RNA-virus Flashcards
Vilka 2 RNA virus kan orsaka persisterande infektioner hos immunkompetenta individer?
- Hepatit C
- Retrovirus
Hur skiljer sig RNA-virus från DNA-virus gällande. Beskriv hur RNAvirus är i följande:
- labilitet
- mutationsfrekvens
- storlek på viruspopulation
- gen-uttryckets reglering
- storlek
- infektionstid
- RNA, kort halveringstid, labilt kemiskt
- Replikation låg tillförlitlighet, gör många fel vid replikation. 10^-5 fel.
- Mindre än 30kb, pga hög mutationsfrekvens. Leder samtidigt till quacispecies = hög grad muterade virus som fås vid replikering
- Oreglerat genuttryck. Allt uttrycks på en gång.
- kortvariga infektioner förutom Hepatit C.
Beskriv virusklasser från Baltimores klassificering.
Beskriv mer ingående grupp 3,4,5
Grupp
- dsDNA
- ss+DNA
- dsRNA —> mRNA från - strängen. Ovanligt.
- ss+RNA –>
* * Måste gå via (-) intermediär för att replikera nytt ss+RNA.
* * Har inga egna polymeraser med sig i partikeln pga translation sker direkt.
* * I polyprotein finns polymeras kodat och proteaser. Virus polymeraset replikerar sedan sitt eget RNA. - -ssRNA
* * har alltid med sig polymeras i kapsid –> +RNA
* * våra celler har inte RNA-polymeras
* *-ssRNA går via + intermediär innan replikation av nytt genom - +ssRNA + RT
- dsDNA + RT
Beskriv
- struktur av viruset (strukturproteiner etc)
- genom
- kort om hur viruset producerar sig
Rotavirus (reoviridae)
- vanligaste orsaken till diarré
Icosahedral kapsid
- kapsid av 3 lager
- Segmenterat dsDNA med RNA-beroende polymeras till varje segment –> -RNA blir +RNA som är mRNA.
- VP2 inre kapsiden
- VP6 intermediär kapsid
- VP7 + 8 + 5 yttre kapsid. Binder receptor på cell
Virus in i cellen –> -DNA blir +DNA. Proteiner syntetiseras. Assembling i cytoplasman av partikeln. Sista delen av kapsiden fås via ER, membranet i ER klätt med ytrproteinerna. Viruset är höljeförsett en liten tid tills cellen lyseras.
Beskriv
- struktur av viruset (strukturproteiner etc)
- genom
Coronavirus (coronaviridae)
Struktur
- Helikal kapsid
- hölje
- +ssRNA
Kapsiden
- spikeprotein (receptorbindande)
- Transmembran-glykoprotein E
- Matrixprotein M
- Nukloprotein (omger RNA)
Beskriv
- struktur av viruset (strukturproteiner etc)
- genom
Picornaviridae
Struktur
- +ssRNA = proteiner görs direkt
- naket
- ikosahedral kapsid med 2 lager
- +ssRNA, VP4
- Yttre lager VP1-3
VIlka 4 genus finns inom picornaviridae?
- Enterovirus - olika coxsackievirus, poliovirus, enterovirus
- Rhinovirus - rhinovirus olika sorter (vanligaste orsaken till förkylning)
- Aphtovirus
- Hepatovirus - Hepatit A
Beskriv
- struktur av viruset (strukturproteiner etc)
- genom
Flavivirus
Struktur
- +ssRNA
- ikosahdral kapsid innesluten innanför höljet.
- höljebärande
- 2 höljeproteiner. E bildar komplex i 3 ytterst som täcker höljet. M förankrar E till höljet.
+ssRNA –> polyprotein –> virala och cellulära proteaser –> proteiner t.ex. viruspolymeras som gör nytt +ssRNA från -ssRNA intermediär
Vilka Flavivirus är arbovirus? Vilket hepatitvirus är ett hepacivirus inom Flavivirus familjen?
Flavivirus som bärs av leddjur (insekter)
- Gula febern
- Dengue virus
- Japansk encephalit virus
- West nile virus
- Zika virus
- Tick borne encephalitis virus (TBEV)
Hepacivirus
- hepatit C
Zikavirus är ett flavivirus.
- zoonos?
- myggart som sprider?
- symtom?
Zoonos från olika apor. Vektor är tigermygga. (generellt)
- kan dock spridas har man sett via sex och blodprodukter
Symtom lätta oftast hos vuxna (influensaliknande)
- feber, utslag, ledvärk
- röda ögon
- Förväxlas lätt med Dengue
- kan ge Guillian Barré ovanligt.
Gravida som infekteras:
Foster
- mircoencpehali
Beskriv
- struktur av viruset (strukturproteiner etc)
- genom
- Vilka 2 virus orsakar sjukdom hos människa?
Togavirus
+ssRNA
- ikosahedral kapsid
- ytproteinerna förankras i kapsiden
- hölje - ligger tätt mot kapsiden
- translation sker i 2 delar, till skillnad från Togavirus
Patogena virus
- Alfavirus - Sindbis (myggburet) = Ockelbosjukan
- Rubivirus - Röda hund
Vad har följande virusfamiljer för genom, och vad orsakar dem för sjukdom?
- astrovirus
- calicivirus - nämn de 2 virus som orsakar sjukdom
- hepeviridae
+ssRNA
Astrovirus - diarré
Calicivirus - diarré
- Norovirus
- Sapovirus
Hepeviridae
- Hepatit E - Hepatit
Vilka är gemensamma egenskape för -ssRNA virus?
6 st saker
Alla har
- helikal kapsid
- hölje
- infekterar genom fusion med plasmamembran (FÖRUTOM INFLUENSA)
- kapsid måste innehålla RNA-polymeras för att initiera viral gen-uttryck
- Replikeras i cytoplasman
- Budding från cellens plasmamembran
- ssRNA virus är familjerna med ICKE SEGMENTERAT GENOM. Rhabdoviridae, Filoviridae och Paramyxoviridae.
- Vilka virus ingår inom dessa?
Mässlingvirus (morbilli)
- Hur många serotyper finns?
- Hur smittar den (tropism)?
- Symtom?
- Komplikationer?
- Vad är det för typ av vaccin som finns mot mässling?
- 1 serotyp finns av mässling.
- Viruset binder CD46-receptor. Finns på epitelceller, endotel, mononuklära blodceller och CNS
Symtom
- snuva
- konjunktivit
- hosta
- hög feber
- utslag
Komplikationer
- encefalit (0,1 % får det)
- ökad risk för bakteriella infektioner pga immunosupprimerande effekt av viruset - Mediaotit, krupp, pneumoni, diarré
Vaccin
- levande attenuerat
