Replikation, transkription og translation Flashcards

1
Q

Hvorfor indeholder replikationsstartstedet mange AT-basepar og ikke CG-basepar?

A

Da AT-basepar kun interagerer med to hydrogenbindinger og derfor lettere at bryde op.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nævn det enzym med helikase-aktivitet, som er knyttet til replikationsstedet.

A

MCM-2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvad kaldes det sted, hvor helikase enzymet åbnet helix-strukturen op?

A

Replikationsøjet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvad bruger helikase enzymerne under åbningen af DNA-helixen?

A

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

DNA-enkeltstrengene efter åbning af helixen i replikationen får bundet replikationsprotein A til sig. Hvad er funktionen af disse proteiner?

A

Forhindre reassociering ad DNA-strengene under processen.
Modvirker at hver enkeltstreng danner selvkomplementære hårnålsstrukturer, der vil forhindre replikation.
Beskytter de eksponerede histonfrie DNA-strenge mod angreb fra endonucleaser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvor mange nucleotider mistes der typisk efter hver celledeling?

A

50-100

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvor mange gange kan normale humane celler dele sig?

A

50-60 gange

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvad er forskellen mellem leading-strand og lagging-strand?

A

Leading-strans aflæses fra 3´-5´-enden. Hurtigste proces.
Lagging-strand aflæses fra 5´-3´-enden. Skal syntetiseres i små fragmenter, der bagefter skal ligeres sammen. Langsom proces.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad sker der, hvis der er indbygget et forkert nukleotis i DNA-strengen under replikationen?

A

DNA-polymerasen stopper med at forlænge DNA-strengen og vil derefter formidle fraspaltning af det forkerte nukleotid.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilket enzym bruger DNA-polymerasen ved fraspaltning af et forkert indsat nukleotid?

A

Exonuklease-aktivitet, som er indbygget i polymerasen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvor sidder topoisomeraser?

A

Foran replikationsgaflen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvad er funktionen af topoisomeraser?

A

Er med til at ophæve dobbeltsnoning, som ses under replikation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Nævn de to typer af topoisomeraser der findes

A

Type I

Type II

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvad er funktionen af topoisomerase type I?

A

Katalyserer lokal rotation af DNA-helixen om sin egen akse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad er funktionen af topoisomerase type II?

A

Katalyserer kløvning af begge DNA-strenge.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvad hedder snoningen foran DNA´et, der hvis de ikke fjernes, vil bremse replikationen?

A

Supercoils

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvad hedder de 3 faser i transkriptionen?

A

Initieringen
Elongeringen
Termineringen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hvad går transkriptionen grundlæggende ud på?

A

At forme mRNA ud fra DNA-skabelonen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hvordan startes transkriptionen?

A

RNA-polymerase II enzymer binder til en promoter, der sidder på DNA´et.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvad er promotorens funktion under transkriptionen?

A

Definerer startstedet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvad er det overordnet promoteren gør?

A

Promoteren genkendes af DNA-bindende proteiner (transkriptionsfaktorer), som rekrutterer RNA-polymerasen til transkriptionsstratstedet/promoteren.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hvilke to dele inddeles promotoren i?

A

Core-promoteren

Opstrøms-promotor-elementer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hvilke elementer indgår i core-promotoren?

A

Sekvensmotiver
Transkriptionsfaktorer
Mediatorkompleks
RNA-polymerase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Hvad er opstrøms-promotor-elementer og hvilken funktion har de?

A

Transkriptionsfaktorer, der assisterer i samling af komplekset på core-promoteren.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Hvilken retning kan mRNA syntetiseres ud fra?

A

5´ -> 3´

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Hvornår forlader RNA-polymerase-komplekset promotor-regionen?

A

Når der dannes 10-20 nukleotider.

27
Q

Efter RNA-polymerase-komplekset har forladt promotorregionen, hvad associereres den da med?

A

Elongatorkompleks.

28
Q

Hvad indeholder elongatorkomplekset og hvilken funktion har den?

A

Enzymer.

Formidler ændring af nukleosomet, så den kan bevæge sig langs det nukleosombundne DNA

29
Q

På RNA-polymerasen sidder en C-terminal hale, som under transkriptionen bliver fosforyleret, hvilket medvirker til at proteiner binder. Hvad er medierer disse proteiner?

A

Capping
Polyadenylering
Splejsning af mRNA-strengen.

30
Q

Hvilken retning bevæger RNA-polymerasen sig på DNA-skabelonen?

A

3´ -> 5´

31
Q

Hvad kaldes mRNA´en som dannes ud fra DNA-skabelonen?

A

Sense-strand

32
Q

Hvad kaldes DNA-stengen også?

A

Anti-sense-strand

33
Q

Hvilke processer indgår i transkriptionens termineringsfase?

A

Capping
Polyadenylering
Splejsning af mRNA-strengen.

34
Q

Hvornår bliver mRNA-strengen processeret færdig under transkriptionen?

A

Under og efter transkriptionen.

35
Q

Hvad består cappen af?

A

Guaninnukleotider

36
Q

Hvornår påsættes cappen på mRNA?

A

Når den er 20-40 nukleotider lang og dukker frem bag RNA-polymerase-komplekset.

