control post-transcripcional y post- traduccional Flashcards
RNAm: Region 5 UTR
Regulacion e iniciacion de la transcripcion, se traduce a una prot. este producto puede regular la traduccion de 3UTR
RNAm: Region 3 UTR
influe en: poliadenilacion, eficiencia de traduccion, localizacion y estabilidad del RNAm
Precursores de RNAm
transcritos primarios o pre-RNAm, hRNA: heteronuclear
se procesan para producir una molecula de RNAm madura a traves del proceso de corte y empalme (splicing)
es 10 veces + grande que el RNA maduro
secuencias ambiguas
regiones que en unos tejidos se consideran exones y en otro intrones
en cada tejido se realiza un procesamiento diferente conocido como: procesamiento alternativo o splicing alternativo
proteinas SR
prot que activan los sitios de empalme: ricas en serina/arginina
si los sitios son debiles, la maquinaria de empalme la puede evitar
prot hnRNP
prot que inactivan los sitios de empalme, ricas en serina, arginina
procesamiento de la transcripcion: empalme alternativo
los pre RNA son procesados por un proceso de corte y empalme, los intrones se eliminan y dejan a los exones
diferente tipo de celula, dif tiempo de desarrollo
procesamiento de la transcripcion: splicing alternativo
el mecanismo por el cual se incluye o se excluye un exon, depende si la maquinaria de empalme selecciona los sitios de empalme especificos, 3’ y 5’
si los sitios son debiles la maquinaria de empalme lo puede evitar
espliceosoma
complejo de corte y empalme
compuesto por: 5 ribonucleoprot pequeñas, 300 prot,
2 unidades: Mayor: tiene RNAsn + prot, U1,U2,U4, U5,U6, detecta GU, AG, 5-3
5rna sn + prot = espliceosoma
menor: AU, AC, 3-5
regulacion transcripcional: espliceosoma
1- U1 identifica la secuencia GU del extremo 5’
2- U1 snRNP se une al 5’ del intron
3- U2 snRNP (selecciona una adenina en medio del intron, tiene la capacidad de cortar), se une al 3 del intron pre RNAm, con ayuda de: U2AF (factor asociado a U2)
4- union de U4 (contiene U6, inhibe U6),U5 (junta exones),U6 (ayuda a la adenina a cortar, es ribozima) al pre RNAm, desplazando a U1
5- U4 es desplazado por el emparejamiento de U6 con U2 snRNA y pre-RNAm
6- U6 ayuda a la adenina para el ataque nutreofilico y corta
regulacion transcripcional: edicion del RNA
modificacion de 1 o + bases de RNAmaduro
desaminacion de adenina, produce: inosina (A-I)
desaminacion de citosina: produce: uracilo (C-U)
desaminacion de nucleotidos produce dif proteinas
edicion transcripcional: Transporte del nucleo al citoplasma
1 de cada 20 RNAm deja el nucleo. para salir: 3 modificaciones
- metilguanosina en el extremo 5’ (caperuza)
- adicion de la cola de poli A 3’
- eliminacion de intrones
es reconocida por: nuclear ARN export factor 1 (exportinas, e inportinas)
regulacion transcripcional:Transporte en el citoplasma
RNAm se dirigen a sitios especificos dentro de la celula antes de iniciar la traduccion, se situan en sitios en donde la prot se requiere
la señal que determina en donde se va a localizar el RNAm se encuentra en la region UTR3’
regulacion traduccional: Busqueda de escape:
si no se reconoce el 1er AUG, la subunidad ribosomica menor saltara hasta el 2do o 3ro
regulacion traduccional: prot inhibidoras de la traduccion
control negativo de la traduccion
mediante la union de prot inhibidoras en el extremo 5’
estres del RER: eIF2: reconoce la metionina, si se fosforila bloquea la traduccion
degradacion del RNAm
vida media de un RNAm: 30min-10hrs
Los RNAm mas inestables son los que tienen + A (cola de poli aa: entre mas larga: mas tiempo de vida, mas corta: poco tiempo de vida)
cola de poli AA: 200nt, si tiene 25 a 30nt: inestabilidad de RNAm
- remueve el capuchon: degradacion del RNA por su extremo 5’
- se continua degradando hasta llegar a secuencias codificadoras
las diferencias en la UTR3’ determina la velocidad de acortamiento de la cola
AU: vida media cort
