SEM_les divers compartiments du SEM Flashcards
Le réticulum endoplasmique
c’est quoi le réticulum endoplasmique ?
ensemble de canalicules et de vséicules formant un réseau en continuité avec l’enveloppe nucléaire
le RE va-t-il porté des ribosomes ?
- oui ou no
- REG (granuleux): ribosomes sur la face cytosolique
- REL(lisse): aucun ribosome
quand les ribosomes sont-ils accolés à la mb du RE ?
que pdt la synthèse protéiques =>phénomènes transitoire
dans quoi intervient le REG ?
ds le métabolisme des prot et des peptides
ds quoi intervient le REL ?
le métabolisme des lipides
comment est la mb du RE ?
- composition proche de la mb plasmique
- peu de cholestérol dont mb RE + fluide que mb plasmique
c’est quoi les microsomes ?
petites vésicules recouvertes ou non de ribosomes
comment sont forémes les microsomes ?
par fragmentation du RE
comment sont purifiées les microsomes ?
par ultracentrifugation d’extraits cellulaires
quels sont les fonctions du RE ?
- fonction communes à toutes les cell:
1. translocation ds le REG
2. N-glycosylation
3. acquisition de la conformation spatiale de la prot
4. synthèses des glycoprot liées à mb par ancre GPI
5. translocation de peptides antigéniques
6. synthèse des phospholipides et du cholestérol (REL)
7. stockage et libération du calcium
8. RE conteint la glucose-6-phosphatase - fonction du RE pour cell spé :
9. coopération REL-mit pour synthèses d’hormones stéréoïdes
10. cytochrome P450 impliqué dans réactions de détoxification des molé
les fonctions du RE
à quoi correspond la translocation dans le REG ?
collecte des prot mbaires et sécrétées
Translocation dans le REG
comment se passe la translocation dans le REG ?
prot soluble et hydrophile destinée mbaire ou de sécrétion ont une phase de synthèse dans le cytosol puis dans le RE
Translocation dans le REG
comment sont les prot qui vont une phase de synthèse dns le RE ?
- séquence signal hydrophobe produite au niveau des ribosomes libres du cytosomet située en N terminal
- séquence constituée ~20 AA hydrophobes
Translocation dans le REG
c’est quoi la peptide signal ?
séquence d’entrée = d’adressage au RE = enveloppe du courrier
Translocation dans le REG
que ce passe-t-il une fois que la séquence signal est complète ?
reconnu par une particule Signal Recognition Particule=SRP
Translocation dans le REG
c’est quoi la SRP ?
un complexe ribonucléoprotéique avec 6 polypeptides et 1 ARN
Translocation dans le REG
comment est l’activité de la SRP ?
activité GTPase qui est capable de fixer et d’hydrolyser le GTP
Translocation dans le REG
sur quoi se fixe la SRP ?
fixée dur le peptides signal porte du GTP
Translocation dans le REG
que va entrainer la fixation de la SRP sur le peptide signal ?
entraine blocage de la traduction
Translocation dans le REG
que va faire le complexe [peptide signal/SRP + GTP] ?
se lie au récepteur de la SRP situé sur la mb du REG =>face cytosolique =>ext du RE
Translocation dans le REG
le récepteur de la SRP a une activité ATPase ou GTPase ?
GTPase
la SRP et le récepteur de la SRP ont une activité GTPase
Translocation dans le REG
comment on appelle le liage entre la SRP et le réceptuer de la SRP tout les 2 couplé au GTP ?
GTP dépendante
Translocation dans le REG
comment on appelle la fixation du ribosome par sa grosse sous unité à un autre complexe ?
le translocon
Translocation dans le REG
que va former le translocon ?
un pore entre le cytosol et la lumière du RE
Translocation dans le REG
c’est quoi le translocon ?
un canal de passage des prot
Translocation dans le REG
que ce passe-t-il après la fixation du ribosome. à un autre complexe protéique ?
dissociation de l’ensemble [pep signal/SRP/récepteur de la SRP] car hydorlyse des GTP couplés à la SRP et aux récepteurs de la SRP =>2 hydrolyses simultanées
Translocation dans le REG
que va entraîner la dissociation de l’ensemble [pep signal/SRP/récepteur de la SRP] ?
