מודיפיקציות בסיסים

Question 1

מהם זיווגי ווטסון קירק ו

WOBBELL

בRNA

Answer 1

ווטסון:

AU-GC

Wobble

I-CUT

G-U

Question 2

למה רנא מסוגל לעבור ספלייסינג ודנא לא?

Answer 2

OH

על פחמן 2

Question 3

למה לרנא יש פעילות קטליטית לדנא לא?

Answer 3

OH

על פחמן 2

Question 4

איזה אנזים אחראי לבצע דה אמינציה של אדנין ולהפכו לאינוזין ב

MRNA

TRNA

Answer 4

TRNA- ADAT

MRNA-ADAR

Question 5

איזה ויטמין דרוש לדה אמינציה?

Answer 5

PLP

ויטמין B6

Question 6

האנזים

DAM

תפקיד

איפה מצוי

Answer 6

DAM Methlase

אנזים ממתל

פועל רק על דאוקסינוקלאוטידים וספציפית על אדנין

מצוי רק פרוקריוטים

איננו חלק מהמתילאזות שקשורות לבקרת ביטוי גנים אלא פועל כדי לאפשר למערכות תיקון הדנא לדעת מי גדיל האב

הגדרה וויברית:

The deoxyadenosine methylase that adds methyl groups to the A in the sequence GATC in the DNA of E. coli cells. The mismatch repair system inspects the methylation of GATC sequences to determine which strand is newly synthesized, and therefore unmethylated

Question 7

מה המטרה של מתילצית דנא בפרוקריוטים?

3 סיבות

Answer 7

א. זיהוי גדיל לעומת חדש

ב. הגנה מפני חיתוך של אנזימי רסטריקציה

ג. זיהוי עצמי מול זר כחלק ממנגנון מערכת חיסונית פרימטיבית

Question 8

מה המטרה של מתילציה של דנא ביוקריוטים?

2.5 מטרות

Answer 8

א. בקרת ביטוי גנים

ב. זיהוי גדיל חדש לעומת ישן

ג. החתמה גנומית - אפשר גם להכניס את זה תחת בקרת ביטוי גנים, רק שזה יותר מתייחס לתורשה

Question 9

מהם

GpC islands?

מהם

GpC sequence?

Answer 9

CpG island A region of DNA containing many unmethylated CpG sequences. Usually associated with active genes.

אזור בדנא שמכיל מלא רצפים חוזרניים של ג’י סי. אזורים אלו בדרך כלל לא ממותלים בכלל ונמצאים סמוך לפרומטרים.- בערך ב80% מהם. יש להם תפקיד בבקרת ביטוי גנים כי באזורים בהם הם מצויים בשפע יש קורלציה לרמות ביטוי יותר גבוהות

CpG sequences Motifs in mammalian DNAs that are targets of methylation (at the 5-position of the C).

CpG suppressionLoss of CpG sequences from genomes over evolutionary time because of methylation of the C and subsequent deamination to T.

Question 10

דה אמינציה של ציטוזין

Answer 10

אורציל

כי

C

זה כמו

U

הפוכה

Question 11

דה אמינציה של

Cmet

Answer 11

טימין

Question 12

סיבוב של יורידין ב180 מעלות

וחיבורו דרך פחמן 5 לריבוז

מה לא מתקיים בו?

Answer 12

פסאודויורידין

אין קשר N

גליקוליזידי

זה קשר גיליקוזידי רגיל כי הוא מחובר מהפחמן ולא מהחנקן

Question 13

מתילציה ודה אמינציה של ציטוזין

Answer 13

ריבוטימידין