Regulacija ekspresije gena u eukariota I Flashcards

1
Q

4 razine regulacije gena u eukariota

A

postreplikacijska, transkripcijska, posttranskripcijska i postranslacijska kontrola

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

kaj je metilacija DNA

A

dodavanje metilne skupine na 5. C atom citozina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

od kud dolazi metilna skupina

A

iz molekule S-adenozin-L-metionin (SAM)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

kaj dodaje metilnu skupinu na DNA

A

DNA metiltransferaza (DNMT)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

koje su vrste DNMT

A

DNMT I

DNMT 3A i 3B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

kaj radi DNMT I

A

metilira drugi lanac u hemimetiliranoj DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kaj radi DNMT 3A/3B

A

vrši de novo metilaciju (dakle nema afinitet prema hemimetiliranoj)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

primjer za metilaciju de novo

A

kod oplodnje gdje su jajna stanica i spermij potpuno demetilirani

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kaj je više metilirano, jajna stanica ili spermij

A

spermij (jajna stanica je gotovo nemetilirana)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

koji dijelovi DNA se najčešće metiliraju

A

.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

kaj se desi ako se u trudnoći konzumira puno donora metilne skupine

A

može se promijeniti ekspresija gena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

koje tvari sadrže puno metilnih skupina

A

folna kiselina, B vitamini

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

metilacija kojeg gena kod miša može uzrokovati promijenu u njegovoj ekspresiji

A

agout gen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

kakav miš se razvija ako je agout gen metiliran

A

smeđe krzno
mršav
niska sklonost od razvitka dijabetesa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

kakav miš će nastati ako je agout gen nemetiliran

A

žuto krzno
debeo
sklon razvitku dijabetesa i raka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

kakvi su genetski miševi s nemetiliranim i metiliranim agout genom

A

identični (bez obzira što drugačije izgledaju i imaju drukčije karakteristike)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

metilacija opada/raste starenjem

A

opada

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

koji su readersi kod metilacije

A

MBP (methyl-CpG- binding protein)

19
Q

kak djeluju MBP

A
  1. privlače ostale epigenetske faktore

2. onemogućuju vezanje transkripcijskih faktora

20
Q

koji su eraseri kod metilacije

A

TET enzimi

21
Q

kaj rade TET enzimi kod metilacije

A

oksigeniraju metilnu skupinu: prvo u 5-hmC onda to u 5-fC i 5-caC

22
Q

kak se nazivaju baze kod metilacije

A

5-mC 5.baza
5-hmC 6. baza
5-fC 7. baza
5-caC 8. baza

23
Q

kaj spada pod postreplikacijsku regulaciju gena

A

metilacija DNA

24
Q

gdje se nalaze promotori

A

između regulatorske i kodirajuće regije

25
Q

silenceri i enhanceri spadaju pod

A

regulatore

26
Q

koji su cis regulatori

A

promotori, utišivači, pojačivači

27
Q

kak se određuje položaj promotora

A

DNA footprintom:
DNA fragment se označi radioaktivno, stavi se unutra DNAza i RNA polimeraza –> mjesto koje se ne razgradi označava mjesto vezanja RNA polimeraze aka mjesto promotora

28
Q

koje promotore aktiviraju pojačivači i utišivači

A

cis vezane promotore (one na istom kromosomu)

29
Q

kaj rade utišivači i pojačivači

A

aktiviraju korištenje promotora i time kontoliraju jačinu transkripciju

30
Q

kak nastaje Burkittov limfom

A

protoonkogen c-myc se translocira pored pojačivača za imunoglobin M pa se pretjerano prepisuje –> nastanak tumora

31
Q

trans regulatori su

A

specifični transkripcijski faktori koji se vežu na regulatorni dio DNA

32
Q

kakvi transkripcijski faktori postoje

A

specifični - aktiviraju se samo u određenim razdobljima i tkivima
bazalni - u svim stanicama, sudjeluju u samom procesu transkripcije

33
Q

dvije vrste trans regulatora

A

transkripcijski regulatorski aktivatori

transkripcijski regulatorski inhibitori

34
Q

di se vežu trans. reg. aktivatori

A

na sekvencu promotora

35
Q

gdi se sintetiziraju trans reg. aktivatori

A

u citoplazmi

36
Q

kak se dijele trans reg. aktivatori

A
cinkovi prsti
steroidni receptori
helix-turn-helix
helix-loop-helix
leucinski zatvarač
37
Q

između čega je smješten cinkov ion u cinkovim prstima

A

između dva cistina i histidina

38
Q

kakve regije moraju imati trans regulatori

A

regiju za vezivanje za DNA

regiju za vezivanje RNA polimeraze

39
Q

koji trans regulator kontrolira ekspresiju gena u embrionalnom razdoblju i određuje kranio-kaudalnu os

A

helix-turn helix

40
Q

ako nema helix-turn-helix transkripcijskog faktora onda može doći do

A

homeoze - zamjena jednog tijela drugim

41
Q

kako djeluju helix-loop-helix trans faktori

A

djeluju slično ko helix-turn-helix samo kaj djeluju ko dimeri (moraju biti dva povezana)

42
Q

kaj rade trans. regu. inhibitori

A

vezanjem za promotor inhibiraju ekspresiju gena

43
Q

kaj spada pod transkripcijsku kontrolu

A

promotori, utišivači, pojačivači