Analisis proteómicos

Question 1

¿Cuál es la primera conclusión sobre las comparaciones de secuencias de proteínas?

Answer 1

Las secuencias de proteínas se pueden agrupar en grupos o familias según la similitud de secuencia.

Question 2

¿Cuál es la segunda conclusión sobre las comparaciones de secuencias de proteínas?

Answer 2

esta similitud puede limitarrse a tramos cortos de secuencia.

Question 3

(verdadero/falso)
Estas regiones de secuencia conservadas no son generalmente regiones de importancia
funcional.

Answer 3

FALSO, si son de importancia

Question 4

¿Cuál es el objetivo de las técnicas de clusterings?

Answer 4

identificar grupos de secuencias que son mayormente similares entre ellas y menormente
similares a las secuencias en otras agrupaciones

Question 5

(verdadero/falso)
Todos los miembros de una superfamilia, familia o subfamilia, están relacionados evolutivamente.

Answer 5

verdadero

Question 6

(verdadero/falso)
Los miembros de una superfamilia generalmente
tienen una estructura similar, aunque puede que no sea posible detectar la similitud de secuencia.

Answer 6

verdadero

Question 7

(verdadero/falso)
Los miembros de una subfamilia tienen una clara
similitud de secuencia y pero no la misma función.

Answer 7

FALSO, si tienen la misma función

Question 8

cuando hacemos análisis de clusters lo podemos analizar por patrones y perfiles. ¿De qué trata este análisis?

Answer 8

Construido a partir de múltiples alineaciones de secuencias evolutivamente relacionadas.
Incluyen secuencias de consenso, perfiles de expression regulares (PSSM) y modelos
ocultos de Markov (HMM).

Question 9

(verdadero/falso) Cuando hacemos análisis de clusters lo podemos analizar por subsecuencias conservadas.

Answer 9

verdadero

Question 10

¿Cuáles son las 2 formas de hacer análisis por patrones y perfiles?

Question 11

Tipo de Análisis de clusters en dónde se analizan dominios:

Answer 11

análisis de subsecuencias conservadas

Question 12

¿Qué son los dominios?

Answer 12

son tramos de secuencia que aparecen como módulos dentro de las proteínas.

Question 13

(verdadero/falso)
Los motivos representan zonas conservadas entre las secuencias que suelen asociarse a
características funcionales del grupo de secuencias.

Answer 13

verdadero

Question 14

Una vez que se ha construido un motivo o patrón de un grupo de secuencias puede utilizarse para:

Answer 14

1) Para asociar una nueva secuencia con la familia de secuencias que lo ha generado (si presenta el motivo es de la familia y puede que comparta sus funciones)

2) Para buscar secuencias que pertenezcan a una familia.

Question 15

(verdadero/falso) la expresión de proteínas es un proceso dinámico.

Answer 15

verdadero

Question 16

(verdadero/falso)
Las proteínas que se utilizan para funciones
específicas siempre pueden expresarse o
activarse.

Answer 16

Falso, no siempre pueden expresarse o activarse.

Question 17

¿Cómo se expresan muchas proteínas?

Answer 17

de una manera dependiente del tipo de célula.

Question 18

(verdadero/falso) La secuencia y estructura de las proteínas se utilizan para descubrir motivos que predicen la función de las proteínas.

Answer 18

verdadero

Question 19

¿Para qué sirve el historial evolutivo y secuencias conservadas de proteínas?

Answer 19

para identificar residuos reguladores clave

Question 20

¿Para qué sirve el perfil de expresión de las proteínas?

Answer 20

para revelar la especificidad del tipo de célula y cómo se regula la expresión

Question 21

¿Para qué sirven las modificaciones postraduccionales?

Answer 21

: la fosforilación,
acilación, glicosilación y ubiquitinación sugieren
localización, activación y / o función

Question 22

¿Para qué sirven las interraciones con otras proteínas?

Answer 22

la función se puede extrapolar al conocer la función de los socios de union.

Question 23

¿Para qué sirve la localización intracelular?

Answer 23

puede aludir a la función de la proteína.

Question 24

Las interacciones de proteínas se caracterizan
fundamentalmente como:

Answer 24

estables o transitorias

Question 25

(verdadero/falso) las interacciones proteína-proteína pueden ser fuertes o débiles.

Answer 25

verdadero

Question 26

¿A qué se asocial las interacciones proteína-proteína estables?

Answer 26

son aquellas asociadas con proteínas que se purifican como complejos de múltiples subunidades, y las subunidades de estos complejos pueden ser idénticas o diferentes.

Question 27

Ejemplos de interacciones de múltiples subunidades que forman complejos estables (interacciones fuertes):

Answer 27

- hemoglobina -ARN polimerasa

Question 28

¿Cómo se unen las proteínas entre sí en las interacciónes débiles?

Answer 28

mediante una combinación de enlaces hidrófobos, fuerzas de van der Waals y puentes salinos en dominios de unión específicos en cada proteína.

Question 29

¿En dónde generalmente se dan las interraciones débiles?

Answer 29

en la superficie de las proteínas

Question 30

Cuando hay interacciones proteina-proteína se generan reacciones biológicas como:

Answer 30

- alteración de las propiedades cinéticas de las enzimas - canalización de sustratos - se crean nuevos sitios de unión - se inactivan o destruyen proteínas - cambia la especificidad de una proteína (alosterismo)

Question 31

La co-inmunoprecipitación tiene una interacción:

Answer 31

estable o fuerte

Question 32

¿Qué es la co-inmunoprecipitación (co-IP?

Answer 32

es una técnica popular para determinar interacciones entre proteínas

Question 33

se lleva a cabo de la misma manera que una inmunoprecipitación (IP) de una proteína única, excepto que la proteína diana precipitada por el anticuerpo, también llamado "cebo (bait)", se usa para co-precipitar un complejo asociado de unión / proteína , o "presa (prey)", de un lisado celular. ¿Cuál es?

Answer 33

Co-IP

Question 34

¿Qué tipo de interacción tienen los pull.down essay?

Answer 34

estable o fuerte

Question 35

¿Cúal es la similitud entre los pull down essay y los Co-IP?

Answer 35

debido al uso de una matriz de soporte para purificar proteínas que interactúan.

Question 36

son ideales para estudiar interacciones fuertes o estables o para las que no hay anticuerpos disponibles para la co-inmunoprecipitación:

Answer 36

pull-down essays

Question 37

¿Qué tipo de interraciónven las crosslinking protein interactión analysis? (entrecuzamiento de proteínas)

Answer 37

débiles

Question 38

(verdadero/falso) los ensayos pull-down utilizan una proteína "cebo" para purificar cualquier proteína en un lisado que se une al cebo.

Answer 38

verdadero

Question 39

(verdadero/falso) El entrecruzamiento de proteínas que interactúan es un método para estabilizar o unir permanentemente los componentes de los complejos de interacción.

Answer 39

verdadero

Question 40

¿Qué tipo de interración ven las crosslinking protein interactión analysis?

Question 40

¿Qué tipo de interración ven las far-westen blot?

Answer 40

débiles

Question 41

(verdadero/falso) el analisis far westen blot en la detección de interacciones proteína-proteína mediante el uso de proteínas marcadas en lugar de anticuerpos.

Answer 41

verdadero

Question 42

¿Cuál es la diferencia entre un western blot y un far westen blot?

Answer 42

el análisis far-western blot difiere del análisis western blot, ya que las interacciones proteína-proteína se detectan mediante incubación por electroforesis proteínas con una proteína de cebo etiquetada y purificada en lugar de un anticuerpo específico de la proteína blanco, respectivamente.