37
Q

Hvad sker der efter cappen er påsat på mRNA´et?

A

Den genkendes og bindes af særlige cap-bindende proteiner.

38
Q

Hvad er funktionen ved capping?

A

Beskytter mRNA mod angreb fra 5´-exonukleaser
Nødvendig for en effektiv translation
Assisterer i samling af slejsningskomplekset og udsplejsning af de første introns.

39
Q

Hvordan kommunikeres kløvningen og polyadenyleringen af mRNA-strengen?

A

I genet ligger signalet, som et AAUAAA-sekvensmotiv, der efterfølges af en CA-dinukleotid-sekvens og en GU- eller U-rig sekvens.

40
Q

Hvordan dannes poly-A-halen?

A

Polyadenyleringspolymerase binder til mRNA-strengen, hvor den katalyserer forlængelse af det trunkerede mRNA med 200-250 adeninnukleotider.

41
Q

Hvordan beskyttes poly-A-halen mod nedbrydning?

A

Ved at der bindes en række proteiner til halen.

42
Q

Hvad er funktionen af poly-A-halen?

A

Faciliterer eksport af den færdig processerede mRNA-streng ud af kernen.
Stimulerer splejsning af den sidste intron.

43
Q

Hvad udsplejser introns?

A

Et spicesom og en række proteiner.

44
Q

Hvordan splejser spicesomet introns ud?

A

I exon-intron-grænseområdet er der bestemte sekvensmotiver, splejsningssekvenser, som splicesomet genkender og binder.

45
Q

Hvad starter og slutter næsten alle introns med?

A

Starter med GU-sekvens

Slutter med AG-sekvens.

46
Q

Hvordan formidles transporten af mRNA fra kernen og ud i cytosolen?

A

Særlige nukleære eksportfaktorer genkender og binder exon-exon-grænseregioner, som derved formidler transport af mRNA gennem de nukleære porer.

47
Q

Hvad betyder genetisk kode?

A

mRNA-strengen som definerer den korrekte rækkefælge af aminosyrer i det færdige protein.

48
Q

Hvad betyder tRNA?

A

Aflæser mRNA-strengens kode.

Består af to bindingsteder: et for en bestemt sekvens og et for aminosyren.

49
Q

Hvad gør aminoacyl-tRNA-syntetaser?

A

Enzymer der kobler tRNA-molekyler med rette aminosyrer.

50
Q

Hvad er den åbne læseramme i forbindelse med translationen?

A

Sekvensen mellem en startcodon og en stopsodon, da den er åben for translation.

51
Q

Hvad koder 5´-ende of 3´-enden for i proteinet?

A

5´-enden: N-terminalen

3´-enden: C-terminalen

52
Q

Beskriv kort det første trin af initieringen i translationen

A

Rekruttering af ribosomet og et initiator-tRNA-molekyle

53
Q

Nævn de tre trin i elongeringsfasen i translationen

A

Indlejring af korrekt aminoacyl-tRNA
Dannelse af peptidbinding
Translokation til næste codon

54
Q

Hvad er funktionen af A-sitet (acceptor-site)?

A

Bindingssted for indkommende aminoacyl-tRNA-molekyler.

55
Q

Hvad er funktionen af P-sitet?

A

Bindingssted for peptidyl-tRNA-molekuler, som er det tRNA, der bærer den polypeptidkæde, der allerede er syntetiseret.

56
Q

Hvad er funktionen af E-sitet?

A

Der hvor det tRNA, som har afleveret dens aminosyre bliver placeret inden den dissocierer fra ribosomet.

57
Q

Hvad sker der når A-sitet møder mRNAs stopcodon?

A

Release-factor-GTP genkender stopcodonet og binder. Den stimulerer hydrolyse af bindingen mellem peptidkædens C-terminal og tRNA-molekyler og ved fraspaltning af peptidkæden terminerer translationsprocessen.

58
Q

Hvad betyder et polysom/polyribosom?

A

Når en enkelt mRNA-streng indgår i et kompleks med mange ribosomer, som derved kan give ophav til syntese af manne peptidkæder.

59
Q

Hvordan sendes de færdig translaterede proteiner til membranomkransende organeller?

A

Proteinerne bærer lokaliseringssekvenser, signalpeptider, der sidder i deres N-terminal.

60
Q

Hvor mange aminosyrer indeholder signalpeptidet i et protein?

A

10-20

61
Q

Hvor påbegyndes translationsprocessen altid?

A

på frie ribosomer i cytosolen

62
Q

Hvad sker der, når signalpeptidet bliver syntetiseret i translationsprocessen og dukker frem på ribosomet?

A

Det genkendes af cytosolært-protein-RNA-kompleks, SRP.

63
Q

Hvad sker der når SRP har bundet sig til signalpeptidet?

A

Translationen stoppes midlertidig.
Ribosomet bringes til en SRP-receptor i ERs membran.
En kanal åbner omkring signalpeptidet og translationen fortsætter.
Polypeptidkæden syntetiseres gennem kanalen og ind i ER.
Herefter frakløves signalpeptidet eller bliver brugt som et membranprotein.

64
Q

Hvad sker der når proteinet er færdigsyntetiseret?

A

Bliver foldet vha. chaperoner i ER.

Fra ER overføres det til golgi vha. vesikler.