Secuenciacion Masiva De Genomas Flashcards

1
Q

Metodologia basada en metodos bioquimicos para la determination del orden de las bases nitrogenadas en la cadena de ADN

A

Secuencia masiva de genomas

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2
Q

Metodología de sanhell característica principal

A

utiliza terminadores ddNTPPs

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3
Q

los ddNTPs que no tienen

A

OH en la ribosa 3’

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4
Q

después de la secuenciacion de sanhell que se implementó

A
  1. fluoroforo
  2. geles de capilares
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5
Q

¿cuando fue la PCR?

A

1985

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6
Q

Next generation Sequence tipos

A

pirosecuenciacion
solera
Ion Torrent

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7
Q

tercera generación que estudio es?

A

SMRT

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8
Q

¿Qué libera la pirosecuenciación?

A

fosfatos con fluoroforo

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9
Q

enzima encargada de la reacción luminosa en pirosecuenciación?

A

luciferasa

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10
Q

junta con su base complementaria

A

hibridación

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11
Q

proceso de pirosecuenciación

A
  1. aislado
  2. fragmento
  3. liga adaptadores especificos
  4. hebra sencilla
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12
Q

¿Como se liga los adaptadores?

A

mediante microesferas, y adaptadores

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13
Q

¿Qué es emulsion?

A

Hibridación por las esferas

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14
Q

Amplificación en puente o cluster PCR

A

Solexa

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15
Q

se encuentra en fragmentos de DNA adheridos en una celula de flujo
es una estructura como en plano con muchos adaptadores

A

solera

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16
Q

característica principal se solexa

A

SECUENCIACIÓN POR HIBRIDACIÓN Y AMPLIFICACIÓN

17
Q

tiene las microesfereas, hay liberación de hidrogenos, y tienen un cambio de ph,

A

Ion torrent

18
Q

Se refiere al promedio de número de lecturas que se alinean una secuencia de referencia; Que tanto de mi genoma de referencia he llenado

19
Q

Se refiere al número de veces que ha sido secuenciado una base del genoma.

A

Profundidad

20
Q

Segmentos del DNA son modificados (ligación) se adicionan insertos para que cada muestra pueda ser identificada (códigos de barra/sample barcode)

21
Q

parámetro que refleja el porcentaje de muestras positivas

A

Sensibilidad analitica

22
Q

Refleja la menor frecuencia de una variante

A

limite de detección

23
Q

detección de los controles negativos como negativos

A

especificidad analitica

24
Q

refleja la concordancia de las mutaciones detectadas y las
esperadas

25
Q

Parámetro que refleja la reproducibilidad de los datos

A

precisión

26
Q

solo se identifican los exones

A

exoma completo