Rearreglos Genomicos Flashcards
cambios en el DNA, van de miles de bases hasta regiones completas de cromosomas.
Rearreglos genomicos
Cómo se les llama a las enfermedades causadas por los rearreglos genómicos
desordenes geneticos
Rearreglos geneticos mecanismos
- NAHR
- NHEI
- FoSTes
diferencias entre mutaciones y rearreglos
- Las mutaciones puntuales se originan por errores durante la replicación o reparación del DNA
- Los rearreglos genómicos están causados por características genómicas estructurales 10-400kb
Características de los LCR
- Se ha observado que los rearreglos recurrentes están delimitados por LCRS
- Los no recurrentes cuentan con regiones cortas de sobrelapamiento (SRO)
NAHR que es
recombinación homologa no alelica
NAHR caracteristicas
Ocurre en regiones Hot spot
La recombinación puede tener un alineamiento erronia por los LCR
¿que pasa cuando los LCRs estan en diferentes cromosomas y en la misma orientación
hay traslocación
que pasa cuando los LCRs estan en el mismo cromosoma y en las misma orientación
hay delección o duplicacion
LCR esta en mismo cromosoma pero en orientación opuesta
Inversión
Caracteristicas de NAHR
- hot spots
- ocurre en mitosis y meiosis
- Identidad
- la longitad y cercania
Que son los hot spots
- Regiones donde se encuentran los LCR
- Estudios han demostrado que la recombinación de alelos homólogos (AHR) puede tener el hot spots adyacentes a los que de NAHR.
Si los rearreglos se presentan en células germinales se puede manifestar en desorden genético
Meiosis
resultando en mosaicos de poblaciones de células que portan el reareglo genómico -> CÁNCER.
Mitosis
Factores de eficiencia de NAHR
Longitud del LCR
Cercania entre los LCR
Indentidad de los NAHR
En la meiosis NAHR puede darse en…
- En la misma cromátida (intracomátida)
- En cromátidas hermanas (intercromátida)
- En cromosoma homólogo (intercromosomal)
Caracteristicas de NHEJ
- Es un mecanismo utilizado para la reparación DSB (doble strand breaks) doble cadena
- Provocados por errores en la recombinación, por radiación o por especies reactivas de oxigeno. No es de forma concreta lo que hace que haya rearreglos.
pasos de NHEJ
- Detección de DSB
- Puenteo de los extremos dañados
- Modificación de los extremos para compatibilidad
- Ligación de los extremos
Características de NHEJ
- a toma de rearreglo no es especifica, si puede ser estimada y regula la arquitectura genomica
- En un estudio se observó que las duplicaciones surgían en el primer paso del rearreglo posteriormente los extremos rotos invaden y copian a la cromátida hermana, formando la duplicación.
* +comun en traslocaciones cromosomicas en cancer
¿que es fostes?
- Mecanismo derivado de la replicación
- Algunas estructuras pueden favorecer la formación de FoSTes
- DNA palindrómico
- Estructuras de stemloop
- Estructuras cruciformes como en el RNAt
- Aún se continúan haciendo estudios acerca de FoSTeS