C: vida media larga
papel de los miRNA
RNA no codificante, 400 miRNA diferentes, regulan la expresion de genes
sintetizados por: RNApol II (Cap y poli A), 400 diferentes, regulan expresion genica, RNA no codificante
se une a prot para formar: RISC (complejo silenciador inducido por RNA), busca secuecias complementarias en 3’. promueve: desadenilación
si la complementariedad es extensa: degradacion, se quita la cola de poli A, si no es extensa: se desestabiliza el RNAm, se acorta la cola, se mueve hacia los cuerpos P: degradan RNAm (enzimas que retiran el capuchon, exonucleasas)
funcion: biomarcadores poco invasivos, son especificos de cada enfermedad y tejido, cambian en estados patologicos, son estables y son cuantificables
Papel de los MIRNA en enfermedades cardiovasculares
biomarcadores: poco invasivos, de celulas necroticas o vivas, son especificos de cada enfermedad o tejido, cambian en estado patologico, son estables, cuantificables
control postraduccional
adicion de gpos quimicos a prot (hace que la prot sea madura y funcional)
ace.., carbo.. metil,,, hidroxi… fosfo… glucosilacion
le dan a las prot: estabilidad, plegamiento, reconocimiento, determinan el lugar y el momento de su actividad
fosforilaciones
las prot pueden ser activadas o desactivadas
quinasa, fosfatasa
Ser, Thr, Tyr
ubiquitinacion
ubiquitina: marcador para degeneracion, regula la funcion, localizacion e interacciones prot-prot
acetilaciones
reversible o irreversible
añade carga - a las histonas, descompactacion de la cromatina
degradacion de prot
proteasoma
en nucleo y citoplasma, 4 anillos de subunidades polipeptidicas, cada anillo tiene 7 subunidades: 2 anillos centrales (con enzimas proteoliticas), subunidades b
MODIFICACIONES POST TRADUCCIONALES
- despues de su sintesis
- variaciones quimicas o de procesamiento
modificacion: actividad, vida, localizacion, capacidad para interaccionar con otras prot
prot son modificadas en + de un a.a, creando un patron de modificaciones especifico que cambia la actividad o estabilidad de la prot
Plegamiento
proceso por el cual la cadena adquiere su correcta conformacion tridimensional para lograr su estado nativo con actividad biologica
un polipeptido NO organizado adquiere una estructura 3D especifica para llevar a cabo una funcion biologic
perdida de secuencia señal
15-30 a,a
el amino terminal se remueve por peptidasas especificas
SRP detecta la secuencia señal, lleva al ribosoma al receptor de ribosoma y receptor SRP, hacia el translocon, peptidasa corta el aminoacido y se quita la secuencia señal
secuencia señal
secuencia de aminoacidos que determinan el destino de la prot dentro de la celula, se modifica el lugar y la funcion
metilaciones
ocurre en los nitrogenos y oxigenos, modificacion permanente
glucosilaciones
adicion de cadenas de carbohidratos (asparagina)
N-oligosacaridos: RE y Golgi, los carbohidratos se unen al gpo amino
O- oligosacaridos: Ser, Thr, Golgi, los carbohidratos se unen al gpo hidroxilo
diadicion de gpos isoprenilos
grupos derivados de isopreno: involucradas en la motilidad, la activacion y proliferacion de leucocitos
ej: procesamiento proteolitico: insulina
formacion de puentes disulfuro: enzima prot- disulfuro isomerasa
ubiquitinacion
ubiquitina: prot reguladora
1- activacion: E1: enzima activadora de la ubiquitinacion, agarra la prot y la transporta
2- conjugacion: E1 llleva a la ubiquitina a E2, E2 lleva la ubiquitina a la enzima
3- union: E3: ubiquitina ligasa, une la ubiquitina a la prot dañada
degradacion de prot
proteosoma: complejo multienzimatico, en TODAS las cel eucariotas, forma tubular, 4 anillos con 7 subunidades: 2 anillos centrales- enzimas proteoliticas- subunidades B, 2 prot en cada extremo formando un gorro
casquete: tapas: centro regulador 19s
nucleo catalitico: proteoliticos: 20s
En nucleo y citoplasma
el extremo amino terminal determina la vida media de la prot
