Estructura y plegado de proteínas

Question 1

Las secuencias de genes, las secuencias de
ARNm y las secuencias de aminoácidos son
todas, desde el punto de vista lógico:
a) multidimencionales
b)pluridimencionales
c) unidimencionales
d) pluridimencionales

Answer 1

c) unidimencionales

Question 2

Para realizar sus actividades catalíticas,
reguladoras o estructurales adecuadas, las
proteínas deben adoptar estructuras
__________ precisas.

Answer 2

tridimencionales

Question 3

¿Qué es la desnaturalización?

Answer 3

La pérdida de la estructura 3D de las
porteínas a un nivel suficiente para que
pierda su funcionalidad

Question 4

¿En qué afecta la desnaturalización térmica?

Answer 4

Afecta interacciones débiles, principalmente
puentes de H

Question 5

¿A qué se debe la desnaturalización química de proteínas?

Answer 5

pH extremo, solventes, solutos y detergentes

Question 6

(verdadero/falso) La secuencia de ADN determina la
secuencia de la proteína.

Answer 6

verdadero

Question 7

(verdadero/falso)
La secuencia proteica determina
la estructura proteica

Answer 7

verdadero

Question 8

(verdadero/falso) La estructura de la proteína
determina la función de la proteína.

Answer 8

verdadero

Question 9

¿Qué es un Motif?

Answer 9

Es un patrón de plegado
reconocible que involucra
a dos o más elementos de
estructura secundaria y las
regiones que las conectan

Question 10

¿Qué es un dominio?

Answer 10

Parte de una cadena
polipeptídica que es estable
independientemente del
resto de la proteína.

Question 11

¿Cuál es la primera regla de plegado?

Answer 11

1.- Residuos hidrofóbicos de los aminoácidos se
“entierran” en el centro de la proteína y necesitan
por lo menos dos capas de estructura secundaria
para excluir el agua.

Question 12

¿Cuál es la segunda regla de plegado?

Answer 12

2.- Cuando aparece una hélice a y una lámina b
juntas en un dominio, generalmente son de capas
estructurales diferentes, ya que la lámina b no puede
hacer puentes de hidrógeno con las hélices alineadas a la lámina.

Question 13

¿Cuál es la tercera regla de plegado?

Answer 13

3.- Los segmentos de la cadena polipeptídica que se encuentran agrupados en la estructura secundaria, por lo general permanecen así en el plegado completo de la proteína

Question 14

¿Cuál es la cuarta regla de plegado?

Answer 14

4.- Las conexiones entre elementos de estructura
secundaria no pueden entrecruzarse ni formar nudos

Question 15

¿Cual es la quinta regla de plagado?

Answer 15

5.- La lámina b es más estable cuando se encuentra conectada en sentido derecho que en el izquierdo

Question 16

¿Cómo es la estructura de un barril?

Answer 16

Secuencia de b-a-b
Cada lámina se une con otra a
través de una hélice.
El dominio que forma es uno
de los más encontrado de las
proteínas.

Question 17

(verdadero/falso) El barril es un dominio estructural muy inestable y versátil.

Answer 17

Falso

Question 18

(verdadero/falso) El barril es un dominio que puede contener un sitio activo para sustratos o cofactores.

Answer 18

verdadero

Question 19

(verdadero/falso) El plegado de proteínas es un proceso aleatoria que no debe de tomar atajos.

Answer 19

Falso, no es aleatório y debe de tomar atajos

Question 20

¿A qué se refiere el término “molten globule”?

Answer 20

Consiste en un colapso espontaneo de la cadena
polipeptidica en un estado compacto mediado por
interacciones hidrofóbicas.

Question 21

¿Qué es un motif?

Answer 21

Es el cojunto de 2 o más estructuras secundarias que están unidas por un loop.

Question 22

¿Cuál es el resultado del colapso espontaneo de la cadena polipeptídica en un estado compacto mediado por interacciones hidrofóbicas (Molten globule)?

Answer 22

genera una gran cantidad de estructuras secundarias y su posterior arreglo en el plegado
funcional de la proteína.

Question 23

¿En qué se basa la hipótesis de folding funel?

Answer 23

se basa en el concepto de “energy landscapes” el cual es un mapa de todas las conformaciones
posibles de una molécula y sus niveles de energía
correspondientes.

Question 24

¿Qué son las chaperonas moleculares?

Answer 24

Son proteínas que asisten el plegado de
proteínas incorrectamente plegadas o
parcialmente plegadas.

Question 25

Complejos proteícos que son necesarios para el correcto plegado de proteínas que no lo hacen
espontáneamente:

Answer 25

chaperona

Question 26

¿Cuáles son las proteinas que catalizan reacciones de isomerización?

Answer 26

Protein difulfide isomerese (PDI), Peptid prolyl cis trans isomerase (PPI)

Question 27

¿Qué significan las siglas de CATH?

Answer 27

Class, Architecture, Topology, Homologous super family.

Question 28

¿Cómo se llama una proteína que tiene múltiples subunidades?

Answer 28

Multímero

Question 29

¿Cómo se llama un multímero con pocas subunidades?

Answer 29

oligomero

Question 30

¿Cuál fue la primer proteína oligomérica de la que se obtuvo su estructura tridimensional mediante difracción de rayos X?

Answer 30

La hemoglobina

Question 31

¿Cuántas cadenas polipeptídicas, y cuantos grupos prostéticos?

Answer 31

4

Question 32

¿Cómo tienden a ordenarse las proteínas multiméricas con subunidades iguales?

Answer 32

En formas simétricas

Question 33

¿Cuántos tipos de simetria pueden tener los oligómeros y cuáles son?

Answer 33

2, rotacional y helicoidal

Question 34

¿Qué simetria es?
Tres ejes de rotación 20 caras triangulares
equilateras 12 vértices.

Answer 34

Simetría icosaédrica

Question 35

¿Qué simetría es?

Answer 35

tiene 24 simetrías rotacionales y 48 en total

Question 36

¿Cuáles simetrias se encuentras en las cápsides de virus?

Answer 36

Icosaédricas y helicoitales

Question 37

Además de en cápsides de virus, las simetrías helicoidales tambien se encuentran en:

Answer 37

filamentos