Replikation, transkription og translation Flashcards

1
Q

Hvorfor indeholder replikationsstartstedet mange AT-basepar og ikke CG-basepar?

A

Da AT-basepar kun interagerer med to hydrogenbindinger og derfor lettere at bryde op.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nævn det enzym med helikase-aktivitet, som er knyttet til replikationsstedet.

A

MCM-2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvad kaldes det sted, hvor helikase enzymet åbnet helix-strukturen op?

A

Replikationsøjet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvad bruger helikase enzymerne under åbningen af DNA-helixen?

A

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

DNA-enkeltstrengene efter åbning af helixen i replikationen får bundet replikationsprotein A til sig. Hvad er funktionen af disse proteiner?

A

Forhindre reassociering ad DNA-strengene under processen.
Modvirker at hver enkeltstreng danner selvkomplementære hårnålsstrukturer, der vil forhindre replikation.
Beskytter de eksponerede histonfrie DNA-strenge mod angreb fra endonucleaser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvor mange nucleotider mistes der typisk efter hver celledeling?

A

50-100

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvor mange gange kan normale humane celler dele sig?

A

50-60 gange

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvad er forskellen mellem leading-strand og lagging-strand?

A

Leading-strans aflæses fra 3´-5´-enden. Hurtigste proces.
Lagging-strand aflæses fra 5´-3´-enden. Skal syntetiseres i små fragmenter, der bagefter skal ligeres sammen. Langsom proces.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad sker der, hvis der er indbygget et forkert nukleotis i DNA-strengen under replikationen?

A

DNA-polymerasen stopper med at forlænge DNA-strengen og vil derefter formidle fraspaltning af det forkerte nukleotid.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilket enzym bruger DNA-polymerasen ved fraspaltning af et forkert indsat nukleotid?

A

Exonuklease-aktivitet, som er indbygget i polymerasen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvor sidder topoisomeraser?

A

Foran replikationsgaflen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvad er funktionen af topoisomeraser?

A

Er med til at ophæve dobbeltsnoning, som ses under replikation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Nævn de to typer af topoisomeraser der findes

A

Type I

Type II

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvad er funktionen af topoisomerase type I?

A

Katalyserer lokal rotation af DNA-helixen om sin egen akse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad er funktionen af topoisomerase type II?

A

Katalyserer kløvning af begge DNA-strenge.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvad hedder snoningen foran DNA´et, der hvis de ikke fjernes, vil bremse replikationen?

A

Supercoils

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvad hedder de 3 faser i transkriptionen?

A

Initieringen
Elongeringen
Termineringen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hvad går transkriptionen grundlæggende ud på?

A

At forme mRNA ud fra DNA-skabelonen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hvordan startes transkriptionen?

A

RNA-polymerase II enzymer binder til en promoter, der sidder på DNA´et.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvad er promotorens funktion under transkriptionen?

A

Definerer startstedet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvad er det overordnet promoteren gør?

A

Promoteren genkendes af DNA-bindende proteiner (transkriptionsfaktorer), som rekrutterer RNA-polymerasen til transkriptionsstratstedet/promoteren.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hvilke to dele inddeles promotoren i?

A

Core-promoteren

Opstrøms-promotor-elementer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hvilke elementer indgår i core-promotoren?

A

Sekvensmotiver
Transkriptionsfaktorer
Mediatorkompleks
RNA-polymerase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Hvad er opstrøms-promotor-elementer og hvilken funktion har de?

