Prokaryot genreglering Flashcards
Vad är ett operon?
Gener i ett kluster som har likartade funktioner
Vad är ett polycistroniskt mRNA?
mRNA som kodar för flera transkriberade gener
Vad krävs vid transkriptionen och vad behövs inte till skillnad från replikationen?
Sigmafaktor och polymeras krävs. Primers behövs inte.
Hur sker terminering av transkription?
Rho-beroende och rho-oberoende termination
Hur fungerar rho-oberoende termination?
Genom att bilda stemloops som gör att DNA blir dubbelsträngat –> transkription kan inte ske
Hur fungerar rho-beroende termination?
Rho gör att RNA och RNA-polymeras separeras från DNA
DNA-bindande proteiner, beskrivning och funktion
Oftast dimerer, sekvensspecifika och binder huvudsakligen till major groove på DNA. Kan vara t ex transkriptionsfaktorer
Beskriv helix-turn-helix (som är ett DNA-bindande protein)
- Recognition helix binder till specifika sekvenser i major groove
- Turn består av tre aa där glycin orsakar böjen
- Stabiliserande helix binder till recognition helix
Vad kan DNA-bindande proteiner ha för effekter på genuttrycket
- Det kan initiera och katalysera reaktioner på DNA-molekylen
- Det kan blockera transkription (repressor)
- Det kan aktivera transkription (aktivator)
Vad är en inducer?
Binder till repressorn och inaktiverar = transkriptionen möjliggörs
Vad är en operator?
En DNA-sekvens som en transkriptionsfaktor kan binda till och inhibera genuttryck
Till vilka DNA-sekvenser binder aktivatorproteiner vid positiv reglering?
Aktivatorbindningsställen
Vad krävs förutom sigmafaktor att polymeras ska binda till promotorn?
Aktivatorprotein (ett regulatoriskt protein)
Vad är regulon?
Flera operoner som är kontrollerat/reglerat av samma regulatoriska protein
Ett aktivatorprotein
Cyclic AMP receptor protein (CRP)
