Expression et purification des Protéines Flashcards

1
Q

C’est quoi l’avantage de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

protéine native, modifications post-traductionnelles, pas cher

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Q

que sont les limites de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

sources limitées, petite quantité de protéines spécifiques et pas d’étiquettes

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3
Q

Que sont les étapes de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

localisation d’une source, prélever l’organe optimal, homogénéiser les tissus et purifier la protéine

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4
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines dans la bactérie

A

construction de vecteur, sélection avec antibiotique, culture et induction de la protéine et purifier et analyser

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5
Q

C’est quoi l’avantage de l’expression de protéines dans la bactérie

A

Beaucoup de protéine pas cher, rapide culture et expression, vecteurs d’expression différentes et l’expression de protéines marquées est facile

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6
Q

que sont les limites de l’expression de protéines dans la bactérie

A

pas de modifications post-traductionnelles ou ponts disulfures, pas bon pour les protéines membranaires et différents codons chez la bactérie

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7
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines dans la levure

A

construction de vecteur, sélection avec acide aminé, cultiver et induction et purifier et analyser

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8
Q

C’est quoi l’avantage de l’expression de protéines dans la levure

A

Beaucoup de protéines et pas cher, pont disulfures et modification post-traductionnelles, expression de protéine marquées

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9
Q

que sont les limites de l’expression de protéines dans la levure

A

moins rapide, différents codons, pas bonne pour la protéine glycosylées

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10
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines chez l’insecte

A

construction de vecteur, identification et amplification de baclovirus, cultiver et infection de cellules et purifier et analyser

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11
Q

Que sont les avantages de l’expression de protéines chez l’insecte

A

ponts disulfures et modification post-traductionnelles, bon pour protéines glycosylées, vecteur avec His-tage et GST-tag et meilleures codon

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12
Q

Que sont les limites de l’expression de protéines chez l’insecte

A

pas rapide, moins de protéines, milieux spéciaux et production de protéines marquées difficile

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13
Q

Que sont les étapes de l’expression dans les cellules humaines

A

construction de vecteur, production de vecteur, cultiver et transfection de cellules et purifier et analyser

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14
Q

Que sont les avantages de l’expression dans les cellules humaines

A

Ponts disulfures, modifications post-traductionnelles et protéines membranaires, Les protéines contaminantes ne sont pas immunogènes, Vecteurs production avec His-tag et Codons parfaits- meilleur choix pour les très grosses protéines humaines

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15
Q

Que sont les désavantages de l’expression dans les cellules humaines

A

pas rapide, moins de protéines besoin d’un fermenter, milieux spéciaux et production de protéines marquées est impossible

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16
Q

Que sont les étapes de la purification à 3 étapes

A

capturer:isoler et concentrer, purifier: retirer grosses impuretés et polir: retirer petites impuretés

17
Q

Que sont les agents chaotropiquess

A

le guanidinium et l’urée

18
Q

qu’est ce qui arrive durant la précipitation saline de protéines

A

commence avec fraction soluble, la concentration de sulfate d’ammonium augmente, centrifuge et resurpendre le culot, répétition jusqu’à 80-90%, electrophorèse, puis resurpendre

19
Q

que sont les types de chromatographie

A

FPLC/pression moyenne et HPLC/ pression haute

20
Q

C’est quoi l’élution linéaire

A

un tampon, protocole facile, pas cher, mais séparation moins efficace

21
Q

C’est quoi l’élutionpar gradient

A

plusieurs tampon, protocole compliqué, cher et séparation efficace

22
Q

Comment fonctionne la détection par ultraviolets

A

La loi de beer-Lambert relie la quantité d’absorption de la radiation à la nature des espèces absorbantes

23
Q

où est ce que les groupes amide absorbent dans l’ultaviolet

A

en bas de 250 nm

24
Q

où est ce que les acides aminés aromatiques absorbent dans l’ultaviolet

A

au dessus de 250 nm

25
Q

C’est quoi le principe de base de la chromatographie d’affinité

A

une liaison spécifique entre une protéine et une résine qui est réversible où on exploite une propriété biochimique unique de la protéine d’intérêt

26
Q

Quand est la chromatographie d’affinité utilisé

A

durant les deux premières étapes de purification

27
Q

Que sont les protéines de fusion pour la chromatographie d’affinité

A

glutathione-S-transférase (GST) et Attache-(His)

28
Q

Que sont les ligands pour la chromatographie d’affinité

A

glutathione et nickel

29
Q

Que sont les étapes de la chromatographie d’affinité

A

Étape d’équilibration, de liaison, puis d’élution

30
Q

Que sont les avantages de la fusion de GST pour la chromatographie d’affinité

A

augmente solubilité des protéines, purification facile et édition facile

31
Q

Que sont les désavantages de la fusion de GST pour la chromatographie d’affinité

A

grosse étiquette, purification n’est pas possible avec dénaturants et GST forme un dimère

32
Q

Pourquoi doit ton avoir un site de coupure

A

il est parfois essentiel de cliver la protéine de fusion

33
Q

Que sont les avantages de la fusion de la poly-histidine pour la chromatographie d’affinité

A

purification facile avec résine de nickel, édition facile avec un petit ligand, purification possible avec dénaturants et petite étiquette

34
Q

Que sont les désavantages de la fusion de la poly-histidine pour la chromatographie d’affinité

A

augment la formation de corps d’inclusion, purification n’est pas possible avec antioxydants, pas bon pour purification de protéines qui lient des métaux de transition