שחבור חליפי Alternative splicing + RNA editing Flashcards
כיצד יכול להיות שיש לנו הרבה יותר חלבונים מגנים?
2 פתרונות
א. אלטרנטיב ספלייסינג-
- המנגנון הזה יוצר Mrna
- שונה ע”י קומבניצית אקסונים שונים שיוצרים מנעד רחב של תבניות ביטוי ותרגום. תפקיד השחבור החליפי הוא להגביר את כמות ושונות החלבונים הנוצרים מגן בודד
מעל 90 אחוז מהגנים האנושיים עוברים שחבור חליפי
*זה לא הפתרון היחיד
- RNA EDITING-בהרחבה בהמשך
מהם חלבוני
SR
איזה דומיין יש להן?
מה תפקידם?
חלבוני SR
נקשרים לרצפים ייחודי שמגבירים את הסיכוי שאותו אקסון יכלל בתעתיק הסופי ישוחבר החוצה
יש להם דומיין
RS
עשיר ארגינין וסרין
הם ספציפית יודעים גייס את הפאקטור
U2AF מהספלייסוזום
ואת פאקטור U1
למקומם כדי לקדם את השחבור שלהם
מהו רצף
ESE
ESS
רצפי ESE-exon splicing enhencer - מעודדים שחבור החוצה
-מגיבירם שחבור החוצה-מתקשרים עם חלבוני SR
רצפי ESS-exon silincing sequence-מקטינים סיכוי לשחבור
מתקשרים עם חלבוני nhRNP
אלו הם חלבונים הנקשרים
ל pre-mRNA
מגנים עליו מפני שחבור.
מה תפקידו של זנב ה
CTD
בשחבור?
משמש לזיהוי אקסונים אבל לא אינטרונים
שחבור חליפי משפיע על קביעת המין בדרוזופילה
למה מקודד הגן DSX
מה יקרה אם אקסון 4 בגן הזה יהיה קיים?
מה יקרה אם הוא ישוחבר החוצה?
מה תפקידו של TRA
מי מבקר את TRA
DSX- מקודד לרפרסור של שעתוק
אם אקסון 4 יהיה קיים - נקבל נקבה
אם אקסון 4 ישוחבר החוצה באלטרנטיב ספלייסנג-יוולד זכר
TRA- אחרי לכך שאקסון 4 ישאר בנקבות
SXL- גורם הבקרה של הספלייסנג של הגן
TRA ושל עצמו
TRA אחראי לכך שלא יהיה שחבור החוצה ושתתקבל נקבה
מה זה
RNA EDITING
זה בתכלס מודיפיקציות על נוקלאוטידים - יצירת חלבון שונה עי מודפיקציות בסיסים שמזיזות את מסגרת הקריאה של הכן
באותו אופן מקודדים חלבוני
APO
איזה אנזים מזרז את היצירה במנגנון עריכת
RNA
חלבון ששוקל חצי ממשפחת APO
c-DAR - מתבטא רק במעי
הקודון הופך לקודון סיום ואז יש לנו חלבון אחד ששוקל 100
KD בכבד
ואחד ששוקל 48 במעי
מלבד אלטרנטיב ספלייסינג מסורתי, איזה עוד דוגמאות יש לאטרניב ספלייסנג?
שחבור בטרנס- תהליך ספלייסינג של שני אקסונים מגנים שונים שעוברים שחבור ביחד
שחבור שמפיע על ביטוי נוגדנים-לא מנגנון עיקרי
קיבעת הזוויג בדרוזופילה- אם אקסון 4 לא קיים זה זכר, יהיה דיכוי של גנים נקבים .אחרת נקבה זה דיפולט כמו בכל יוקריוטי
