Fuentes De Variaciones Entre Individuos Flashcards
“de muchas formas”
en genetica
Polimorfismos
Variabilidad genetica inter e intra especies características
- Una misma especie comparte secuencias en su molécula de ADN, pero aún dentro de la misma especie existen variaciones entre individuos.
- Organismos de una misma especie comparten regiones de su secuencia en 99,9%, somos diferentes en sólo 0.1%
- ``Las regiones NO codificantes son propensas a la variabilidad.
- Estas secuencias variables se denominan polimorfismos.
completa la frase
En el caso del ADN humano, las —- de regiones codificantes de los genes son poco —- dentro de la especie
secuencias
variables
Sección de ADN con una secuencia determinada para la creación de una proteína específica
genes
Características de genes
- Un gen se presenta de manera doble (alelo padre y alelo madre)
- La posición física en donde se encuentra un gen en el genoma se le llama locus (loci=plural)
en regiones codificantes, pueden tener un efecto o no en el fenotipo. En formas variables de proteínas o grupos sanguíneos (polimorfismo bioquímico)
polimorfismos geneticos
responsables de la diversidad genética
polimorfismos geneticos…
no dañiñas
se encuentran en regiones no codificantes (regiones reguladoras, intrones, pueden dar origen a una alteración funcional)
polimorfismos geneticos
origen de los polimorfismos
- Recombinación homóloga
- Segregación de los cromosomas (separación)
- Mutaciones
- Duplicaciones
- Transposiciones (genes saltarines, motor de la evolución)
En genética, se considera un polimorfismo cuando un alelo en un locus en la población presenta una frecuencia de más de ____
1%
Polimorfismos características
- frecuencia simplemente por mutación.
- Indica que estas variantes son comunes y no se da por el azar, es decir, que el alelo mas comun no puede mantener su frecuencia simplemente por mutuaciones
- Los polimorfismos se acumulan en las poblaciones hasta que se tornan comunes entre las especiesi entonces se denominan divergencia genética.
que es SNPs?
Cambio de un sólo nucleótido
¿Qué es InDels?
Cambio en el tamaño de la secuencia
Polimorfismos por el numero de repeticiones
Microsatelites
Minisatelites
Satélites
Estos polimorfismos pueden estar representados por la deleción, inserción o sustitución de una base nitrogenada en la secuencia nucleotídica normal.
Polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs)
polimorfismos producidos por deleciones o inversiones (INDELS)
DIPS
Caracteristica de los SNPs
- En secuencias codificantes es muy frecuente, 1 SNP en el ADN humano cada 1000-3000pb
- En secuencias no codificantes entre 500 a 1000 pb en promedio.
Ventajas de los SNPs
- Biomarcadores (su amplia distribución a traués de todo el genoma)
- Frecuencia
- Estabilidad
tipos de polimorfismos
SNPs
- Cambio de una C por una T (rs212570)
- Inserción o deleción (rs36126541)
- RFLP (Restriction fragment length polymorphism)
Nomenclatura de polimorfismos
- rs-› Reference polymorphism
- Número de serie específico
Se define como secuencias repetitivas de tamaño variable (unidad repetida la cantidad que estan repetidas
Cambio en el numero de repeteciones
Secuencias 2 a 4 (unidad de repetición). La extensión de los repetidos es menos de 100pb
microsatelites
Su identificación PCR con iniciadores específicos que flanquean el sitio de la secuencia
microsatelites
Cuando se presentan sin interrupción y de forma ordenada
perfecta
que tipo de repeticion es esta
TATATAGCTATAT
interrumpida
que tipo de repeticipon es esta
TATATAGCCGCCGCTATATA
combinada
desventaja de los short tandem repeats
no están distribuidos por todo el genoma, lo que limita su uso para determinadas condiciones o enfermedades; sin genética forense.
loci de secuencias corta (10 a 50pb unidad de repetición) repetidas en bloque o tándem un número específico de veces
minisatelites
Características de los minisatelites
- Presenten comunmente en telomeros
- La longitud de estas secuencias puede ser de pocas bases hasta algunas decenas de nucleótidos
- La cantidad de repeticiones será la variabilidad de alelos distintos en un mismo locus.
como se identifican los minisatelites?
*se identifica de acuerdo con el número de secuencias repetidas presentes, que puede ir desde dos repeticiones hasta cientos.
* Identificarán en geles dependiendo del tamaño de la banda obtenida
se encuentran muy distribuidos a lo largo del genoma, aunque los minisatélites, en particular, se localizan con frecuencia cerca de la región telomérica
mini o micro satelites
Pueden ir desde los 100 a los 200 nucleótidos repetidos en bloque uno tras otro (en tándem) cientos o miles de veces a lo largo del genoma.
satelites
Localizadas en los centrómeros o en regiones cercanas a los telomeros, aunque en ocaciones estan presente en algunas regiones intracromosómicas.
satelites
característivas de los satelites
Estas regiones de ADN repetidas en bloque o en tándem están sujetas a procesos como duplicación o recombinación, por lo que pueden ser altamente variables y diferir mucho individuos, lo que las convierte en marcadores genéticos muy entre informativos.
