MALDI-TOF och proteomics Flashcards
1
Q
Vad är proteom?
A
Alla proteiner som kan uttryckas
2
Q
Vad innebär proteomics?
A
Kvantitativ och kvalitativ studie av proteomet inkl. hur det varierar i rum, tid och fysiologiskt tillstånd
3
Q
Vad är functional proteomics?
A
Utveckling och applicering av proteomvida experimentella tekniker för att studera proteinfunktion
4
Q
Vad är proteoformer?
A
Olika former på proteinet beroende på den biologiska variationen och möjliga modifieringar av dess primärstruktur
5
Q
Ge exempel på några nivåregleringar som ligger bakom proteoformer
A
- Genetisk variation
- RNA-reglering
- Alternativ splicing
- Alternativ translation
6
Q
Vad är masspektrometri och hur fungerar det?
A
Vad: teknik för att studera molekylfragments massa
Hur: mäter massa på individuella molekylfragment (en och en) som fått en elektrisk laddning
7
Q
Styrkorna med MALDI-TOF?
A
- Tillförlitligt
- Kostnadseffektivt
- Robust teknik
- Snabbt och enkelt
8
Q
Svagheter med MALDI-TOF?
A
- Inte applicerbart på virus
- Kräver rena kolonier/bra isolering vid preparationen
- Vissa arter kan inte särskiljas (t ex Shigella och E. coli)
- Databaser ägs av företag och egna tar tid att bygga
