Regulacija ekspresije gena u eukariota I

Question 1

4 razine regulacije gena u eukariota

Answer 1

postreplikacijska, transkripcijska, posttranskripcijska i postranslacijska kontrola

Question 2

kaj je metilacija DNA

Answer 2

dodavanje metilne skupine na 5. C atom citozina

Question 3

od kud dolazi metilna skupina

Answer 3

iz molekule S-adenozin-L-metionin (SAM)

Question 4

kaj dodaje metilnu skupinu na DNA

Answer 4

DNA metiltransferaza (DNMT)

Question 5

koje su vrste DNMT

Answer 5

DNMT I

DNMT 3A i 3B

Question 6

kaj radi DNMT I

Answer 6

metilira drugi lanac u hemimetiliranoj DNA

Question 7

kaj radi DNMT 3A/3B

Answer 7

vrši de novo metilaciju (dakle nema afinitet prema hemimetiliranoj)

Question 8

primjer za metilaciju de novo

Answer 8

kod oplodnje gdje su jajna stanica i spermij potpuno demetilirani

Question 9

kaj je više metilirano, jajna stanica ili spermij

Answer 9

spermij (jajna stanica je gotovo nemetilirana)

Question 10

koji dijelovi DNA se najčešće metiliraju

Answer 10

.

Question 11

kaj se desi ako se u trudnoći konzumira puno donora metilne skupine

Answer 11

može se promijeniti ekspresija gena

Question 12

koje tvari sadrže puno metilnih skupina

Answer 12

folna kiselina, B vitamini

Question 13

metilacija kojeg gena kod miša može uzrokovati promijenu u njegovoj ekspresiji

Answer 13

agout gen

Question 14

kakav miš se razvija ako je agout gen metiliran

Answer 14

smeđe krzno
mršav
niska sklonost od razvitka dijabetesa

Question 15

kakav miš će nastati ako je agout gen nemetiliran

Answer 15

žuto krzno
debeo
sklon razvitku dijabetesa i raka

Question 16

kakvi su genetski miševi s nemetiliranim i metiliranim agout genom

Answer 16

identični (bez obzira što drugačije izgledaju i imaju drukčije karakteristike)

Question 17

metilacija opada/raste starenjem

Answer 17

opada

Question 18

koji su readersi kod metilacije

Answer 18

MBP (methyl-CpG- binding protein)

Question 19

kak djeluju MBP

Answer 19

1. privlače ostale epigenetske faktore

2. onemogućuju vezanje transkripcijskih faktora

Question 20

koji su eraseri kod metilacije

Answer 20

TET enzimi

Question 21

kaj rade TET enzimi kod metilacije

Answer 21

oksigeniraju metilnu skupinu: prvo u 5-hmC onda to u 5-fC i 5-caC

Question 22

kak se nazivaju baze kod metilacije

Answer 22

5-mC 5.baza
5-hmC 6. baza
5-fC 7. baza
5-caC 8. baza

Question 23

kaj spada pod postreplikacijsku regulaciju gena

Answer 23

metilacija DNA

Question 24

gdje se nalaze promotori

Answer 24

između regulatorske i kodirajuće regije

Question 25

silenceri i enhanceri spadaju pod

Answer 25

regulatore

Question 26

koji su cis regulatori

Answer 26

promotori, utišivači, pojačivači

Question 27

kak se određuje položaj promotora

Answer 27

DNA footprintom:
DNA fragment se označi radioaktivno, stavi se unutra DNAza i RNA polimeraza –> mjesto koje se ne razgradi označava mjesto vezanja RNA polimeraze aka mjesto promotora

Question 28

koje promotore aktiviraju pojačivači i utišivači

Answer 28

cis vezane promotore (one na istom kromosomu)

Question 29

kaj rade utišivači i pojačivači

Answer 29

aktiviraju korištenje promotora i time kontoliraju jačinu transkripciju

Question 30

kak nastaje Burkittov limfom

Answer 30

protoonkogen c-myc se translocira pored pojačivača za imunoglobin M pa se pretjerano prepisuje –> nastanak tumora

Question 31

trans regulatori su

Answer 31

specifični transkripcijski faktori koji se vežu na regulatorni dio DNA

Question 32

kakvi transkripcijski faktori postoje

Answer 32

specifični - aktiviraju se samo u određenim razdobljima i tkivima
bazalni - u svim stanicama, sudjeluju u samom procesu transkripcije

Question 33

dvije vrste trans regulatora

Answer 33

transkripcijski regulatorski aktivatori

transkripcijski regulatorski inhibitori

Question 34

di se vežu trans. reg. aktivatori

Answer 34

na sekvencu promotora

Question 35

gdi se sintetiziraju trans reg. aktivatori

Answer 35

u citoplazmi

Question 36

kak se dijele trans reg. aktivatori

Answer 36

cinkovi prsti
steroidni receptori
helix-turn-helix
helix-loop-helix
leucinski zatvarač

Question 37

između čega je smješten cinkov ion u cinkovim prstima

Answer 37

između dva cistina i histidina

Question 38

kakve regije moraju imati trans regulatori

Answer 38

regiju za vezivanje za DNA

regiju za vezivanje RNA polimeraze

Question 39

koji trans regulator kontrolira ekspresiju gena u embrionalnom razdoblju i određuje kranio-kaudalnu os

Answer 39

helix-turn helix

Question 40

ako nema helix-turn-helix transkripcijskog faktora onda može doći do

Answer 40

homeoze - zamjena jednog tijela drugim

Question 41

kako djeluju helix-loop-helix trans faktori

Answer 41

djeluju slično ko helix-turn-helix samo kaj djeluju ko dimeri (moraju biti dva povezana)

Question 42

kaj rade trans. regu. inhibitori

Answer 42

vezanjem za promotor inhibiraju ekspresiju gena

Question 43

kaj spada pod transkripcijsku kontrolu

Answer 43

promotori, utišivači, pojačivači