* Presentan un patrón único (huellas dactilares)
dos formas de formacion de satelites
- entrecruzamiento disparejo
- tartamudeo de la plimerasa
genera UEC (unequal crossover)
cromosomas homologos
generan UESCE (Unequal sister chromatid exchange
cromatides hermanas
Provoca la adición de unidades repetidas en tándem. Deslizamiento en la polimerasa puede causar inserciones o deleciones
tartamudeo de la polimerasa
porcentaje de combinación del cromosoma Y
1%
que se ha identificado en cromosoma y?
Se han identificado secuencias repetidas tipo microsatélites, como repeticiones AC.
completa la frase
El—- - —- para el cromosoma Y es muy bajo y no tiene —— — para la reproducción, de manera que son variaciones muy útiles para identificar —— o rastrear descendientes por —— —-
índice de mutación
implicaciones negativas
parentescos
linea paterna
características del DNA mitocondrtial
*La mitocondria es un organelo celular que existe en múltiples copias según el tipo de célula.
* Son exclusivamente de herencia materna.
* Al momento de la fecundación el óvulo conserva las mitocondrias en el citoplasma, mientras que las mitocondrias del espermatozoide se eliminan.
qué podemoslos identificar del DNA mitocondrial?
parentescos por línea materna, ya que todos los hermanos, hombres y mujeres, compartirán la misma información en su DNA mitocondrial.
que es RFLP
RFLP: Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción
Técnica utilizada para la identificación de polimorfismos
Detección de Polimorfismos en sitios de reconocimiento de enzimas de restricción
características de RFLP
- Al modificar uno de los nucleótidos modifican la longitud de los fragmentos de restricción.
- Se evidencian mediante el uso de enzimas de restricción, (cortan determinadas secuencias de ADN)
“Proteinas aisladas de bacterias que realizan cortes a la moleculas de ADN de manera especificas”
Enzimas de restriccion
generan fragmentos (de restricción), que pueden hibridar con sondas específicas para poder reconocerlos
enzimas de restriccion
Cuando el cambio de un nucleótido altera la secuencia diana para una determinada enzima de restricción, que puede pasar?
puede detectarse el polimorfismo en función de la variación que éste genera en el patrón de restricción
El número de variantes alélicas es siempre dos cuales son?
C: corta
NC: no corta
El sitio de restricción se reconozca en ambas cadenas de ADN
homocigoto
No presenta sitio de restricción, una sola banda 199bp
homocigoto sin corte
Tiene alelos diferentes en un locus. En gel se observará un alelo con corte y otro alelo sin corte AC
heterocigoto
La presencia o ausencia del alelo no confiere ninguna ventaja o desventaja al individuo
polimorfismos neutro
características de los polimorfismos neutros
- pueden ser no silentes
ventajas del polimorfismos
ventajas evolutivas
ventajas evolutivas para una determinada población, como conferir resistencia a condiciones medioambientales, de acuerdo con las zonas geográfica en la que habita.
Si producen variación en la lectura del código genético, por alterar codones que cambian el sentido de la traducción de un aminoácido por otro.
polimotfismos no sinonimos
No cambian la traducción del producto proteico en la variación de la secuencia,
polimorfismos sinonimos
o no silentes
para que se ocupa los polimorfismos en las ciencias forenses
- comparar sospechosos mediante muestras de sangre, cabello, saliva o semen, determinar responsabilidad o exoneración en juicios criminales.
- restos humanos, familiares extraviados, pruebas de paternidad, identificación de inmigrantes o personas indocumentadas, para establecer relaciones biológicas familiares
Establecer un patrón genético o huella genética es útil en diversos campos de estudio.
utilidad de los polimorfismos en genetica
Para estudios evolutivos cómo funcionan los polimorfismos
postular hipótesis acerca de la genetica poblacional y las migraciones humanas a traves del tiempo
Realizó estudios genéticos en el chícharo
gregor mendel
principios de mendel
- segregacion
- distribucion independiente
¿de que se aseguró mendel para que su estudió fuera confiable?
- Se aseguró durante 2 generaciones sucesivas que tuvieran características constantes y diferenciales (línea pura)
Todos los genes que posee un individuo, los genes e transmiten de padre a hijo. cada gen cuenta con dos alelos
genotípo
cualquier característica mediable o rasgo distintivo, es un resultado de los productos genéticos
fenotipo
Genotipo producto de la unión de gametos con alelos iidénticos
homocigoto
Individuos con antecedentes genéticos similares. Se da por autofertiliación o apareamiento endogámico. Produce una población homóciga para todos los loci.
linea pura
La unión de gametos portadores de alelos diferentes produce un genotipo heterócigoto
heterocigoto
Cuando el alelo se expresa fenotípicamente de forma homocigota y heterocigota, Simbología en mayúsculas
dominante
Cuando el alelo solos se expresa fenotípicamente en la forma homocigota. Minúsculas
recesivo
Los alelos carecen de dominancia o recesividad. Se expresa de manera parcial cuando de manera homocigota
codominantes
un progenitor transmite solo una forma alélica de un gen.
