Estructura y transcripcion del ADN Flashcards
DNA y RNA compuestos por:
base nitrogenada, pentosa, fosfato
nucleosido
pentosa + base nitrogenada = ribonucleosidos/ desoxirribonucleosidos
union por enlace covalente: n- glucosidico, C1 de pentosas y N1 de primidinas o N9 de purinas
nucleotidos
pentosa + base nitrogenada + gpo fosfato
o nucleosido + gpo fosfato
union por: enlace ester: OH del C5 de la pentosa
enlace fosfodiester: C5´fosfato + C3´hidroxilo del sig nucleotido
moleculas acidas
su forma libre 3 trifosfatadas
ley de charcaff
A= T
C = G
estructura del DNA
nucleotidos, doble cadena, antiparalela, giro helicoidal, complementaria
Variantes de la cadena
forma A: DNA deshidratado (in vitro)
B: DNA cromosomico
Z: secuencia de purinas y pirimidinas alternadas
Compactacion del adn
ADN (2nm)> fibra de nucleosomas (10nm)> fibra solenoide(30nm)> bucles del solenoide o asas cromatinicas (300nm)> fibra de 700nm (espiral de bucles)> cromosoma (1,400nm)
RNA estructura
mas abundante, 1 cadena (monocatenario), uracilo, 5 a 3
estructura secundaria del RNA
apareamiento complementario de la misma cadena, estructura de pasador
estructura terciaria
estructura de bucles, interaccion entre bases nitrogenadas de dif regiones un mismo RNA
RNA mensajero
cadena sencilla
contiene info genetica, info de 1 gen: 1 prot
complementaria a una cadena de adn
RNA transferencia
estructura de bucles, transportan el aminoacido hasta RNA r
bucle con anticodon: triplete de bases en el asa central, se une de forma complementaria con el codon del RNAm
RNA ribosomal
2 subunidades: 60s y 40s= 80s
subunidad mayor: 5S, 5.8S y 28S + 49 prot
subunidad menor: 18s + 33prot
se realiza la sintesis proteica
caracteristicas del RNA ribosomal
3 sitios
A: aceptacion del aminoacil RNAt, lectura del codon
P: elonga la cadena peptidica, se localiza el peptidil RNAt
E: salida del RNAt sin aminoacido
Transcripcion y traduccion
DNA–> RNA (nucleotidos. unidos por enlace fosfodiester)
sintesis de una cadena de RNA complementara y antiparalela
recursos por el cual las celulas leen o expresan sus genes
elementos de transcripcion
RNAm: copia secuencia de DNA
RNAr: forma ribosomas
RNAt: se adaptan a aminoacidos y las colocan el el ribosoma
gen
secuencia de nucleotidos en la molecula de DNA, contiene info para la sintesis de: RNAm, RNAt, RNAr
se transcribe 1 solo producto
la celula puede modificar o regular la expresion de cada gen segun sus necesidades
secuencias de un gen
regulatorias:
- promotores (no codifican, regulan) ej: promotor basal: scuencia minima para la union de la maquinaria de transcripcion
- potenciadores
- silenciadores
- codificantes (si van a dar un RNA): intrones (no son traducidos), exones (si codifican)
factores de transcripcion
prot reguladores (aumentan o disminuyen) la tasa de transcripcion, identifican caja tata (promotor basal)
RNA polimerasa
union de ribonucleotidos, formacion de enlaces fosfodiester, forma el esqueleto de azucar-fosfato y desenrrolla ADN, puede comenzar una cadena de RNA sin cebador, si se equivoca las consecuencias son menores, 1error cada 10^4 nucleotidos
5´—-> 3´
ARN pol 1: 1 transcrito 45s, precursor de RNAr 18s, 28s y 5.8s
ARN pol2: RNAm, miRNA, genes codificadores de prot
ARN pol3: genes de: RNAt, RNAr 5s, RNA pequeños
fases de transcripcion
1 formacion del complejo preiniciacion
2 iniciacion
3 elongacion
4 terminacion
1 formacion del complejo de preiniciacion
iniciador (Inr): punto de inicio de elongacion
union del factor de transcripcion general (TFIID) a la TBP (prot de union a TATA, provoca deformacion del adn 80º) union a la secuencia TATA (ubicado 25 muceleotidos corriente arriba del sitio de incio de transcripcion)
TFIIA: estabiliza la union TBP-TATA, permite que TFIID reconozca el extremo 5´
TFIIB: se une al TBP, proporciona mayor anclaje y posiciona a la RNA pol2
TFIIF: fija la RNA pol II al ADN, marcaje
TFIIE: regula TFIIH
TFIIH: helicasa, usa atp para desenrollar la doble helice, expone templete de ADN, fosforila rna pol 2 para activarla y abandona el promotor
INICIO de transcripcion
se une: medidador (permite que las prot activadoras se comuniquen con la pol y FT), enzima modificadora de histonas (disocia H2A y H2B) , complejo de remodelacion de cromatina (quita las histonas)
Elongacion: transcripcion
Factores de elongacion: disminuyen la posibilidad que el RNA pol2, se disocie antes de llegar al termino del gen
TFIIS(elonguina) corrector de errores
hSPT4,5 (evita disociacon RNApol, factor estimulante de elongacion, alinea adn)
P TEFb: forsforila NRA pol
TFIIH: fosforila el dominio carboxiterminal de la ARN pol 2
complejo de remodelacion de cromatina
enzima modificadora de histonas
terminacion: transcripcion
- reconocimiento de secuencia de poliadenilacion
- desintegracion del complejo de transcripcion
- CstF: factor estimulante de anclaje (corte)
- CPSF: factor de anclaje y poliadenilacion especifico) terminacion AAUAAAAA
adicion cap al transcrito RNA
- RNA trifosfatasa: elimina gpo fosfato
- guaninil transferasa: adicion nucleotido de guanina
- metil transferasa: metilacion