A

Transkriptionsfaktorer, der assisterer i samling af komplekset på core-promoteren.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Hvilken retning kan mRNA syntetiseres ud fra?
5´ -> 3´
26
Hvornår forlader RNA-polymerase-komplekset promotor-regionen?
Når der dannes 10-20 nukleotider.
27
Efter RNA-polymerase-komplekset har forladt promotorregionen, hvad associereres den da med?
Elongatorkompleks.
28
Hvad indeholder elongatorkomplekset og hvilken funktion har den?
Enzymer. | Formidler ændring af nukleosomet, så den kan bevæge sig langs det nukleosombundne DNA
29
På RNA-polymerasen sidder en C-terminal hale, som under transkriptionen bliver fosforyleret, hvilket medvirker til at proteiner binder. Hvad er medierer disse proteiner?
Capping Polyadenylering Splejsning af mRNA-strengen.
30
Hvilken retning bevæger RNA-polymerasen sig på DNA-skabelonen?
3´ -> 5´
31
Hvad kaldes mRNA´en som dannes ud fra DNA-skabelonen?
Sense-strand
32
Hvad kaldes DNA-stengen også?
Anti-sense-strand
33
Hvilke processer indgår i transkriptionens termineringsfase?
Capping Polyadenylering Splejsning af mRNA-strengen.
34
Hvornår bliver mRNA-strengen processeret færdig under transkriptionen?
Under og efter transkriptionen.
35
Hvad består cappen af?
Guaninnukleotider
36
Hvornår påsættes cappen på mRNA?
Når den er 20-40 nukleotider lang og dukker frem bag RNA-polymerase-komplekset.
37
Hvad sker der efter cappen er påsat på mRNA´et?
Den genkendes og bindes af særlige cap-bindende proteiner.
38
Hvad er funktionen ved capping?
Beskytter mRNA mod angreb fra 5´-exonukleaser Nødvendig for en effektiv translation Assisterer i samling af slejsningskomplekset og udsplejsning af de første introns.
39
Hvordan kommunikeres kløvningen og polyadenyleringen af mRNA-strengen?
I genet ligger signalet, som et AAUAAA-sekvensmotiv, der efterfølges af en CA-dinukleotid-sekvens og en GU- eller U-rig sekvens.
40
Hvordan dannes poly-A-halen?
Polyadenyleringspolymerase binder til mRNA-strengen, hvor den katalyserer forlængelse af det trunkerede mRNA med 200-250 adeninnukleotider.
41
Hvordan beskyttes poly-A-halen mod nedbrydning?
Ved at der bindes en række proteiner til halen.
42
Hvad er funktionen af poly-A-halen?
Faciliterer eksport af den færdig processerede mRNA-streng ud af kernen. Stimulerer splejsning af den sidste intron.
43
Hvad udsplejser introns?
Et spicesom og en række proteiner.
44
Hvordan splejser spicesomet introns ud?
I exon-intron-grænseområdet er der bestemte sekvensmotiver, splejsningssekvenser, som splicesomet genkender og binder.
45
Hvad starter og slutter næsten alle introns med?
Starter med GU-sekvens | Slutter med AG-sekvens.
46
Hvordan formidles transporten af mRNA fra kernen og ud i cytosolen?
Særlige nukleære eksportfaktorer genkender og binder exon-exon-grænseregioner, som derved formidler transport af mRNA gennem de nukleære porer.
47
Hvad betyder genetisk kode?
mRNA-strengen som definerer den korrekte rækkefælge af aminosyrer i det færdige protein.
48
Hvad betyder tRNA?
Aflæser mRNA-strengens kode. | Består af to bindingsteder: et for en bestemt sekvens og et for aminosyren.
49
Hvad gør aminoacyl-tRNA-syntetaser?
Enzymer der kobler tRNA-molekyler med rette aminosyrer.
50
Hvad er den åbne læseramme i forbindelse med translationen?
Sekvensen mellem en startcodon og en stopsodon, da den er åben for translation.
51
Hvad koder 5´-ende of 3´-enden for i proteinet?
5´-enden: N-terminalen | 3´-enden: C-terminalen
52
Beskriv kort det første trin af initieringen i translationen
Rekruttering af ribosomet og et initiator-tRNA-molekyle
53
Nævn de tre trin i elongeringsfasen i translationen
Indlejring af korrekt aminoacyl-tRNA Dannelse af peptidbinding Translokation til næste codon
54
Hvad er funktionen af A-sitet (acceptor-site)?
Bindingssted for indkommende aminoacyl-tRNA-molekyler.
55
Hvad er funktionen af P-sitet?
Bindingssted for peptidyl-tRNA-molekuler, som er det tRNA, der bærer den polypeptidkæde, der allerede er syntetiseret.
56
Hvad er funktionen af E-sitet?
Der hvor det tRNA, som har afleveret dens aminosyre bliver placeret inden den dissocierer fra ribosomet.
57
Hvad sker der når A-sitet møder mRNAs stopcodon?
Release-factor-GTP genkender stopcodonet og binder. Den stimulerer hydrolyse af bindingen mellem peptidkædens C-terminal og tRNA-molekyler og ved fraspaltning af peptidkæden terminerer translationsprocessen.
58
Hvad betyder et polysom/polyribosom?
Når en enkelt mRNA-streng indgår i et kompleks med mange ribosomer, som derved kan give ophav til syntese af manne peptidkæder.
59
Hvordan sendes de færdig translaterede proteiner til membranomkransende organeller?
Proteinerne bærer lokaliseringssekvenser, signalpeptider, der sidder i deres N-terminal.
60
Hvor mange aminosyrer indeholder signalpeptidet i et protein?
10-20
61
Hvor påbegyndes translationsprocessen altid?
på frie ribosomer i cytosolen
62
Hvad sker der, når signalpeptidet bliver syntetiseret i translationsprocessen og dukker frem på ribosomet?
Det genkendes af cytosolært-protein-RNA-kompleks, SRP.
63
Hvad sker der når SRP har bundet sig til signalpeptidet?
Translationen stoppes midlertidig. Ribosomet bringes til en SRP-receptor i ERs membran. En kanal åbner omkring signalpeptidet og translationen fortsætter. Polypeptidkæden syntetiseres gennem kanalen og ind i ER. Herefter frakløves signalpeptidet eller bliver brugt som et membranprotein.
64
Hvad sker der når proteinet er færdigsyntetiseret?
Bliver foldet vha. chaperoner i ER. | Fra ER overføres det til golgi vha. vesikler.