Principio de la segregación:
La segregación de un par de factores ocurre de manera independiente de la de cualquier otro par. Y al azar
distribucion independiente
En la actualidad se sabe que esta independencia esta dada por que los rasgos estan localizados en cromosomas no homólogos.
principio de distribucion independiente
Alteraciones estructurales o numéricas de los autosomas y cromosomas sexuales
anomalias cromosomicas
características de las anomalías geneticas
- poco frecuente
- alta penetrancia
cualquier múltiplo de 23
Euploidia
Fallo en la meiosis o mitosis se adquiere un complemento cromosómico que no es múltiplo de 23
aneploidia
1.
causas de cambio en el numero de cromosomas
- Falta de reparación
- falta de separacion
- retraso de la anafase
Cromosoma homólogo en meiosis o una cromátida en la mitosis se retrasan y quedan fuera del núcleo celular
retraso de la anafase
tipos de cambios en la estructura de cromosomas
traslocación equlibrada recíproca
traslocación robertsoniana
Transferencia de segmentos cromosómicos
Translocación
Intercambio de material genético, Fenotipo normal, pero incrementa el riesgo de producir gametos anormales.
Translocación equilibrada recíproca
Dos cromosomas acrocéntricos. Roturas cerca de centrómeros
tipo de traslocación
traslocación robertsoniana
Resulta un cromosoma muy grande y otro extremadamente pequeño. Fenotipo normal, pero riesgo descendencia anormal
traslocación robertsoniana
Anomalia por reordenamiento
Inversión
Inversión que afecta a un brazo del cromosoma
paracentrica
Inversión en los extremos opuestos del centromero
pericentrica
caracteristicas de las inversiones
suelen ser compatibles con un desarrollo totalmente normal
perdidas de una parte de un cromosoma
delecciones
delección donde se producen dos roturas en un brazo de un cromosoma. Pérdida del material cromosómico y fusión de los extremos rotos.
intersticiales
delecciones por Rotura única en el brazo de un cromosoma (fragmento sin centrómero -> pierde en la siguiente división celular)
terminales
Producidas por mutaciones en un solo gen, como resultado se presenta enfermedad o predisponen a sufrirla.
anomalias de monogénicas
Variación espontánea o inducida del genoma, cambio permanente y heredable en la secuencia de ADN
mutacion
consecuencias de las mutaciones
- Cambios en secuencia nucleotídica
- Cambios en los genes
- En los productos génicos (proteínas)
cuales son los origenes de las mutaciones
en anomalias monogénicas
mutación germinal
mutacion somática
No dañan al individuo, pero si es portador(a) de la mutación y la puede transmitir a sus descendientes.
mutacion germinal
La mutación no será detectada -> Cigoto → Enfermedad
Si surge en un tejido en división, puede surgir un clon mutante, descontrola a la célula y forma una displasia
mutacion somática
características de la mutacion somática
- cualquier celula del cuerpo
- no se transmiten a la desendencia
anomalias monogenicas
mutaciones por el efecto tipos
- Mutaciones no sinonimas
- Mutaciones puntuales en regiones codificantes
Por el efecto
hay un cambio en un aminoacido
mutaciones no sinonimas
tipos de mutaciones en regiones codificantes
- delecciones
- incersiones
- mutacion sin sentido
Se producen cuando se elimina uno o varios nucleótidos lo que resulta en un cambio en el marco de lectura
delecciones
Se introducen una o varios nucleótidos provoca un cambio en el marco de lectura
Incersiones
El cambio da como resultado un codón de paro. Provoca el término de la traducción
Mutaciones sin sentido
nonsense
tipo de mutacion
p.Leu55
sinonima
tipo de mutación
p.Gly123Asp
no sinonima
Tipo de mutacion
p.Glu45stop
Nonsense
Clasificación de mutaciones por patrones de transmición
- Autosómico dominante
- Autosómico recesivo
- Ligado al gen X
Mutaciones de novo en gametos paterno o materno
Autosomico dominante
Caracteristicas del autosomico dominante
- Hermanos no afectados
- Estos dependen de la naturaleza de la mutacion y el tipo de proteina afectada
Caracteristicas de los efectos de la dependencia de los autosómicos dominantes
son 5
- mutacion-> disminución de la funcion
- proteina disfuncional/ mactiva
- mutaciones-> ganancia de la función
- Exceso de actividad enzimática
- Nueva actividad sin relación a la funcion normal
Enfermedades Autosómicas dominantes del sistema nervioso
- Enfermedad de Huntington
- Neurofibromatosis
- Distrofia miotónica
- Esclerosis tuberosa
Aitosomica dominante enfermedades urinarios
Poliquistosis renal
Enfermedades autosomicas dominantes digestivas
poliposis familiar del colon
Enfermedades de autosómicas dominantes hematopoyeticas
- Esferocitosis hereditaria
- Enfermedad de von Willebrand
Enfermedades autosomicas dominantes esqueléticas
- Sindrome de marfan
- sindrome de Ehlers-Dantos
- Osteógenesis imperfecta
- Acondroplasia
Enfermedades autosomicas dominantes metabolicos
- hipercolesterolemia familiar
- Porfiria intermitente aguda