- libération du pep signal
- reprise de la traduction
- recyclage de la SRP dans le cytosol
Translocation dans le REG
comment va s’engager la séquence signal au niveau du translocon ?
- son extrémité N-terminale restant côté cytoplasmique =>formant boucle
- allongement de la chaine protéique la pousse à travers le transolocon alors qu’elle est tiré ds lumière du RE
Translocation dans le REG
par quoi est tirédans la lumière du RE la chaine protéique de la séquence signal qui est dans le translocon ?
par molé chaperonne commel la BInding Protein :BIP
Translocation dans le REG
l’activité de la BIP est ATP ou GTP ase ?
ATPase
Translocation dans le REG
que permet la BIP ?
conformation 3D de la prot
Translocation dans le REG
comment est le passage ds le translocon ?
co-traductionnel : traduction s’effectue en même tps que le mécanisme + ATP-dpt
Translocation dans le REG
à quoi est soumis la partie de la prot déjà situé dna slumière du RE ?
pdt que la prot est enc ocurs de biosynthèse
- N-glycosylatoin
- action des prot chaperonne pour acquisition structure 3D→important la forme c’est la fonction
Translocation dans le REG
comment se passe la N-glycosylaiton ?
oligosaccharides se lie à aspargine de la séquence consensus Asn-X-Ser ou -Thr par enzyme mbaire de type oligosaccharyltransferase
Translocation dans le REG
qui est concerné par la translocation ds le REF ?
ensemble des prot TM =>prot à un ou pls passages TM
Translocation dans le REG
quels sont les ≠ modes d’insertion dans la mb du REG ?
- nbre de domaines TM
- localisation cytosolique ou luminale des extrémités N et C terminale
qui est concerné par la translocation dans le REG des prot intrincèques TM ?
- ensemble des prot TM =>ce spnt des prot à un ou pls passages TM
que va-t-on utiliser s’il y a un seul passage TM ?
- signal d’adressage N-terminale : clivable; facultatif
- signal d’insertion interne
comment fonctionne le signal d’adressage N-terminale ?
si séquence signal N-terminale=>séquence interne d’arrête de transfert et un site de clia-vage de la séquence signal
c’est quoi le signal d’insertion interne ?
- permanent
- non clivable
- formé par une séquence interne hydrophpobe qui a aussi tôle de séquence d’arrêt de transfert
- insertion prot TM : séquence signal,interne permaente
que ce passe-t-il s’il y a pls passage TM ?
x séquences signal internes et d’arrêt de transfert
comment se fait la N-glycosylation ?
de manière concomitante avec la synthèse de la prot =>phénomène co-traductionnel
que va assurer la N-glycosylation ?
transformation d’une prot en glycoprot
* modifie solubilité et chagre des prot
c’est quoi la N-glycosylation ?
sucre = oligosaccharide greffé sur un gpmt amine NH2 de la chaine altéral d’une aspargine situé dans une séquences ASN-X-Sérine ou Asn-X-Thréonine par une enzyme de type oligosaccharyltransferase
que met en jeu la N-glycosylation ?
un précurseur glucidique riche en mannose sonstruit sur un lipide de la mb du RE : dolichol
comment le précurseur de la N-glycosylation fonctionne ?
- dolichol d’abord à la surface cytosolique =>7résidus du RE
- flip-flop du lipide
- dolichol dasn la lumière du RE
- obtinet précurseur à 14 résidus
quels sont les résidus du précurseurs de la N-glycosylation ?
- 2 résidus N-acétylglucosamine
- 9 mannoses
- 3 glucoses
Que va faire le précurseurs de la N-glycosylation ?
transféré en bloc sur la prot en cours de biosynthèse par une N-glycosyl transférase
que va faire le transfert du précurseurs de la N-glycolysation ?
arborisation glucidique est immédiatement élaguée par des glycosidase => 3résidus glucose puis 2 mannos enlevées =>10 résidus
de quel type est la N-glycosylTION DANS LE RE ?
