciones totakes en tus secuencias
- encuentra grandes indels
11
Q
algoritmo de needleman- Wunch
A
alinemaientos globales
12
Q
algoritmos de Smith y Waterman
A
- optimiza los alineamientos locales
- estos encuentran mayor coincidencia entre dos secuencias
13
Q
fin de los alinemainetos globales
A
- detecta variabilidad o conservacion de una familia de proteinas
- analisis filogenetico
