Regulacija ekspresije gena u eukariota II Flashcards
kaj spada pod postranskripcijsku kontrolu
alternativni splicing
kontrola transporta, stabilnosti i translacije
kakva mora biti mRNA za transport u citoplazmu
bez introna
na 5’ kraju kapa 7mG
na 3’ kraju poli A rep
uz pomoć kojeg proteina se kontrolira transport mRNA iz jezgre u citoplazmu
Rev protein
kak se kontrolira stabilnost mRNA za metabolizam željeza
uz IRE binding protein koji se, kad ima malo željeza, veže za mRNA koja je zadužena za sintezu proteina za metabolizam željeza i time sprečava sintezu (dulje živi mRNA)
pomoću čega se kontrolira duljina poli A repa
AU sekvenci
kaj se stimulira produljivanjem poli A repa
početak translacije
kaj spada u posttranslacijsku kontrolu
histonska modifikacija
ATP-ovisan kromatinski remodeling
nekodirajuće RNA
koji su najvažniji načini histonske modifikacije
acetilacija
metilacija
kaj se dešava u acetilaciji histona
odstranjuje se pozitivan naboj i smanjuje afinitet između histona i DNA, povećava se mobilnost nukleosoma duž DNA –> olakšana transkripcija
koji su writersi, a koji erasersi u acetilaciji histona
witersi: HAT
erasersi: HDAC
kaj radi metilacija histona
inaktivira kromatin
koji su writersi, a koji eraseri u metilaciji histona
writersi: HMT
eraseri: HDM
kak se kromatin remodelira
uz pomoć 5 obitelji molekula koje mijenjaju poziciju nukleosoma, histonske komponente i vežu druge epigenetske faktore
kak se zove RNA koja se ne prevodi do proteina već služi za regulaciju stanice
ncRNA - nekanonska RNA
koje su housekeeping ncRNA
tRNA, rRNA, snRNA…
koje su epigenetski važne ncRNA
long ncRNA
short ncRNA
kak djeluje long ncRNA
privlači histonske modifikate na DNA
utječe na splilcing, genomski imprinting…
kak se dijeli short ncRNA
small interfering RNA (siRNA)
microRNA (miRNA)
koja je razlika između siRNA i miRNA
siRNA dobivena sintetski, a miRNA sintetizira sama stanica (inače su istovjetne)
kak djeluje short ncRNA ako je došlo do transkripcije nepoželje mRNA
tada se short ncRNA tj RNAi (interferencijska RNA) veže na tu mRNA (komplementarne su) i sprečava se translacija
kako se regulira nepoželjna mRNA ako ubacimo u stanicu dvolančanu RNA
prepozna ju molekula Dicer (razreže ju u male siRNA)
male siRNA prepozna RISC (helikaza odmotava, nukleaza razgrađuje jedan lanac)
nerazgrađeni lanac se veže na neželjenu RNA i sprečava translaciju
kaj je genomski imprinting
različita ekspresija genoma roditelja uvjetovana metilacijom DNA
kaj se desi ak se stvori uniparentalni zametak
androgenetski (2 muška pronukleusa) embrij
ginogenetski (2 ženska pronukleusa) embrij
nema razvitka
kaj se desi kod androgenetskog embrija
velika placenta
abnormalni zametak (mala glava, nema mozga, ogromno tijelo)
ogroman nagon za opstanak
kaj se desi kod ginogentskog embrija
slabo razvijena placenta
relativno normalan zametak (ali velika glava i malo tijelo)
delecija q11-13 na 15. kromosomu (ovisno od kojeg roditelja je potekla)
od majke - angelmanov sindrom
od oca - prader-willijev sindrom
acetilacijom nastaje kakav kromatin
eukromatin
metilacijom nastaje kakav kromatin
heterokromatin
aktivan kromatin je acetiliran/neacetiliran i metiliran/nemetiliran
acetiliran, nemetiliran
kaj održava DNMT I
metilacijski obrazac
kad je najniža razina metilacije u emrbionalnom razvoju
u blastocisti
gdje je aktivan, a gdje neaktivan Xist gen
aktivan - na neaktivnom X kromosomu
neaktivan - na aktivnom X kromosomu
kaj uzorkuje Xist gen
kodiranje nekodirajuće RNA koja oblaže taj X kromosom –> dolazi do metilacije –> neaktivan X kromosom
jednojajčani blizanci imaju isti ______, a različit ______
genom
epigenom