DE TYPE MANNOSE DOMINANT
Où se fait le début de la N-glycosylation ?
sur une prot en cours de biosynthèse =>co-traductionnelle => ne se fait que dans la lumière du RE
comment sont acquis le repliement et la conformation 3D définitive de la prot ?
nécessaire à sa fonction
- établissement de ponts disulfures
- intervention de prot chaperonnes
☞BIP apparentées au HSP soluble
☞Calnexine =>prot chaperonne TM
comment se forment les ponts disulfures ?
liaisons covalentes par oxydation dasn lumière de RE par enzyme PDI retrouvé sur face extracellulaire
Protein Disulfur Isomerase
Comment est la lumière du RE comparé au cytosol ?
+ oxydante c’est pq les ponts disulfures sont sur la face extracelluliare de la mb plasmque
que requierent les prot BIP et calnexine ?
de l’ATP pour les BIP et du calcium pour calnexine
C’est quoi comme prot les BIP, DIP et calnexine ?
résidentes du RE elles possèdent dont signal de retention pour toujours revenir dans le RE
En quoi consiste la maturation des prot ?
¨glycosylation
acquisition des ponts disulfures
acquisition de la conformation 3D
que va-t-il avoir dans la cell pour controlé les prot ?
controle qualité
que fait le contrôle qualité lorsqu’il rencontre prot mal configurées ?
elle repassent dasn le cytosol pour y êter dégradées par le protéasome après ubiquitinyltion par des ligases
=modif post-traductionnelle
quelle est la mutation la plus fréquente dans la mucoviscidose ?
le CFTR delta F508
quelles sont les autres fonctions du RE ?
- synthèse de glycoprot
- trnaslocation de peptides antigénitiques
- synthèses des phospholipides et du cholestérol (REL)
- stockage et libération de Ca²⁺
- RE contient la glucose-6-phosphatase=enzyme de sa mb
- le REL coopère avec les mit pour la synhtèse d’hormones stéroïdes
- cytochromes P45 impliqué ds réaction de détoxification des molé
comment sont liées les glycoprot ?
liées à la mb par ancre GPI
face extracellualire de la mb plasmique
comment se fait la translocation de pep antigéniques ?
- dans le cytosol puis dans le RE
par qui sont produits les pep antigéniques
produits par les protéasomes du cytosol pour la présentation aux lymphocytes (défense
immunologique)
comment se fait le stockage et libération de Ca²⁺ ?
- pompe Ca²⁺/ATPase transporte le calcium du cytosol dans le RE.
- Dans le réticulum sarcoplasmique (= RE très développé dans les cellules musculaires striées), le calcium est indispensable pour la contraction musculaire.
c’est quoi la glucose-6-phosphatase ?
- Seule enzyme non cytosolique du métabolisme du glucose +++
- Production de glucose à partir du glycogène par déphosphorylation du G6P d’origine cytosolique → le RE a un rôle dans le maintien de la glycémi
comment le REL coopère avec les mit pour synthèses hormones stéroïdes ?
- La prégnénolone est un précurseur des stéroïdes produit dans la matrice mitochondriale à partir du cholestérol. Elle quitte la mitochondrie pour gagner la
face cytosolique du REL. - ≠ cytochromes (enzymes membranaires du RE à site actif cytosolique), notamment P450 ou CYP, synthétisent diverses hormones stéroïdes dans les
cellules spécialisées endocrines +++ (Leydig, corticosurrénales, …).
→ REL + développé (= hypertrophié) dans les cellules endocrines sécrétant des stéroïdes
dans quel réaction de détoxification le cytochrome P450 est impliqué ?
- En particulier de substances exogènes (médicaments).
- nbrx médicaments (ex : phénobarbital (antiépileptique)).
- Par hydroxylation → greffage d’une fonction OH sur la structure du médicament qui amplifie la solubilité de substances exogènes et facilite par conséquent
l’élimination par voie urinaire. (CYP2E1/OH ; CYP2D6/eliglustat)
que fait l’hépatocyte lors d’une intoxication au phénobarbital ?
augmentation de la surface
membranaire du RE et de la quantité de P450.
