Structure Primaire des Protéines Flashcards
Que sont les acides aminés non polaires
Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro
Que sont les acides aminés polaires, non chargés
Gly, Ser, Thr, Cys, Asn, Gln, Tyr
Que sont les acides aminés polaires chargés négativement
Asp ,Glu
Que sont les acides aminés polaires chargés positivement
Lys, Arg, His
dessine alanine ala
dessine proline pro
dessine valine val
dessine leucine leu
dessine isoleucine ile
dessine methionine met
dessine phenylalanine Phe
dessine tryptophane trp
dessine glycine Gly
dessine serine ser
dessine threonine ser
dessine asparagine asn
dessine glutamine gln
dessine cystéine cys
dessine tyrosine tyr
dessine acide aspartique asp
dessine acide glutamique glu
dessine lysine Lys
dessine arginine arg
dessine histidine his ph>6
dessine histidine his ph<6
C’est quoi un Acides Aminés Branchés en b
C’est un aa avec au moins un carbone en position b de la chaîne et
seulement un atome d’hydrogène attaché au Cb
Il est difficile pour ces résidus d’adopter une conformation en hélice a,
on les retrouve plutôt dans les feuillets b
Est ce que les acides aminés sont chirales
A l’exception de GLY, le carbone a de tous les acides aminés porte quatre
groupes chimiques différents et est donc asymétrique ou chiral
C’est quoi la liaison peptidique
C-N
C’est quoi une protéine
Une ou plusieurs chaîne(s) polypeptidique(s
C’est quoi une protéine monomérique
Une seule chaîne polypeptidique
C’est quoi une protéines oligomérique ou
multimérique
Plus d’une chaîne polypeptidique
C’est quoi un Homo-oligomères
un seul type de chaîne
C’est quoi un hétéro-oligomères
plus d’un type de chaîne
Que sont les formes de protéines
fibreuses, globulaires et membranaires
C’est quoi une protéine fibreuse
protéines simples, linéaires. Elles ont souvent un rôle
structural et sont insolubles dans l’eau.
C’est quoi une protéine globulaire
protéines de forme sphérique qui se replie pour former une
structure compacte. En général, les chaînes latérales hydrophobes sont
enfouies à l’intérieur et les chaînes latérales hydrophiles sont tournées
vers l’extérieur. En conséquence, ces protéines sont solubles.
C’est quoi une protéine membranaires
associés à la membrane cellulaire. Certaines chaînes latérales hydrophobes sont orientés vers l’extérieur pour interagir avec le
milieu non-polaire de la membrane. Généralement, elles ne sont pas solubles en solution aqueuse.
C’est quoi la structure primaire
Séquence des acides aminés
C’est quoi la structure secondaire
Repliement local de la chaîne principale
C’est quoi la structure tertiaire
Repliement global résultant d’interactions
entre les structures secondaires
C’est quoi la structure quaternaire
Structure résultant d’interactions
entre des sous-unités peptidiques
Comment est ce qu’on détermine la conformation des protéines globulaires
- La séquence de la chaîne polypeptidique
- La rotation libre de plusieurs angles de torsion de la chaîne
polypeptidique, plus particulièrement les angles f et ψ. - Les contraintes imposées par les ponts disulfure (S-S)
- Les contraintes imposées par les faibles liens non-covalents
- La propriété hydrophobe des acides aminés
Que sont les forces qui influence la structure des protéines
- Les interactions de Van der Waals (0,4-4,0 kJ/mol)
- La liaison hydrogène (~12-30 kJ/mol)
- Les interactions électrostatiques ou ioniques (~20 kJ/mol)
- Les interactions hydrophobes (<40 kJ/mol)
C’est quoi les interactions de Van der Waals
Result from the formation of temporary dipoles due to electron movement in atomic electron clouds
Comment ce forme les liaison hydrogènes
Les liaisons hydrogènes s’établissent
entre un atome d’hydrogène lié de façon
covalente à un atome électronégatif et un autre atome
électronégatif
Qu’est ce qui résultent des interactions électrostatiques
l’attraction entre charges
opposées et de la répulsion entre charges du même signe
Qu’est ce qui résultent des interactions hydrophobes
L’enfouissement des groupes non-polaires
ou hydrophobes à l’intérieur des protéines
impliquent une réorganisation des molécules
d’eau. Les interactions hydrophobes sont
donc un facteur déterminant des structures
protéiques.
