DNA-virus Flashcards
Beskriv skillnaden på DNA och RNA- virus avseende
- Storlek av genom (siffra)
- Stabilitet
- Korrekturläsning
- Mutationsfrekvens
(inga siffror)
- RNA- mindre än 30kb. DNA - mindre än 300kb
- RNA - instabila genom. DNA - stabila genom- Har bättre polymeraser för replikation av sitt genom.
- DNA virus har korrekturläsning 4. Därmed har DNA-virus mycket lägre mutationsfrekvens än RNA virus
Vad gäller för att -ssRNA och +ssRNA ska kunna translateras i cellen som infekteras?
- vad gäller för virus som har respektive genom angående polymeras?
-ssRNA måste replikeras till +ssRNA. RNA-virus som har -ssRNA i genomet har ett eget polymeras i sin viruspartikel.
+ssRNA genom däremot kan direkt translateras (=mRNA) till proteiner. I virusets genom kodas för ett RNA-polymeras.
DNA-virus använder ofta ett eget DNA-polymeras för transkription av sitt genom. Vilka två virus (från sliden) använder dock cellens egna DNA-polymeras?
Parvovirus
- replikerar och infekterar delande celler
Papillomavirus
- stimulerar celldelningen i celler för att få tag i DNA-polymeras
Parvovirus B19 ger “femte sjukan”.
- tropism?
- vilka symtom fås?
Parvovirus infekterar benmärgsceller (stamceller) i erytropoesen. Kan också replikera i fosterceller.
Symtom
- erythema infectiosum - röda kinder
- pga infektion i erytroblaster fås aplastiska erytrocyter
DNA-virus
- vad är early genes och late genes?
- varför delar DNA-virus upp sina gener på detta sätt?
E
- gener som kodar för replikation av viralt genom
L
- gener som kodar för strukturproteiner (kapsiden)
E uttrycks först. L uttrycks senare, då dessa känns igen av immunförsvaret.
Hur relateras transkriptionsfaktorer och receptor till en DNA-virus tropism?
Transkriptionsfaktorer
- specifik cell kanske endast uttrycker TF nödvändiga för viruset
- t.ex. har Hepatit B-virus tropism för hepatocyter. pga cellspecifika promotorer.
Receptor
- virus måste kunna binda till en receptor på en cell.
Hur kan ett DNA virus utnyttja sitt lilla genom och göra “mycket” proteiner av ett litet genom? 3 mekanismer.
- Alternativa promotorer (läsramar)
- Alternativ mRNA- splicing –> olika proteiner från samma mRNA.
- Transkription från båda DNA-strängar. (adenovirus)
Hur skiljer sig RNA och DNAvirus i hur dem utnyttjar sitt genom genom hur dem får sina produkter?
RNA-virus
- genomet ger ett polyprotein som klyvs av proteaser till mindre proteiner
DNA-virus - bättre på att reglera sitt uttryck!
- kan ha flera promotorer i sitt genom
- kan ha mRNA splicing. Kan därför producera många olika mRNA.
Vad är skillnaden på akut och persisterande infektion?
Akut (DNA och RNA)
- viruset försökar sig och sprider sig. Immunförsvaret dödar alla virusinfekterade celler sedan.
- viruset försvinner helt från kroppen
Persisterande (latent eller kronisk) (BARA DNA virus)
- startar på sama sätt som en akut infektion, men virusnivåerna går aldrig ner till 0.
Kronisk
- detekterbara virusnivåer hela livet. Kontinuerlig virusproduktion.
Latent
- Inga påvisbara virus. Virusgenom finns kvar i cellerna men uttrycks inte.
- Gömmer sig i våra celler och kan reaktiveras
Nämn exempel på riskfaktorer där ett latent DNA-virus kan reaktiveras
- hög ålder - immunförsvaret blir sämre med tiden.
- organtransplantation (immunsupprimerande läkemedel)
- cancer
= när vårat immunförsvar är försvagat av någon anledning!
Varför måste RNA-virus infektera många personer jämfört med DNA-virus?
RNA virus integreras inte i vårat genom. Det bekämpas lättare av immunförsvaret än DNA-virus. Viruset måste infektera många för att överleva + att människor får immunitet.
RNA-virus producerar därför stora mängder virus vid en akut infektion, som kan spridas till nästa värddjur.
Skillnad generellt i
- virulens
- populationsstorlek
- zoonoser
DNA vs RNA
Vilka DNA-virus har hölje vs nakna? OBS vi ska inte kunna anellovirus, pox.
- Minnesramsor!
Nakna
- PPPAA
Hölje
- PHH
Adenovirus
- struktur
- genom
- tropism
- exempel på sjukdomar
Vilka 2 gener är viktiga för virusets överlevnad (early genes)?
Linjärt dsDNA
- 35kB
- ikosahedral kapsid naket
Tropism
- epitel, persistens i lymfoida celler
Sjukdomar
- allvarliga luftvägsinfektioner (ARDS)
- pneumoni hos barn
- gastroenterit, diarré (2 virus)
- konjunktivit
Gener
E1A - pRB = tvingar cell i S-fas
E1B - p53 = hämmar apoptos
HPV
- struktur
- genom
- tropism
- exempel på sjukdomar
Cirkulärt dsDNA
- 8 kB
- naken
- ikosahedral
Tropism
- epitelceller endast
Sjukdom
- kan orsaka cancer i cervix, anal.
Humana parovirus
- struktur
- genom
- tropism
- exempel på sjukdomar (finns 3 humana parvovirus, beskriv dem 2 relevant)
Linjärt ssDNA
- 5 kB + eller -
- ikosahedral kapsid
- kan bara replikera i celler med aktiv cellcykel
Tropism
- erytroblaster
B19-virus
- erytroblaster, binder P-blodgruppsantigen
- ger femte sjukan hos barn
- hos vuxna - ledvärk och artrtit pga immunkomplex
- Kan ge en aplastisk kris
- Fetal infektion av foster - fetal hydrops och fosterdöd innan vecka 20
Bocavirus
- gastrointestinala infektioner hos barn
