Opbygning af DNA, RNA og proteiner

Question 1

Hvilke basis komponenter består DNA af?

Answer 1

Pentose
Deoxyribose med en phosphatgruppe
4 typer nitrogenbaser

Question 2

Hvorfor kaldes baserne cytosin og thymin pyrimidin?

Answer 2

Da de indeholder en carbon nitrogen ring

Question 3

Hvorfor kaldes baserne adenin og guamin for purin?

Answer 3

Da de indeholder dobbelte carbon nitrogen ringe.

Question 4

Cellulært DNA optræder altid dobbeltstrenget, hvad består de to stenge af?

Answer 4

Hver streng består af deoxyribonukleotider.

De er bundet sammen med 3´,5´-fosfodiesterbindinger.

Question 5

Hvad går helixens rygrad negativt ladet?

Answer 5

Fasfatmolekylets frie hydroxylgruppe i 3´,5´-fosfodiesterbindingen.

Question 6

Hvordan neutraliseres ladningen af DNA når helixens rygrad er negativt ladet?

Answer 6

Da DNA er omgivet af positive ioner, specielt magnesium.

Question 7

Fra hvilken ende opbygges nukleotidstrengen? Og fra hvilken ende skal den derved læses?

Answer 7

Opbygges altid fra 3´ enden.

Skal derfor læses fra 5´-> 3´.

Question 8

Nævn de 5 typer af histoner der findes

Answer 8

H1 
H2A
H2B
H3
H4

Question 9

Hvad indeholder histoner?

Answer 9

Argniner og lysiner

Question 10

Hvilke histoner indgår i et histonoktamer?

Answer 10

2 X H2A
2 X H2b
2 X H3
2 X H4

Question 11

Hvad består en nukleosomkerne af?

Answer 11

1 X histonoktamer

147 basepa virklet 2 gange rundt om histonoktamet

Question 12

Hvad kaldes det DNA som er imellem hver nukleosomkerne?

Answer 12

Linker-DNA

Question 13

Hvor mange basepar består linker-DNA af?

Answer 13

50-80 basepar

Question 14

Hvor mange repeterede DNA-sekvenser består telemoren af?

Answer 14

500-5.000 af 5´-TTAGGG-3´.

Question 15

Hvorfor er telomeren vigtig?

Answer 15

Beskytter kromosomet mod nedbrydning af nukleaser.
Signalerer overfor DNA-reperationssystemet at det er en naturlig kromosomende.
Fungerer som en buffer mod tab af vigtige kodende sekvenser.

Question 16

Hvor ofte optræder et replikationsstartsted?

Answer 16

ca. pr. 50.000 basepar

Question 17

Hvilken sekvens består replikationsstartstedet af?

Answer 17

A-T-basepar

Question 18

Hvad består kinetokoret af?

Answer 18

Replikerede kromosomer der holder sammen i centromerregionen, hvor der bindes en række proteiner.

Question 19

Hvad består centromerne af?

Answer 19

En række repeterede sekvenser, der strækker sig over en region på 100.000 basepar.

Question 20

Hvad består RNA af?

Answer 20

Ribose med to hydroxygrupper
Phosphatgruppe
Nitrogen baser

Question 21

Hvilke bindinger kan RNA lave mellem sine riboser?

Answer 21

3´,5´-fosfodiesterbinding

2´,5´-fosfodiesterbinding

Question 22

Nævn de former for RNA der findes

Answer 22

Messenger RNA 
Ribosomalt RNA
Transfer RNA 
Små nukleære RNA
Regulatorisk RNA

Question 23

Hvad indgår rRNA som i ribosomerne?

Answer 23

Strukturelle og katalytiske komponenter.

Question 24

Hvor stor en del af ribosomets masse består af RNA?

Answer 24

2/3

Question 25

Hvad syntetiseres rRNA ud fra?

Answer 25

Et langt præ-rRNA-transkript.

Question 26

Hvordan syntetiseres præ-rRNA-transkriptet til rRNA?

Answer 26

præ-rRNA-transkriptet skæres ud af endo- og eksonukleaser, hvoraf baserne og ribose modificeres ved methylering, som gør RNA-molekylets baser mere hydrofobe, hvorved de nemmere interagere med proteindele til pakning i det indre af ribosomerne.

Question 27

Hvad er funktionen af tRNA?

Answer 27

Binder og bærer aminosyrerne til ribosomerne under translationsprocessen.

Question 28

Hvor står en del udgår tRNA af cellen samlede RNA?

Answer 28

15 %

Question 29

Hvilke processer undergår tRNA i cellens kerne?

