control post-transcripcional y post- traduccional

Question 1

RNAm: Region 5 UTR

Answer 1

Regulacion e iniciacion de la transcripcion, se traduce a una prot. este producto puede regular la traduccion de 3UTR

Question 2

RNAm: Region 3 UTR

Answer 2

influe en: poliadenilacion, eficiencia de traduccion, localizacion y estabilidad del RNAm

Question 3

Precursores de RNAm

Answer 3

transcritos primarios o pre-RNAm, hRNA: heteronuclear
se procesan para producir una molecula de RNAm madura a traves del proceso de corte y empalme (splicing)
es 10 veces + grande que el RNA maduro

Question 4

secuencias ambiguas

Answer 4

regiones que en unos tejidos se consideran exones y en otro intrones
en cada tejido se realiza un procesamiento diferente conocido como: procesamiento alternativo o splicing alternativo

Question 5

proteinas SR

Answer 5

prot que activan los sitios de empalme: ricas en serina/arginina
si los sitios son debiles, la maquinaria de empalme la puede evitar

Question 6

prot hnRNP

Answer 6

prot que inactivan los sitios de empalme, ricas en serina, arginina

Question 7

procesamiento de la transcripcion: empalme alternativo

Answer 7

los pre RNA son procesados por un proceso de corte y empalme, los intrones se eliminan y dejan a los exones
diferente tipo de celula, dif tiempo de desarrollo

Question 8

procesamiento de la transcripcion: splicing alternativo

Answer 8

el mecanismo por el cual se incluye o se excluye un exon, depende si la maquinaria de empalme selecciona los sitios de empalme especificos, 3’ y 5’
si los sitios son debiles la maquinaria de empalme lo puede evitar

Question 9

espliceosoma

Answer 9

complejo de corte y empalme
compuesto por: 5 ribonucleoprot pequeñas, 300 prot,
2 unidades: Mayor: tiene RNAsn + prot, U1,U2,U4, U5,U6, detecta GU, AG, 5-3
5rna sn + prot = espliceosoma
menor: AU, AC, 3-5

Question 10

regulacion transcripcional: espliceosoma

Answer 10

1- U1 identifica la secuencia GU del extremo 5’
2- U1 snRNP se une al 5’ del intron
3- U2 snRNP (selecciona una adenina en medio del intron, tiene la capacidad de cortar), se une al 3 del intron pre RNAm, con ayuda de: U2AF (factor asociado a U2)
4- union de U4 (contiene U6, inhibe U6),U5 (junta exones),U6 (ayuda a la adenina a cortar, es ribozima) al pre RNAm, desplazando a U1
5- U4 es desplazado por el emparejamiento de U6 con U2 snRNA y pre-RNAm
6- U6 ayuda a la adenina para el ataque nutreofilico y corta

Question 11

regulacion transcripcional: edicion del RNA

Answer 11

modificacion de 1 o + bases de RNAmaduro
desaminacion de adenina, produce: inosina (A-I)
desaminacion de citosina: produce: uracilo (C-U)
desaminacion de nucleotidos produce dif proteinas

Question 12

edicion transcripcional: Transporte del nucleo al citoplasma

Answer 12

1 de cada 20 RNAm deja el nucleo. para salir: 3 modificaciones
- metilguanosina en el extremo 5’ (caperuza)
- adicion de la cola de poli A 3’
- eliminacion de intrones
es reconocida por: nuclear ARN export factor 1 (exportinas, e inportinas)

Question 13

regulacion transcripcional:Transporte en el citoplasma

Answer 13

RNAm se dirigen a sitios especificos dentro de la celula antes de iniciar la traduccion, se situan en sitios en donde la prot se requiere
la señal que determina en donde se va a localizar el RNAm se encuentra en la region UTR3’

Question 14

regulacion traduccional: Busqueda de escape:

Answer 14

si no se reconoce el 1er AUG, la subunidad ribosomica menor saltara hasta el 2do o 3ro

Question 15

regulacion traduccional: prot inhibidoras de la traduccion

Answer 15

control negativo de la traduccion
mediante la union de prot inhibidoras en el extremo 5’
estres del RER: eIF2: reconoce la metionina, si se fosforila bloquea la traduccion

Question 16

degradacion del RNAm

Answer 16

vida media de un RNAm: 30min-10hrs
Los RNAm mas inestables son los que tienen + A (cola de poli aa: entre mas larga: mas tiempo de vida, mas corta: poco tiempo de vida)
cola de poli AA: 200nt, si tiene 25 a 30nt: inestabilidad de RNAm
- remueve el capuchon: degradacion del RNA por su extremo 5’
- se continua degradando hasta llegar a secuencias codificadoras
las diferencias en la UTR3’ determina la velocidad de acortamiento de la cola
AU: vida media cort
C: vida media larga

