Coronavirus (zoonos) Flashcards
70 % av alla humana infektioner är….
zoonoser!
Nämn dem faktorer som bidrar till ökad förekomst av zoonoser och som orsakar nya pandemier hos människa. 4 saker.
- Urbanisering - tränger ihop människor, djur, bakterier. Överföringsrisk ökar
- Resande - vi reser mer internationellt och sprider virus och patogener.
- nya virus introduceras i en population som har 0 immunitet –> snabb spridning –> kan leda till pandemi - Tränga ihop människor och djur - t.ex. marknader.
- Befolkningen i världen ökar
- Vilket i sin tur leder till klimatförändringar, skövling av skog och eradikering av biodiversitet, vilket ökar risken för zoonoser.
- Detta ger emerging diseases - sjukdom som sprids plötsligt
Vilket djur tros från början gett uppkomst till humant SARS- Cov 2, och vilket mellanvärddjur?
Reservoir - fladdermus
Mellanhand - Pangolin. Myrkotte.
Coronaviridae
- genomtyp?
- beskriv höljet med dess proteiner
- orsakar vilka sjukdomar hos människa?
Icke segmenterat +ssRNA. Största RNAviruset. 30 kb.
- hölje med spike-glykoproteiner (binder receptor på målcell)
- i höljet hemaglutinin-esteras
- Orsakar gastroenterit och är näst vanligaste orsaken till förkylning
Coronavirudae - subfamilj coronavirus, har det största genomet av RNA-virus.
- vad är unikt för detta RNA-virus som härleds till att genomet kan vara såpass stort?
Coronavirus har RNA-polymeras med proof reading, liksom DNA-virus.
- Därför kan RNA-polymeraset rätta till dem fel som görs.
Proof reading
- exonukleasaktivitet med Nsp14 3 till 5 prim - riktning.
Subfamiljen coronavirus har 4 olika genus. Vilka?
- vilket genus finns förskylningsvirus?
- vilket genus sars-cov 1 + 2, och MERS?
Genus
- Alfa, beta, gamma och delta - coronavirus finns.
Beta-genus - grupp A + alfa-genus
- förkylningsvirus
Beta genus - grupp B
- SARS - CoV 1 och 2
Beta genus - grupp C
- MERS- CoV
Hur många humana coronavirus finns, och vilka av dem har orsakat epidemier och pandemier med svår sjukdom och död?
7 humana kända coronavirus.
- SARS COV 1, SARS COV 2 och MERS, 3 st, har orsakat pandemier.
- övriga 4 är endemiska/säsongsvirus som orsakar förkylning
Infektion av coronavirus sjunker hos äldre befolkning. Varför?
Pga vi har antikroppar mot dessa virus
SARS Cov 1 har utrotats i princip. 10 % mortalitet.
- vilket annat farligt virus förutom Sars Cov 2 förekommer i lokala utbrott, hur smittar det och hur hög är mortaliteten?
MERS (2012- nutid)
- 34 % mortalitet
- smittar från kamel till människa
SARS Cov 2
- receptor på målcell?
- beskriv livscykeln
SARS 2 har ACE2 som receptor på målcell, liksom SARS 1.
Livscykel
- Spikeprotein binder ACE2
- Endocytos. +ssRNA kommer ut. Translateras av ribosomer, opening reading frame 1a och 1b.
- RNA-polymeras fås som transkiberar nya -ssRNA och replikerar också. Replikation –>
- ssRNA fås. Används för replikation till +ssRNA och till mRNA. - Alla protein och genom går via ER –> golgi.
- Därefter sätts kapseln ihop.
- Exocytos.
Vilket R0 har SARS Cov 2?
2-8
SARS CoV 2
- inkubationstid
- symtom
50 % av alla infektioner är smittsamma innan symtom!
Vilka åldersgrupper har den högsta mortaliteten för SARS-Cov 2?
70-80 år 8 %
+80 år 15 %
När vi förändrar våran omgivning i naturen ökar risken för nya zoonoser som kan ge pandemier.
- hur kan man bli bättre på att förutsäga en emerging disease från djurvärlden?
- Upptäcka snabbt när en förändring sker i naturen, t.ex. klimatförändring, för att förutspå att en ny zoonos kan komma
- Därefter rikta resurser till att spåra virus och mäta virusnivåer i djur och insekter. På så vis förutsäga vilken zoonos som kan bli den nästa att drabba människan.
- Därmed bli mer förberedda på
Snabbtester för antigenpåvisning finns för Sars Cov 2. Vad är nackdelen jämfört med PCR?
Lägre sensitivitet än PCR.