שעתוק פרוקריוטי לעומת יוקריוטי

Question 1

איפה מתרחש השעתוק בפרוקריוטים ואיפה ביוקריוטים?

Answer 1

פרו- בציטוזול

יוקריוטים- בגרעין

Question 2

כמה פולימראזות ביו וכמה בפרו? מה כל אחד משעתק

Answer 2

פרוקריוטים- רנא פולימראז 1- משעתק הכל

יוקריוטים-3

RNA pol 1- rRNA but only the 28s 18s 5.8s

RNA pol 2- pre-mRNA, pri-mRNA , snRNA

RNA pol 3- tRNA, rRNA 5s, and some of the snRNA

Question 3

מבנה פולימראז הרנא

פרוקריוטים לעומת יוקריוטים

כמה תת יחידות

על מה אחראית כל תת יחידה

איך מגוייסת הפולימראזות

Answer 3

רנא פולימראז פרוקריוטי:

בנוי מ6 תת יחידות:

פעמיים אלפא- אחראית למעבר לאילונגציה וגם בעלת זנב קרבוקסילי שנקשר לפרומטור מרוחבת ועוזר לקדם את האינציאציה

בטא ובטא טאג- אחראיות לאילונגציה הן מהוות את האתר הקטליטי שמאפשר את יצירת הקשר פוספודיסאסטרי . מכילות אספרטט ויון מגנזיום

תת יחידה אומגה- מהווה את הבק בון של כל הפולימראז

תת יחידה סיגמא- אחראית לזהות את הפרומוטור

רנא פולימראז יוקריוטי:

מכיל 4 תת יחידות הומולוגיות - רק לפאקטורי הליבה ולא לסיגמא.

מלבדן יש לו עוד תת יחידות רבות.

בRNA POL 2:

יש גם יון מנגן וגם יום מגנזיום באתר הקטליטי

הזנב הקרבוקסילי מצוי על תת יחידה בטא טאג (ולא על אלפא כמו בפרו) . תת יחידה בטא טאג נקראת- RBP1

also called RBP1=B’, the CTD shot is there

הגיוס של הפולימראז נעשה באמצעות פאקטורי שעתוק כללים-GTP
נרחיב בנפרד​

Question 4

איך נקרא הפורומטור הקלאסי?

איפה הוא ממוקם?

Answer 4

יוקריוטים- TATA BOX

פרוקריוטים- PRIBNOW BOX

בפרוקריוטים הפרומטר נמצא תמיד אפסטרים ולא משועתק, ביוקריוטים גילו שיש גם פרומטר דאונסטרים שכן משועתק.

Question 5

מה ההבדל באופן השעתוק

מונו לעומת פוליציסטרוני

Answer 5

בפרוקריוטים- יש מספר ריבוזומים שעובדים על אותו מרנא במקביל על מסגרות קריאה שונות

ביוקריוטים שעתוק ותרגום מבודדים בזמן ובמרחב ובכל פעם משועתק גם בודד, כל מרנא מקודד לגן אחד אין מספר מסגרות קריאה - מונוציסטרוני

Question 6

טרמינצית השעתוק

Answer 6

פרו- תלוית חלבון רו או תלויית רצף פולי איי או פולי יו. בשני המקרים יווצר מבנה גבעול לולאה פילנדרומי שיאט את הפולימראז

יוקריוטים- לא ידוע

Question 7

פאקטורי שעתוק

Answer 7

פרו- יחידות סיגמא שונות מאפשרות זיהוי פרומטורים שונים

יוקריוטים יש מלא

GTF-General transcription factors

וגם שלוש פולימראזות שעובדות עם סטים שונים של פאקטורי שעתוק כללים כך שהבקרה עליהם גם נעשת תחת רצפים שונים בתכלית

Question 8

עיבוד

MRNA

Answer 8

פרוקריוטים- יש תהליך הגהה מצומד לשעתוק

אין אינטרונים

אין פולי איי

אין 5 CAP

יש עריכה של רנא ריבוזומלי וטי רנא באמצעות ריבוזימים כמו RNASE3-

• חשוב להדגיש שעל אף שיש עיבוד של רנא, תהליכי עיבוד עבור*
• MRNA הם יחודיים ליוקריוטים*

יוקריוטים- לאחר יצירת ה

pre/nh-mRNA

בגרעין: יש פוליאדנילציה, הוספת 5 קאפ, הסרת אינטרונים שחבור חליפי

בציטוזול: יש מגנון של RNAi

שמתחיל בגרעין וממשיך בציטוזול,

Question 9

בקרות ביטוי גנים

Answer 9

פרוקריוטים:

ברמת האופרון- חיוביות או שלילית באמצעות רפרסורים ואקטבטורים או עיכוב/הגברה עי סובסטרט

ברמת הפרמוטור-

iNTP

מעודד גיוס פולימראזות

ppGpp

מדכא גיוס פולימראזות (אלרמון)

יוקריוטים:

באמצעות GTPs

אינהסרים ואקטיבטורים

רספונס אלמנטס שפועלים רק בתודבה לאינדוסרים הפועלים בציס

Question 10

נתקלנו בשוט הקרבוקסילי

זנב ה CTD

גם בפרו וגם ביו

איפה הוא מצוי בכל פולימראז מה תפקידו ואיזה חומצות אמינו נפוצות בו

Answer 10

יוקריוטים:
מצוי ברנא פולימראז 2, בתת יחידה בטא טאג- RBP1

תפקיד: זירוז מעבר מאינציאציה לאילונגציה , זימון חלבונים להנחת ה5 קאפ והפולי איי.

חומצות אמינו: מכיל רצף של 7 חומצות מסוג טס”ט

לגבי זירוז מעבר לאילונגציה- TF2H

מזרחן את זנב הCTD זהמאפשר לו לפעול כמפרימאז והליקאז

פרוקריוטים:

מצוי בתת יחידה אלפא-

תפקידו: להיקשר לרצפי אפ שמגבירים גיוס פולימראזות במסגרת אקסטנדד פרומוטר