Question 17

papel de los miRNA

Answer 17

RNA no codificante, 400 miRNA diferentes, regulan la expresion de genes
sintetizados por: RNApol II (Cap y poli A), 400 diferentes, regulan expresion genica, RNA no codificante
se une a prot para formar: RISC (complejo silenciador inducido por RNA), busca secuecias complementarias en 3’. promueve: desadenilación
si la complementariedad es extensa: degradacion, se quita la cola de poli A, si no es extensa: se desestabiliza el RNAm, se acorta la cola, se mueve hacia los cuerpos P: degradan RNAm (enzimas que retiran el capuchon, exonucleasas)
funcion: biomarcadores poco invasivos, son especificos de cada enfermedad y tejido, cambian en estados patologicos, son estables y son cuantificables

Question 18

Papel de los MIRNA en enfermedades cardiovasculares

Answer 18

biomarcadores: poco invasivos, de celulas necroticas o vivas, son especificos de cada enfermedad o tejido, cambian en estado patologico, son estables, cuantificables

Question 19

control postraduccional

Answer 19

adicion de gpos quimicos a prot (hace que la prot sea madura y funcional)
ace.., carbo.. metil,,, hidroxi… fosfo… glucosilacion
le dan a las prot: estabilidad, plegamiento, reconocimiento, determinan el lugar y el momento de su actividad

Question 20

fosforilaciones

Answer 20

las prot pueden ser activadas o desactivadas
quinasa, fosfatasa
Ser, Thr, Tyr

Question 21

ubiquitinacion

Answer 21

ubiquitina: marcador para degeneracion, regula la funcion, localizacion e interacciones prot-prot

Question 22

acetilaciones

Answer 22

reversible o irreversible
añade carga - a las histonas, descompactacion de la cromatina

Question 23

degradacion de prot

Answer 23

proteasoma
en nucleo y citoplasma, 4 anillos de subunidades polipeptidicas, cada anillo tiene 7 subunidades: 2 anillos centrales (con enzimas proteoliticas), subunidades b

Question 24

MODIFICACIONES POST TRADUCCIONALES

Answer 24

• despues de su sintesis
• variaciones quimicas o de procesamiento
  modificacion: actividad, vida, localizacion, capacidad para interaccionar con otras prot
  prot son modificadas en + de un a.a, creando un patron de modificaciones especifico que cambia la actividad o estabilidad de la prot

Question 25

Plegamiento

Answer 25

proceso por el cual la cadena adquiere su correcta conformacion tridimensional para lograr su estado nativo con actividad biologica
un polipeptido NO organizado adquiere una estructura 3D especifica para llevar a cabo una funcion biologic

Question 26

perdida de secuencia señal

Answer 26

15-30 a,a
el amino terminal se remueve por peptidasas especificas
SRP detecta la secuencia señal, lleva al ribosoma al receptor de ribosoma y receptor SRP, hacia el translocon, peptidasa corta el aminoacido y se quita la secuencia señal

Question 27

secuencia señal

Answer 27

secuencia de aminoacidos que determinan el destino de la prot dentro de la celula, se modifica el lugar y la funcion

Question 28

metilaciones

Answer 28

ocurre en los nitrogenos y oxigenos, modificacion permanente

Question 29

glucosilaciones

Answer 29

adicion de cadenas de carbohidratos (asparagina)
N-oligosacaridos: RE y Golgi, los carbohidratos se unen al gpo amino
O- oligosacaridos: Ser, Thr, Golgi, los carbohidratos se unen al gpo hidroxilo

Question 30

diadicion de gpos isoprenilos

Answer 30

grupos derivados de isopreno: involucradas en la motilidad, la activacion y proliferacion de leucocitos
ej: procesamiento proteolitico: insulina
formacion de puentes disulfuro: enzima prot- disulfuro isomerasa

Question 31

ubiquitinacion

Answer 31

ubiquitina: prot reguladora
1- activacion: E1: enzima activadora de la ubiquitinacion, agarra la prot y la transporta
2- conjugacion: E1 llleva a la ubiquitina a E2, E2 lleva la ubiquitina a la enzima
3- union: E3: ubiquitina ligasa, une la ubiquitina a la prot dañada

Question 32

degradacion de prot

Answer 32

proteosoma: complejo multienzimatico, en TODAS las cel eucariotas, forma tubular, 4 anillos con 7 subunidades: 2 anillos centrales- enzimas proteoliticas- subunidades B, 2 prot en cada extremo formando un gorro
casquete: tapas: centro regulador 19s
nucleo catalitico: proteoliticos: 20s
En nucleo y citoplasma
el extremo amino terminal determina la vida media de la prot