Opbygning af DNA, RNA og proteiner Flashcards

1
Q

Hvilke basis komponenter består DNA af?

A

Pentose
Deoxyribose med en phosphatgruppe
4 typer nitrogenbaser

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hvorfor kaldes baserne cytosin og thymin pyrimidin?

A

Da de indeholder en carbon nitrogen ring

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvorfor kaldes baserne adenin og guamin for purin?

A

Da de indeholder dobbelte carbon nitrogen ringe.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Cellulært DNA optræder altid dobbeltstrenget, hvad består de to stenge af?

A

Hver streng består af deoxyribonukleotider.

De er bundet sammen med 3´,5´-fosfodiesterbindinger.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvad går helixens rygrad negativt ladet?

A

Fasfatmolekylets frie hydroxylgruppe i 3´,5´-fosfodiesterbindingen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvordan neutraliseres ladningen af DNA når helixens rygrad er negativt ladet?

A

Da DNA er omgivet af positive ioner, specielt magnesium.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Fra hvilken ende opbygges nukleotidstrengen? Og fra hvilken ende skal den derved læses?

A

Opbygges altid fra 3´ enden.

Skal derfor læses fra 5´-> 3´.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Nævn de 5 typer af histoner der findes

A
H1 
H2A
H2B
H3
H4
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad indeholder histoner?

A

Argniner og lysiner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilke histoner indgår i et histonoktamer?

A

2 X H2A
2 X H2b
2 X H3
2 X H4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvad består en nukleosomkerne af?

A

1 X histonoktamer

147 basepa virklet 2 gange rundt om histonoktamet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvad kaldes det DNA som er imellem hver nukleosomkerne?

A

Linker-DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvor mange basepar består linker-DNA af?

A

50-80 basepar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvor mange repeterede DNA-sekvenser består telemoren af?

A

500-5.000 af 5´-TTAGGG-3´.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvorfor er telomeren vigtig?

A

Beskytter kromosomet mod nedbrydning af nukleaser.
Signalerer overfor DNA-reperationssystemet at det er en naturlig kromosomende.
Fungerer som en buffer mod tab af vigtige kodende sekvenser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvor ofte optræder et replikationsstartsted?

A

ca. pr. 50.000 basepar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvilken sekvens består replikationsstartstedet af?

A

A-T-basepar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hvad består kinetokoret af?

A

Replikerede kromosomer der holder sammen i centromerregionen, hvor der bindes en række proteiner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hvad består centromerne af?

A

En række repeterede sekvenser, der strækker sig over en region på 100.000 basepar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvad består RNA af?

A

Ribose med to hydroxygrupper
Phosphatgruppe
Nitrogen baser

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvilke bindinger kan RNA lave mellem sine riboser?

A

3´,5´-fosfodiesterbinding

2´,5´-fosfodiesterbinding

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Nævn de former for RNA der findes

A
Messenger RNA 
Ribosomalt RNA
Transfer RNA 
Små nukleære RNA
Regulatorisk RNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hvad indgår rRNA som i ribosomerne?

A

Strukturelle og katalytiske komponenter.

24
Q

Hvor stor en del af ribosomets masse består af RNA?

A

2/3

25
Q

Hvad syntetiseres rRNA ud fra?

A

Et langt præ-rRNA-transkript.

26
Q

Hvordan syntetiseres præ-rRNA-transkriptet til rRNA?

A

præ-rRNA-transkriptet skæres ud af endo- og eksonukleaser, hvoraf baserne og ribose modificeres ved methylering, som gør RNA-molekylets baser mere hydrofobe, hvorved de nemmere interagere med proteindele til pakning i det indre af ribosomerne.

27
Q

Hvad er funktionen af tRNA?

A

Binder og bærer aminosyrerne til ribosomerne under translationsprocessen.

28
Q

Hvor står en del udgår tRNA af cellen samlede RNA?

A

15 %

29
Q

Hvilke processer undergår tRNA i cellens kerne?

A

5´- og 3´-enderne forkortes
Baserne modificeres
Der påsættes en CCA-sekvens i 3´-enden
Intron splejses ud.

