Southern blot, northern blot och genomik

Question 1

Varför görs en southern blot?

Answer 1

För att kunna upptäcka en specifik DNA-sekvens i provet

Question 2

Varför görs en northern blot?

Answer 2

För att kunna upptäcka specifika RNA-sekvenser i provet

Question 3

Vad är transkriptom?

Answer 3

Analys av allt mRNA hos en organism som uttrycks i en specifik miljö

Question 4

Vilka användningsområden finns för microarray?

Answer 4

• jämföra förekomst av gener

- jämföra uttryck av gener

Question 5

Vad är microarray?

Answer 5

Hel genomanalys där DNA/RNA märks in med fluoroscerande nukleotider. Hybridiseras till platta med specifika gener –> resultat ger olika signaler

Question 6

Ge några exempel på vad man lära sig av microarray-experiment

Answer 6

• identifiering av förekomst av specifika organismer, t ex patogener
• det globala genuttrycket

Question 7

Vad är metabolom?

Answer 7

Alla metaboliter som uttrycks under en viss betingelse

Question 8

Vad är proteom?

Answer 8

Alla proteiner som uttrycks under vissa betingelser

Question 9

Vad är annotering?

Answer 9

Funktion för ett visst DNA-segment

Question 10

Vad är metagenom?

Answer 10

Det totala antalet gener som återfinns hos alla organismer i en viss miljö

Question 11

Vad är strukturell annotering?

Answer 11

Identifiering av genomiska element

Question 12

Vad är funktionell annotering?

Answer 12

Tillföra biologisk information till genomiska element