Intro acide nucléiques Flashcards
C’est quoi la quantité de gènes codant pour les protéines
moins de 3% du génome
Quelle quantité d’ADN est transcrit en ARN
75%
Que sont les 4 types de transcrits d’ARN
ARNm, ARN ribosomaux (rRNA), petit non-codants (sRNA)/pseudogène et long non-codants (lncRNA)
Que fait les lncRNA
role dans des processus biologiques, associées à des maladies et forment des structures complexes par le biais d’interaction moléculaires
Que sont les acides nucléiques
les polymères de nucléotides qui contient une base, un pentose et du phosphate
Qui sont les pyrimidines
Les cytosine, uracile et thymine
Qui sont les purines
Les adénine et les guanine
C’est quoi un nucléoside
Ce sont des composés d’une base azotée liée par une liaison glycosidique à un pentose
C’est quoi la particularité du carbone de la liaison glycosidique
Il est anomérique
Que sont les conformation d’un nucléoside
syn ou anti
Le pentose permet quoi
une plus grande solubilité dans l’eau du nucléoside
C’est quoi un nucléotides
Des nucléoside phosphorylés, ils sont aussi des acides polyprotiques
Que sont les 4 nucléotides les plus communs à pH neutre
Uridine 5’-monophosphate, Cytidine 5’-monophosphate, Adénosine 5’-monophosphate et Guanosine 5’-monophosphate
C’est quoi le pka de l’Adénosine 5’-monophosphate
3.8
C’est quoi le pka de le Guanosine 5’-monophosphate
9,4 et 2,4
C’est quoi le pka de la Cytidine 5’-monophosphate
4.5
C’est quoi le pka de l’ Uridine 5’-monophosphate
9.5
Qu’est l’aromaticité de la structure des hétérocycles permet
Elle permet au nucléoside et nucléotides d’absorbés la lumière ultraviolette. Cela permet une bonne analyse quantitative
Qu’est ce qui détermine la capacité d’un ARN à exercer sa fonction physiologiques
Sa structure tridimensionnelle/ sa conformation
Qu’est ce détermine le trajet de la chaine d’un acide nucléiques
six angles de torsion qui sont alpha, beta, gamma, delta, epsilon et zeta
Qu’est ce qui détermine la conformation du ribose
cinq angles de torsion endocycliques qui ne sont pas indépendants les uns des autres
Que fait l’angle glycosidiques
il donne l’orientation de la base par rapport au ribose
Que sont les conformations du ribose
La forme enveloppe et la forme tordue
Que fait la formation de base
Elle est centrale à la formation des structures d’acides nucléiques
Qu’est ce qui stabilise la formation de paires de bases
la formation de ponts d’hydrogène
Que sont les paires de bases canoniques
Watson-Crick A-U et C-G et G-U wobble
Que sont les paires de base non canoniques
non-watsons-crick et g-u wobble
C’est quoi la compilation géométrique de Leontis et Westhof
C’est une classification des paires de bases selon la géométrie d’intéraction des bases tel qu’observé dans les structures d’ARN, qui a une emphase à l’isoélectricité
La nomenclature de la compilation géométrique de Leontis et Westhof est utile pour quoi
décrire les structures d’ARN et pour identifier des motifs basées sur la séquences d’ARN
Que sont les paramètres important pour la compilation géométrique de Leontis et Westhof
Les faces d’intéractions entre les 2 bases et l’orientation des liaisons glycosidiques
Que sont les paramètres accessoires pour la compilation géométrique de Leontis et Westhof
L’orientation syn ou anti et l’orientation locale des brins
Que sont les faces d’intéractions pour les purines
Face Watson-Crick, Face Hoogsteen et Face du sucre
Que sont les faces d’intéractions pour les pyrimidines
Face Watson-Crick, Face Hoogsteen ou Face C-H et Face du sucre
Comment est formées la structure hélicoïdales
les paires de bases au centre et le squelette ribose-phosphate en périphérie
C’est quoi la largeur et profondeur du sillon majeur de l’ADN
11,7 A et 8,5 A
C’est quoi la largeur et profondeur du sillon majeur de l’ARN
2,7 A et 13,5 A
Qu’est ce que le sillon majeur possède
Un potentiel pour la reconnaissance spécifique de la séquence de l’acide nucléique
que fait l’hélice alpha et béta pour permettre la reconnaissance d’une séquence spécifique
de l’ADN
Elles pénètrent le sillon majeur
Est ce que l’hélice alpha et béta peuvent pénétrer le sillon majeur de l’ARN
non car il est trop étroit, mais des perturbations dans l’hélice permettent un élargissement qui permet la reconnaissance
C’est quoi la structure primaire de l’ARN
une liste de nucléotide 5’ à 3’
C’est quoi la structure secondaire de l’ARN
liste de paires de bases et paires de bases canoniques
C’est quoi la structure tertiaire de l’ARN
liste d’intéractions entre la structure secondaire
Comment est définie la structure tertaire
C’est l’arrangement tridimensionnel de motif d’ARN, incluant la double hélice et les autres motifs qui s’assemblent pour former des interactions tertiaires
Quand est ce que des interactions tertiaires se forment
lorsque deux lignes se croisent sur le diagramme en forme d’arc
Les structures secondaires sont constitué de quoi
par l’enchaînement de régions appariées et non-appariées par de paires canoniques
que contient les régions non-appariées
Des motifs structuraux et sont importances pour la formation de la structure tertiaire et pour les interactions intermoléculaires
