Proyecto Hapmap Flashcards
¿que es lo principal que buscaba el pyecto HAPMAP?
Mapa de haplotipos
Principalmente que tipos de haplotipos en el proyECTo hapmap
Variaciones geneticas en poblaciónes
Qué paises estubieron involucrados?
Ibadan, Nigeria
Utah, Estados Unidos
Tokio, Japón
Beijin, China
de YRI a quienes estudiaron?
30 trios de padres e hijos
Ibadan
de CEU a quienes estuidaron
30 trios
padres e hijos, utah
A quienes estuiaron JPT
45 individuos independientes
Japon
A quienes estudiaron en CHB
45 individuos
china
Fase 1 del proyECTo hapmap
1,007,329 SNPs
269 muestras
11,500 SNPs no sinonimos
Genotipificacion de 1SNP cada 5kb
Fase 2 del proyECTo HapMAP
Se continuaron con los SNPs no sinonimos
2.2 millones de SNPs
Fase 3 de Hapmap
- Se realizo la captación de mas individuos, llegandotelo de 1184 personas
- se genotípificaron las mismas variantes
Que se encontró
- Se encontraron bloques de 5-15 kb.
- Los bloques más grandes se encontraron en centrómeros (menor tasa de recombinación)
Aplicación del proyeCTo Hapmap
Estudios de asociación de enfermedades comunes (cancer)
¿que es distancia fisica?
de pares de bases
Que es la distancia genetica
corresponde a la distancia entre dos genes que muestran una recombinacion de 1%
Cuanto equivale un centimorgan?
1 millon de bases