מבנה ותפקוד של RNA

Question 1

לכל מולקולות

MRNA

יש 4 דברים-מה הם?

איזה עוד שני דברים נמצא רק ביוקריוטים?

Answer 1

1. UTR3 untranslated region
2. UTR5
3. ORF-האזור היחידה במולקולה שעובר תרגום
4. קודוני אתחול וקודוני סיום

AUG-83%

UGA UAA UAG

לשים לב שקודני אתחול נמצאים בכל התחלה של מסגרת קריאה ולא בתחילת מולקולת המרנא

רק ביוקריוטים:

5 CAP

POLY A בקצה 3

Question 2

לRNA

יש היררכיה ארגונית של מבנה

ראשוני שניוני שלישוני ורביעוני

מה קורה בכל אחד ומה תפקידו?

Answer 2

מבנה ראשוני- רצף הנוקלאוטידים

מבנה שניוני- התארגנויות מקומיות המבוססות על זיווגי בסיסים בין רצפים קרובים

שמתקפלים על עצמם .רוב זיווגי הבסיסים הם זיווגי ווטסון קריק, מידי פעם נראה קשר G-U שעושה וובל ומעשיר את המגוון.

שלישוני- אינטרקציה של אלמנטים בודדים שניוניים רחוקים ליצירת מבנים מורכבים.

רביעוני- רנ”א עם יון מתכת חד או דו ערכי

Question 3

מה תפקידם של יוני מתכת חד ערכיים המצווים במבנים מורכבים של RNA?

מה תפקידים של יוני מתכת דו ערכיים?

Answer 3

חד ערכים- מונעים דחייה פנימית בתוך הרנא עי ניטרול מימני הפוספטים

דו ערכיים - מנטרלם קבוצות טעונות שלילית, ויוצרים קשרי קואורדינציה . למשל מגנזיום קושר מין או חמצני פופסטים . כך הוא מסוגלים לייצר התארגנות מיוחדות של מבנה הרנא

Question 4

ריבוסוויצ’

מה העיקרון שעומד מאחורי המנגנון הזה של הבקרה?

Answer 4

מנגנון הוא על ידי בקרה בעזרת מולקולות קטנות, אשר משפיעות על שעתוק של רנא

זוהי בקרה אלוסטרית

הסבר שלי:ריבוסוויצ’ זה מנגנון בקרה שפועל ב

substrate feedback inhabition

כאשר תוצר גן מצוי בעודף הוא נקשר לאזור שנקרא אפטמר בו יש חלק (פלטפורמת הביטוי) שכתוצאה מקשירת הסובסטרט מתשנה המבנה המרחבי שלה ומידת ביטוי הגן משתנה

כמו באופרון הטריפטופן

Question 5

מהו אפטמר ובאיזה אזור הוא נמצא לרב?

Answer 5

אפטמר הוא אזור ברנא אשר יודע לקשור מולקולות קטנות

(ליגנד)

לרוב האפטמר ימצא אזור ה

5’ UTR

ברנא

Question 6

בספר יש דוגמה קטנונית על דוגמה שריבו-סוויצ׳ יכול לשמש כריבוזים.

מה קורה שם?

Answer 6

יש סוג של ריבוסוויצ’ שפועל כריבוזים ויודע לחתוך

MRNA

ספציפית לגן שמייצר סוכר שנקרא גלוקוז-6 אמין פוספט

רק לדעת שקיים

Question 7

מה זה ריבוזים?