Regulacion expresion genica

Question 1

expresion genica

Answer 1

el gpo de genes expresados en una celula determina el gpo de prot y de ARN funcionales tiene

Question 2

Papel de los siRNA (silenciadores de RNA)

Answer 2

es doble cadena de ADN, 20-27 pares de bases
origen exogeno: virus
origen endogeno: transposones
DICER necesita:R2D2, para localizar una cadena de sirna y colocar el DICER
Llegan las argonautas (exonucleasas), y usa cofactor: C3PO
Exonucleasas: degradan al RNAm
siRNA se complementa totalmente con el RNAm, el argonauta corta el RNAm
siRNA: es RNAm especifico

Question 3

transposones

Answer 3

secuencias de nucleotidos que se pueden mover dentro del genoma
causan mutaciones en el ADN, heredables
son parte de ADN exogeno que hemos ganado desde nuestra evolucion. El ADN de virus se une con el de nosotros, se puede mover entre los cromosomas, son transportables)
Ahora no es tan frecuente que se muevan, antecesores de siRNA

Question 4

IncRNA

Answer 4

son: RNA largos no codificantes: 200 nucleotidos, no se traducen
hay: 16,000 a 100,000, RNA pol II
caperuza y cola de poli A
modula acetilaciones de histonas (cromatina)
alteran la estabilidad y traduccion de los RNAm: se unen a U1, o a secuencias ricas GU, inhibiendo el corte y empalme
en trascripcion: retiran factores de transcripcion, unen potenciadores o silenciadores al mediador
sirven de union a proteinas, organiza el nucleo, pueden unir varios miRNA
localizacion: nucleo, citoplasma, mitocondrias, exosomas, tejidos especificos

Question 5

IncRNA puede producir:

Answer 5

enf de alzheimer: promueve la estabilidad de la prot B amieloide
enf parkinson
enf huntington
cancer: activan o suprimen la actividad de oncogenes (p53, p21)

Question 6

PIWI- interacting RNA (piRNAs)

Answer 6

RNA asociados a proteinas PIWI (actividad de endonucleasa, familia de las argonautas, mantienen a los transposones)
silenciadores de genes transposones, regulan expresion genica, combaten infc viricas
actuan de 2 formas:
- silenciamiento genico
- silenciamiento epigenetico: modificaciones de histonas

Question 7

regulacion genica

Answer 7

es la forma como una celula controla que genes se expresan

Question 8

Regulacion en CIS

Answer 8

regulacion dentro del adn, secuencia contigua a un gen que tenga un efecto regulador sobre la tasa de transcripcion, ej: potenciadores, silenciadores

Question 9

regulacion en TRANS

Answer 9

proteinas reguladoras ej: factores de transcripcion

Question 10

reconocimiento del adn por proteinas

Answer 10

prot reconocen la superficie de Acido N. para identificar la secuencia de nucleotidos, en el surco mayor: se reconoce mejor la secuencia

Question 11

estructura de los factores de transcripcion (TRANS)

Answer 11

Helice-giro-helice: 2 alfa helice undos por: prot corta de A.A, desarrollo embrionico
Dedos de zinc: a helice una b helice por: zinc, receptores de H. esteroideas
Zipper de Leucina: 2 a helice
Helice asa helice (HLH): a helice unida a helice por una asa

Question 12

Activadores

Answer 12

actuan sobre los factores de transcripcion, regulan: RNA pol II
la union de factores especificos a los potenciadores son responsables del control de la expresion genica: desarrollo, diferenciacion, respuesta de las celulas a las hormonas y los factores del crecimiento
ACTIVADOR: reconoce al potenciador
Potenciador: estimula trancripcion sin importar si esta rio arriba o rio abajo

Question 13

Represores

Answer 13

se unen a silenciadores, para inhibir la transcripcion, pueden inhibir otros factores de transcripcion,
inhibe la expresion de genes especificos de un tejido en tipos celulares inadecuados

Question 14

activadores y represores

Answer 14

regulan la transcripcion en eucariotas,
interactuando con factores de transcripcion generales y otros componentes de la maquinaria transcripcional
induciendo cambios en la structura de la cromatina

Question 15

enrollamiento del adn en nucleosoma

Answer 15

afecta: la capacidad de los factores de transcripcion para unirse al adn, la capacidad del arn pol para transcribir

Question 16

Metilacion de adn

Answer 16

adicion de gpo metilo al carbon 5 de la citosina, en citosinas que van despues de una guanina
5mC 1% del ADN, confiere un cambio conformacional en la doble cadena
variacion espacial y temporal en la cromatina, + metilacion = - expresion
metiltransferasas: colocan las metilaciones en las hebras hijas, actua en secuecias CG que estan emparejadas con CG-metilada

Question 17

eucromatina

Answer 17

regiones dispersas poco condensadas, ocupan la mayor parte del nucleo, nivel alto de acetilacion, cromatina activa transcripcional

Question 18

heterocromatina

Answer 18

regiones de cromatina densamente empaquetadas, inactivas, NO se expresan, abundante en telomeros y centromeros, + metilacion
facultativa: se expresan durante el desarrollo/ diferenciacion, post se silencian
constitutiva: siempre condensados y silenciados, telomeros y centromeros

Question 19

histonas

Answer 19

histonas: 2 dominios
1- unirse a: histonas, ADN
2- amino terminal que se encuentra fuera del adn y sufre modificaciones
interaccionan con prot o complejos proteicos efectores o transductores

Question 20

acetilacion de histonas

Answer 20

añade cargas - a las histonas, descompactacion de la cromatina, facilita le acoplamiento a los factores de transcripcion
Lisinas (H3K56)
- acetil transferasas de histonas (HAT): promueve transcripcion
- deacetilasas de histonas (HDAC): represor transcripcion, aumentan carga +, suprimen gen p53
HDAC1: cancer de prostata, HDAC2: carcinoma gastrico, HDAC8: neuroblastoma y glioma

Question 21

inhibidores HDAC

Answer 21

abren p53 y produce apoptosis
vorinostat, romidepsin, belinostat, panobinstat

Question 22

fosforilacion de histonas

Answer 22

serinas, treoninas y tirosinas, incrementa la carga -
favorece transcripcion
- cinasas
- fosfatasas

Question 23

Metilacion de histonas

Answer 23

metil transferasas de lisina (HKMT): lisina (H3K9), puede activar o reprimir la transcripcion de un gen
metil transferasas de arginina: argininas, activacion transcripcional

Question 24

acetilacion de histonas

Answer 24

añade carga - a las histonas, descompactacion de la cromatina
acetil transfersas
deacetilasas

Question 25

epigenetica

Answer 25

abarca todos los procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulacion y expresion de genes y que son heredables de unos organismos a otros

Question 26

mecanismos de regulacion epigenetica

Answer 26

• metilacion de adn
• modificaciones post- traduccionales de las histonas: fosforilacion, acetilacion, metilacion

Question 27

deacetilasas de histonas (HDAC)

Answer 27

incrementan cargas +
suprimen la activacion de p53
HDAC 1- cancer de prostata
HDAC 2- carcinoma gastrico
HDAC 8- neuroblastoma y glioma

Question 28

inhibidores HDAC

Answer 28

vorinostat
romidespin
belinostat
panobinstat