30
Q

Hvorfor kan aminosyren binde sig til 3´-enden af tRNA?

A

Da 3´-enden har CCA-sekvensen.

31
Q

Hvad kaldes den loop af tRNA, som binder til komplementær RNA på mRNA?

A

anti-codon

32
Q

Hvad er funktionen af mRNA?

A

Overføre information fra proteinkodende gener i DNA til ribosomerne.

33
Q

Hvor stor en del af mRNA udgør cellens samlede RNA?

A

5 %

34
Q

Hvor mange snRNA findes i cellen?

A

op til 30 forskellige

35
Q

Hvad er kendetegnet ved snRNA?

A

De er rige på uracilnukleotider og interagerer med protien under dannelse af ribonukleoproteiner (snRNP).

36
Q

Hvad kan snRNA inddeles i?

A
U1
U2
U3
U4
U5
U6
37
Q

Hvilke af snRNA´s underinddelinger indgår i splicosomet?

A
U1
U2
U4
U5
U6
38
Q

Hvad bruges snRNA-U3 til?

A

Deltager i processeringen af rRNA-molekyler (snoRNA)

39
Q

Hvad er funktionen af snoRNA?

A

Assisterer i modifikation af baser i bl.a. tRNA og rRNA ved at guide methylerings- og pseudouridindannelsesprocesserne

40
Q

Hvad er funktionen af regulatorisk RNA?

A

Benyttes i reguleringen af genekspression på mRNA niveau.

41
Q

Nævn nogle typer af regulatorisk RNA

A

Long-non-coding RNA (lncRNA)
Små interferende RNA (siRNA)
miRNA

42
Q

Hvad er funktionen af lncRNA?

A

De kaldes også XIST og inducerer heterokromatiseringen og nedlukningen af det ene X-kromosom hos kvinder.

43
Q

Hvad er funktionen af siRNA?

A

Dannes som en forsvarsmekanisme mod vira. RNA-koden for vira gemmes som siRNA. Specielt ved denne type RNA er at den er dobbeltstrenget.

44
Q

Hvad er funktionen af miRNA?

A

Dannes ved transkription af ikke-proteinkodende gener i genomet.

45
Q

Hvad er non-histoner?

A

DNA- og RNA-polymeraser

Genregulatoriske proteiner

46
Q

Hvad er betegnelsen for kromatin?

A

Basofil DNA-holdig kernemateriale

47
Q

Hvad indeholder kromatin?

A

DNA
Histoner
Non-histoner

48
Q

Hvad er funktionen af histoner?

A

Varetager pakning af DNA

Regulerer DNAs tilgængelighed for transkription.

49
Q

Hvilken ladning har histoner?

A

Meget positiv

50
Q

Hvorfor er de frie N-terminaler af histonerne der stikker ud fra nukleosomet vigtige?

A

Da de bruges i pakningen af nukleosomerne i de 30 nm tykke tråde og N-terminalerne stabiliserer pakningen ved at undergå forskellige kovalente modifikationer.

51
Q

Hvordan er størrelserne når DNA går fra at være i et nukleosom til at være et kromsom?

A
DNA: 2 nm
Nucleosom: 10 nm 
Solenoid: 30 nm 
Kromatinslynger med non-histoner: 300 nm
Arm af metafasekromosom: 700 nm 
Hel kromosom: 2 X 700 nm
52
Q

Hvorledes bruges RNAi i organismen?

A

RNAi er små RNA-fragmenter, der kan hæmme genekspressionen sekvensspecifik.

53
Q

siRNA er en RNAi. Hvilken funktion har den?

A

Den bruges som en forsvarsmekanisme mod invaderende vira.

Den kan bruges ved gen-knockdown i et forsøg på at hæmme ekspressionen af særlige gener.

54
Q

miRNA er en RNAi, Hvilken funktion har den?

A

Medfører nedsat translation af mRNA-strengen.

Kan virke direkte på den genomiske struktur og inducere heterokromatisering af genregioner.

55
Q

Hvordan kan RNAi benyttes terapeutisk?

A

Til selektivt at hæmme ekspression af sygdomsfremkaldende gener.