Secuenciación del genoma Flashcards
Diferencia entre una célula eucariota y procariota
La forma y organización del material genético
Contenido de los plásmidos de los procariotas
Material genético que si bien no es esencial para la bacteria, le puede ayudar de varias maneras
La secuenciación de genes nos permite identificar:
Los genes que se transcriben a tipos de tejido determinados, en determinados momentos
Son los datos en bruto de la genómica, que se ocupan de la secuencia de ADN, la
organización, la función y la evolución de los genomas
Los nucleótidos
Función de las computadoras en la secuenciación
Graficar la onda de señal de los nucleótidos
Significado de N en el espacio de un nucleótido en una secuenciación por computadora
Nucleótido no identificado
Posiciones en las que son más comunes los errores de secuenciación
Al principio y al final
Año de inicio y final del proyecto genoma humano
1990 y 2003
Pasos de la secuenciación de Sanger (secuenciación por terminadores)
- Abrir el DNA y fragmentarlo con enzimas de restricción
- Hibridar los fragmentos con los primers
- Añadirlos a 4 soluciones con un nucleótido modificado diferente
- Elongar los fragmentos
- Desnaturalizarlos y analizarlos mediante electroforesis
(V/F) En el proyecto genoma humano también se secuenciaron los genomas de otros organismos además del humano
Verdadero
Campo que combina informática, ingeniería, estadística y matemáticas para analizar secuencias del genoma y otros datos biológicos
Bioinformática
¿En qué se basa la secuenciación de Sanger?
En la terminación del alargamiento de la cadena durante su síntesis por medio de di-desoxinucleótidos
¿Cuál fue el primer genoma secuenciado?
El virus bacteriófago fX-174 (φX-174)
¿Quién secuenció al virus φX-174 y en qué año lo hizo?
Frederick Sanger en 1977
(V/F) Los nuevos métodos de secuenciación permiten secuenciar millones de fragmentos de DNA presentes en una muestra a la vez
Verdadero
¿Quién sustituyó los geles de electroforesis por técnicas automatizadas de secuenciación?
Leroy Hood
Pasos de la Seq Illumina (secuenciación por síntesis)
- Cortar la muestra de DNA en pedazos pequeños y unirles adaptadores a sus extremos 3’ y 5’
- Dispersar los fragmentos sobre un chip que contiene los primers para que se unan a estos
- Realizar la amplificación por PCR puente
- Secuenciar los productos de PCR mediante secuenciación de Sanger
Pasos de la secuenciación Ion Torrent
- Adherir los primers de PCR a perlas
- Añadir reactivos de PCR y una emulsión de aceite
- Dispersar las cuentas con sus primers en cámaras de un chip semiconductor
- El chip semiconductor detecta un cambio de pH para cada nucleótido cuando se une a la cadena complementaria
Pasos de la secuenciación de una sola molécula de DNA
- Añadir en un chip con pocitos una muestras de DNA circular y de una sola cadena, con una DNA polimerasa
- Añadir 4 soluciones con cada uno de los tipos de nucleótidos marcados con una sonda fluorescente
- Cada vez que se añade un nucleótido a la muestra, un detector óptico detecta su señal fluorescente
Pasos de la secuenciación de nanoporos
- Añadir la muestra de DNA monocatenario a una proteína motora
- La proteína motora impulsa la cadena a través de una proteína transmembranal
- La proteína cambia la conductancia de la membrana para cada nucleótido en específico, cambio detectado por un dispositivo de secuenciación de nanoporos