Answer 29

5´- og 3´-enderne forkortes Baserne modificeres Der påsættes en CCA-sekvens i 3´-enden Intron splejses ud.

Question 30

Hvorfor kan aminosyren binde sig til 3´-enden af tRNA?

Answer 30

Da 3´-enden har CCA-sekvensen.

Question 31

Hvad kaldes den loop af tRNA, som binder til komplementær RNA på mRNA?

Answer 31

anti-codon

Question 32

Hvad er funktionen af mRNA?

Answer 32

Overføre information fra proteinkodende gener i DNA til ribosomerne.

Question 33

Hvor stor en del af mRNA udgør cellens samlede RNA?

Answer 33

5 %

Question 34

Hvor mange snRNA findes i cellen?

Answer 34

op til 30 forskellige

Question 35

Hvad er kendetegnet ved snRNA?

Answer 35

De er rige på uracilnukleotider og interagerer med protien under dannelse af ribonukleoproteiner (snRNP).

Question 36

Hvad kan snRNA inddeles i?

Answer 36

``` U1 U2 U3 U4 U5 U6 ```

Question 37

Hvilke af snRNA´s underinddelinger indgår i splicosomet?

Answer 37

``` U1 U2 U4 U5 U6 ```

Question 38

Hvad bruges snRNA-U3 til?

Answer 38

Deltager i processeringen af rRNA-molekyler (snoRNA)

Question 39

Hvad er funktionen af snoRNA?

Answer 39

Assisterer i modifikation af baser i bl.a. tRNA og rRNA ved at guide methylerings- og pseudouridindannelsesprocesserne

Question 40

Hvad er funktionen af regulatorisk RNA?

Answer 40

Benyttes i reguleringen af genekspression på mRNA niveau.

Question 41

Nævn nogle typer af regulatorisk RNA

Answer 41

Long-non-coding RNA (lncRNA) Små interferende RNA (siRNA) miRNA

Question 42

Hvad er funktionen af lncRNA?

Answer 42

De kaldes også XIST og inducerer heterokromatiseringen og nedlukningen af det ene X-kromosom hos kvinder.

Question 43

Hvad er funktionen af siRNA?

Answer 43

Dannes som en forsvarsmekanisme mod vira. RNA-koden for vira gemmes som siRNA. Specielt ved denne type RNA er at den er dobbeltstrenget.

Question 44

Hvad er funktionen af miRNA?

Answer 44

Dannes ved transkription af ikke-proteinkodende gener i genomet.

Question 45

Hvad er non-histoner?

Answer 45

DNA- og RNA-polymeraser | Genregulatoriske proteiner

Question 46

Hvad er betegnelsen for kromatin?

Answer 46

Basofil DNA-holdig kernemateriale

Question 47

Hvad indeholder kromatin?

Answer 47

DNA Histoner Non-histoner

Question 48

Hvad er funktionen af histoner?

Answer 48

Varetager pakning af DNA | Regulerer DNAs tilgængelighed for transkription.

Question 49

Hvilken ladning har histoner?

Answer 49

Meget positiv

Question 50

Hvorfor er de frie N-terminaler af histonerne der stikker ud fra nukleosomet vigtige?

Answer 50

Da de bruges i pakningen af nukleosomerne i de 30 nm tykke tråde og N-terminalerne stabiliserer pakningen ved at undergå forskellige kovalente modifikationer.

Question 51

Hvordan er størrelserne når DNA går fra at være i et nukleosom til at være et kromsom?

Answer 51

``` DNA: 2 nm Nucleosom: 10 nm Solenoid: 30 nm Kromatinslynger med non-histoner: 300 nm Arm af metafasekromosom: 700 nm Hel kromosom: 2 X 700 nm ```

Question 52

Hvorledes bruges RNAi i organismen?

Answer 52

RNAi er små RNA-fragmenter, der kan hæmme genekspressionen sekvensspecifik.

Question 53

siRNA er en RNAi. Hvilken funktion har den?

Answer 53

Den bruges som en forsvarsmekanisme mod invaderende vira. | Den kan bruges ved gen-knockdown i et forsøg på at hæmme ekspressionen af særlige gener.

Question 54

miRNA er en RNAi, Hvilken funktion har den?

Answer 54

Medfører nedsat translation af mRNA-strengen. | Kan virke direkte på den genomiske struktur og inducere heterokromatisering af genregioner.

Question 55

Hvordan kan RNAi benyttes terapeutisk?

Answer 55

Til selektivt at hæmme ekspression af sygdomsfremkaldende gener.